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Espressione differenziale di citochine, trascrittoma e miRNA nella malattia da coronavirus 2019 (COVID-19) Pazienti egiziani

10 ottobre 2020 aggiornato da: Mohammed Ali Ahmed Eid, Tanta University

Studi sull'espressione differenziale di citochine, trascrittoma e miRNA nel contesto dell'infezione da COVID-19 nella comunità egiziana

Lo scopo di questo sforzo è studiare l'interazione ospite-patogeno nei pazienti egiziani infetti da COVID-19. Gli investigatori eseguiranno schermate di miRNA e trascrittoma su tutto il genoma nei pazienti infetti insieme a quelli sani per il confronto. Tutti i tipi di citochine svolgono un ruolo fondamentale nell'immunità, comprese le risposte a diverse infezioni virali. Pertanto, gli investigatori studieranno il profilo delle citochine in risposta a tale infezione. Confrontando gli schermi del miRNA e del trascrittoma insieme ai profili delle citochine, potrebbe essere identificata un'importante molecola che potrebbe svolgere un ruolo nell'inibizione dell'epidemia di COVID-19. Inoltre, queste informazioni ci aiuteranno ad acquisire consapevolezza del processo immunitario e conoscere i geni coinvolti nella risposta immunitaria contro COVID-19 con particolare attenzione all'espressione delle citochine.

Panoramica dello studio

Stato

Sconosciuto

Descrizione dettagliata

I coronavirus sono un gruppo di virus che causano malattie nei mammiferi e negli uccelli. Negli esseri umani, i coronavirus causano infezioni del tratto respiratorio che possono essere lievi, come alcuni casi di comune raffreddore, e altri che possono essere letali, come la sindrome respiratoria acuta grave (SARS), (sindrome respiratoria mediorientale) MERS e COVID- 19. Contengono un genoma di RNA a filamento singolo a senso positivo. La dimensione del genoma varia da circa 27 a 34 kilobasi. Ha un cappuccio metilato 5' "leader 5', UTR", repliche/enzima trascrittasi, proteina spike (S), proteina busta (E), proteina membrana (M), proteina nucleocapside (N), regione 3'non tradotta (3 'UTR) e una coda poli (A), rispettivamente. La proteina S ha un ruolo importante nel suscitare l'immunità protettiva durante l'infezione da virus SARS-corona (SARS-CoV) inducendo anticorpi neutralizzanti e risposte delle cellule T. È anche la parte più mutata del genoma del coronavirus. Lo scopo di questo sforzo è studiare l'interazione ospite-patogeno nei pazienti egiziani infetti da COVID-19. Gli investigatori eseguiranno schermate di miRNA e trascrittoma su tutto il genoma nei pazienti infetti insieme a quelli sani per il confronto. Tutti i tipi di citochine svolgono un ruolo fondamentale nell'immunità, comprese le risposte a diverse infezioni virali. Pertanto, gli investigatori studieranno il profilo delle citochine in risposta a tale infezione. Confrontando gli schermi del miRNA e del trascrittoma insieme ai profili delle citochine, potrebbe essere identificata un'importante molecola, che potrebbe svolgere un ruolo nell'inibizione dell'epidemia di COVID-19. Inoltre, queste informazioni ci aiuteranno ad acquisire consapevolezza del processo immunitario e conoscere i geni coinvolti nella risposta immunitaria contro COVID-19 con particolare attenzione all'espressione delle citochine.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Anticipato)

40

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Luoghi di studio

    • El Gharbia
      • Tanta, El Gharbia, Egitto, 31527
    • Gharbia
      • Tanta, Gharbia, Egitto, 31527
        • Completato
        • Center of Excellence in Cancer Research, Tanta University Hospital.

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

Da 18 anni a 80 anni (Adulto, Adulto più anziano)

Accetta volontari sani

Sessi ammissibili allo studio

Tutto

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

Le analisi bioinformatiche e statistiche saranno condotte per differenziare l'espressione genica effettiva, l'espressione di miRNA e il profilo della tempesta di citochine tra pazienti COVID-19 gravi e lievi rispetto al controllo sanitario.

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • I pazienti COVID-19 confermati e i pazienti di età superiore ai 18 anni saranno presi in considerazione in questo progetto.

Criteri di esclusione:

  • Pazienti con più di una di queste malattie croniche; saranno esclusi diabete mellito, ipertensione, malattie cardiache e malattie del fegato di grado 2 e 3.

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
Sintomi gravi di COVID-19
I pazienti con sintomi gravi necessitano di ossigeno e ventilazione.
Emocromo completo (CBC), leucociti differenziali, D-dimero, proteina C-reattiva, test di reazione a catena della polimerasi (PCR), livello di ferritina, profilo delle citochine, analisi del trascrittoma, analisi del miRNA.
Sintomi lievi di COVID-19
Pazienti con sintomi moderati, come normali sintomi influenzali. Non hanno bisogno di ossigeno o ventilazione
Emocromo completo (CBC), leucociti differenziali, D-dimero, proteina C-reattiva, test di reazione a catena della polimerasi (PCR), livello di ferritina, profilo delle citochine, analisi del trascrittoma, analisi del miRNA.
Controllo sano
Gruppo sano senza alcuna infezione o sintomo.
Emocromo completo (CBC), leucociti differenziali, D-dimero, proteina C-reattiva, test di reazione a catena della polimerasi (PCR), livello di ferritina, profilo delle citochine, analisi del trascrittoma, analisi del miRNA.

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Profilo di espressione genica differenziale.
Lasso di tempo: 3 mesi
I ricercatori analizzeranno il profilo di espressione genica totale tra 15 gravi e 15 pazienti COVID-19 moderati rispetto a 10 sani utilizzando la tecnologia Affymetrix® Microarray. I dati grezzi di microarray per l'intero trascrittoma saranno estratti ed elaborati per l'analisi (circa 25000 geni) utilizzando diversi pacchetti software al fine di sezionare le espressioni differenziali che saranno correlate ai dati clinici; per esempio (CBC, valore D-dimero, valore ferritina…..ecc.).
3 mesi
Profilo di espressione differenziale del miRNA.
Lasso di tempo: 3 mesi
I ricercatori analizzeranno il profilo di espressione totale del miRNA tra 15 pazienti COVID-19 moderati e 15 gravi rispetto a 10 pazienti sani utilizzando la tecnologia Affymetrix® Microarray. I dati grezzi di microarray per l'espressione dell'intero miRNA saranno estratti ed elaborati per l'analisi utilizzando diversi pacchetti software al fine di sezionare le espressioni differenziali che saranno correlate ai dati clinici; per esempio (CBC, valore D-dimero, valore ferritina…..ecc.).
3 mesi
Saggio multiplex delle citochine
Lasso di tempo: 3 mesi
Questo test verrà eseguito sul plasma dei pazienti. Gli investigatori analizzeranno il diverso profilo di citochine tra 15 pazienti COVID-19 gravi e 15 moderati rispetto a 10 pazienti sani utilizzando la tecnologia xMAP (Multi-Analyte Profiling) e Luminex 200. I dati ottenuti saranno analizzati utilizzando un software statistico per studiare il diverso profilo tra i partecipanti selezionati. I dati ottenuti saranno anche correlati ai dati clinici; per esempio (CBC, valore D-dimero, valore ferritina…..ecc.).
3 mesi

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Investigatori

  • Investigatore principale: Mohammed Eid, Doctor, Botany and Microbiology Department, Faculty of Science, Tanta University Tanta

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

4 ottobre 2020

Completamento primario (Anticipato)

3 ottobre 2021

Completamento dello studio (Anticipato)

3 ottobre 2022

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

7 ottobre 2020

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

8 ottobre 2020

Primo Inserito (Effettivo)

12 ottobre 2020

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

14 ottobre 2020

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

10 ottobre 2020

Ultimo verificato

1 ottobre 2020

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

Prove cliniche su Infezione da coronavirus

Prove cliniche su Test diagnostici e di valutazione COVID-19

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