Ta strona została przetłumaczona automatycznie i dokładność tłumaczenia nie jest gwarantowana. Proszę odnieść się do angielska wersja za tekst źródłowy.

Różnicowa ekspresja cytokin, transkryptomu i miRNA w chorobie koronawirusowej 2019 (COVID-19) Pacjenci z Egiptu

10 października 2020 zaktualizowane przez: Mohammed Ali Ahmed Eid, Tanta University

Badania różnicowej ekspresji cytokin, transkryptomu i miRNA w kontekście zakażenia COVID-19 w społeczności egipskiej

Celem tego wysiłku jest zbadanie interakcji żywiciel-patogen u egipskich pacjentów zakażonych COVID-19. Badacze przeprowadzą badania przesiewowe miRNA i transkryptomu całego genomu u zakażonych pacjentów wraz ze zdrowymi w celu porównania. Wszystkie typy cytokin odgrywają kluczową rolę w odporności, w tym w odpowiedzi na różne infekcje wirusowe. Dlatego badacze będą badać profil cytokin w odpowiedzi na tę infekcję. Porównując ekrany miRNA i transkryptomu wraz z profilami cytokin, można zidentyfikować ważną cząsteczkę, która może odgrywać rolę w hamowaniu wybuchu COVID-19. Ponadto informacje te pomogą nam zdobyć świadomość procesu odpornościowego i poznać geny zaangażowane w odpowiedź immunologiczną przeciwko COVID-19, z naciskiem na ekspresję cytokin.

Przegląd badań

Status

Nieznany

Warunki

Interwencja / Leczenie

Szczegółowy opis

Koronawirusy to grupa wirusów wywołujących choroby u ssaków i ptaków. U ludzi koronawirusy powodują infekcje dróg oddechowych, które mogą być łagodne, takie jak niektóre przypadki przeziębienia, i inne, które mogą być śmiertelne, takie jak zespół ostrej ciężkiej niewydolności oddechowej (SARS), (bliskowschodni zespół oddechowy) MERS i COVID- 19. Zawierają jednoniciowy genom RNA o dodatnim sensie. Rozmiar genomu waha się od około 27 do 34 kilozasad. Ma 5' metylowaną czapeczkę „5' lider, UTR”, repliki / enzym transkryptazy, białko kolca (S), białko otoczki (E), białko błony (M), białko nukleokapsydu (N), region 3' nieulegający translacji (3 „UTR) i odpowiednio ogon poli (A). Białko S odgrywa główną rolę w wywoływaniu ochronnej odporności podczas zakażenia wirusem SARS-corona (SARS-CoV) poprzez indukowanie przeciwciał neutralizujących i odpowiedzi komórek T. Jest to również najbardziej zmutowana część genomu koronawirusa. Celem tego wysiłku jest zbadanie interakcji żywiciel-patogen u egipskich pacjentów zakażonych COVID-19. Badacze przeprowadzą badania przesiewowe miRNA i transkryptomu całego genomu u zakażonych pacjentów wraz ze zdrowymi w celu porównania. Wszystkie typy cytokin odgrywają kluczową rolę w odporności, w tym w odpowiedzi na różne infekcje wirusowe. Dlatego badacze będą badać profil cytokin w odpowiedzi na tę infekcję. Porównując ekrany miRNA i transkryptomu wraz z profilami cytokin, można zidentyfikować ważną cząsteczkę, która może odgrywać rolę w hamowaniu wybuchu COVID-19. Ponadto informacje te pomogą nam zdobyć świadomość procesu odpornościowego i poznać geny zaangażowane w odpowiedź immunologiczną przeciwko COVID-19, z naciskiem na ekspresję cytokin.

Typ studiów

Obserwacyjny

Zapisy (Oczekiwany)

40

Kontakty i lokalizacje

Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.

Lokalizacje studiów

  • Egipt
    • El Gharbia
      • Tanta, El Gharbia, Egipt, 31527
    • Gharbia
      • Tanta, Gharbia, Egipt, 31527
        • Zakończony
        • Center of Excellence in Cancer Research, Tanta University Hospital.

Kryteria uczestnictwa

Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.

Kryteria kwalifikacji

Wiek uprawniający do nauki

18 lat do 80 lat (Dorosły, Starszy dorosły)

Akceptuje zdrowych ochotników

Tak

Płeć kwalifikująca się do nauki

Wszystko

Metoda próbkowania

Próbka bez prawdopodobieństwa

Badana populacja

Zostaną przeprowadzone analizy bioinformatyczne i statystyczne w celu rozróżnienia rzeczywistej ekspresji genów, ekspresji miRNA i profilu burzy cytokinowej między pacjentami z ciężkim i łagodnym przebiegiem COVID-19 w porównaniu z grupą kontrolną.

Opis

Kryteria przyjęcia:

  • W tym projekcie zostaną uwzględnieni pacjenci z potwierdzonym COVID-19 oraz pacjenci w wieku powyżej 18 lat.

Kryteria wyłączenia:

  • Pacjenci z więcej niż jedną z tych chorób przewlekłych; cukrzyca, nadciśnienie tętnicze, choroby serca i wątroby stopnia 2 i 3 zostaną wykluczone.

Plan studiów

Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.

Jak projektuje się badanie?

Szczegóły projektu

Kohorty i interwencje

Grupa / Kohorta
Interwencja / Leczenie
Ciężkie objawy COVID-19
Pacjenci z ciężkimi objawami wymagają tlenu i wentylacji.
Genetyczny: Testy diagnostyczne i oceniające COVID-19
Pełna morfologia krwi (CBC), różnicowanie leukocytów, D-dimer, białko C-reaktywne, test reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR), poziom ferrytyny, profil cytokin, analiza transkryptomu, analiza miRNA.
Łagodne objawy COVID-19
Pacjenci z umiarkowanymi objawami, takimi jak normalne objawy grypy. Nie potrzebują tlenu ani wentylacji
Genetyczny: Testy diagnostyczne i oceniające COVID-19
Pełna morfologia krwi (CBC), różnicowanie leukocytów, D-dimer, białko C-reaktywne, test reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR), poziom ferrytyny, profil cytokin, analiza transkryptomu, analiza miRNA.
Kontroluj zdrowy
Zdrowa grupa bez jakiejkolwiek infekcji lub objawów.
Genetyczny: Testy diagnostyczne i oceniające COVID-19
Pełna morfologia krwi (CBC), różnicowanie leukocytów, D-dimer, białko C-reaktywne, test reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR), poziom ferrytyny, profil cytokin, analiza transkryptomu, analiza miRNA.

Co mierzy badanie?

Podstawowe miary wyniku

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Zróżnicowany profil ekspresji genów.
Ramy czasowe: 3 miesiące
Badacze przeanalizują całkowity profil ekspresji genów między 15 ciężkimi a 15 umiarkowanymi pacjentami z COVID-19 w porównaniu z 10 zdrowymi za pomocą technologii mikromacierzy Affymetrix®. Surowe dane z mikromacierzy dla całego transkryptomu zostaną wyodrębnione i przetworzone do analizy (około 25 000 genów) przy użyciu różnych pakietów oprogramowania w celu analizy zróżnicowanych ekspresji, które zostaną skorelowane z danymi klinicznymi; na przykład (CBC, wartość D-dimeru, wartość ferrytyny… itd.).
3 miesiące
Różnicowy profil ekspresji miRNA.
Ramy czasowe: 3 miesiące
Badacze przeanalizują całkowity profil ekspresji miRNA między 15 ciężkimi a 15 umiarkowanymi pacjentami z COVID-19 w porównaniu z 10 zdrowymi za pomocą technologii mikromacierzy Affymetrix®. Surowe dane z mikromacierzy dla ekspresji całego miRNA zostaną wyodrębnione i przetworzone do analizy przy użyciu różnych pakietów oprogramowania w celu przeanalizowania zróżnicowanych ekspresji, które zostaną skorelowane z danymi klinicznymi; na przykład (CBC, wartość D-dimeru, wartość ferrytyny… itd.).
3 miesiące
Multipleksowy test cytokin
Ramy czasowe: 3 miesiące
Ten test zostanie przeprowadzony na osoczu pacjentów. Badacze przeanalizują różne profile cytokin między 15 ciężkimi i 15 umiarkowanymi pacjentami z COVID-19 w porównaniu z 10 zdrowymi za pomocą technologii xMAP (Multi-Analyte Profiling) i Luminex 200. Uzyskane dane zostaną przeanalizowane za pomocą oprogramowania statystycznego w celu zbadania różnych profili wybranych uczestników. Uzyskane dane będą również skorelowane z danymi klinicznymi; na przykład (CBC, wartość D-dimeru, wartość ferrytyny… itd.).
3 miesiące

Współpracownicy i badacze

Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.

Sponsor

Tanta University

Śledczy

  • Główny śledczy: Mohammed Eid, Doctor, Botany and Microbiology Department, Faculty of Science, Tanta University Tanta

Daty zapisu na studia

Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.

Główne daty studiów

Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)

4 października 2020

Zakończenie podstawowe (Oczekiwany)

3 października 2021

Ukończenie studiów (Oczekiwany)

3 października 2022

Daty rejestracji na studia

Pierwszy przesłany

7 października 2020

Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości

8 października 2020

Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)

12 października 2020

Aktualizacje rekordów badań

Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)

14 października 2020

Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości

10 października 2020

Ostatnia weryfikacja

1 października 2020

Więcej informacji

Terminy związane z tym badaniem

Słowa kluczowe

Dodatkowe istotne warunki MeSH

Inne numery identyfikacyjne badania

  • CTM_COVID-19

Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze

Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .

Subskrybuj