Дифференциальная экспрессия цитокинов, транскриптома и микроРНК у пациентов с коронавирусной болезнью 2019 (COVID-19) в Египте
10 октября 2020 г. обновлено: Mohammed Ali Ahmed Eid, Tanta University
Исследования дифференциальной экспрессии цитокинов, транскриптома и микроРНК в контексте инфекции COVID-19 в египетском сообществе
Целью этих усилий является изучение взаимодействия хозяина и патогена у египетских пациентов, инфицированных COVID-19.
Исследователи проведут полногеномный скрининг микроРНК и транскриптома у инфицированных пациентов, а также у здоровых для сравнения.
Все типы цитокинов играют ключевую роль в иммунитете, в том числе в ответах на различные вирусные инфекции.
Поэтому исследователи будут изучать профиль цитокинов в ответ на эту инфекцию.
Сравнивая скрининг микроРНК и транскриптома, а также профили цитокинов, можно определить важную молекулу, которая может играть роль в подавлении вспышки COVID-19.
Кроме того, эта информация поможет нам лучше понять иммунный процесс и узнать о генах, участвующих в иммунном ответе против COVID-19, с акцентом на экспрессию цитокинов.
Обзор исследования
Статус
Неизвестный
Условия
Вмешательство/лечение
Подробное описание
Коронавирусы — это группа вирусов, вызывающих заболевания у млекопитающих и птиц.
У людей коронавирусы вызывают инфекции дыхательных путей, которые могут быть легкими, например, некоторые случаи простуды, и другие, которые могут быть смертельными, такие как тяжелый острый респираторный синдром (ТОРС), (ближневосточный респираторный синдром) MERS и COVID-19. 19.
Они содержат одноцепочечный геном РНК с положительным смыслом.
Размер генома колеблется примерно от 27 до 34 килобаз.
Он имеет 5'-метилированный кэп "5'лидер, UTR", фермент реплики/транскриптазу, шиповидный (S) белок, оболочечный (E) белок, мембранный (M) белок, нуклеокапсидный (N) белок, 3'-нетранслируемую область (3 'UTR) и поли(А)-хвост соответственно.
Белок S играет важную роль в обеспечении защитного иммунитета при заражении коронавирусом SARS (SARS-CoV), индуцируя нейтрализующие антитела и Т-клеточный ответ.
Это также наиболее мутированная часть генома коронавируса.
Целью этих усилий является изучение взаимодействия хозяина и патогена у египетских пациентов, инфицированных COVID-19.
Исследователи проведут полногеномный скрининг микроРНК и транскриптома у инфицированных пациентов, а также у здоровых для сравнения.
Все типы цитокинов играют ключевую роль в иммунитете, в том числе в ответах на различные вирусные инфекции.
Поэтому исследователи будут изучать профиль цитокинов в ответ на эту инфекцию.
Путем сравнения скрининга микроРНК и транскриптома, а также профилей цитокинов может быть идентифицирована важная молекула, которая может играть роль в подавлении вспышки COVID-19.
Кроме того, эта информация поможет нам лучше понять иммунный процесс и узнать о генах, участвующих в иммунном ответе против COVID-19, с акцентом на экспрессию цитокинов.
Тип исследования
Наблюдательный
Регистрация (Ожидаемый)
40
Контакты и местонахождение
В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.
Места учебы
-
-
El Gharbia
-
Tanta, El Gharbia, Египет, 31527
- Рекрутинг
- Tanta University Hospital
-
Контакт:
- Mohammed Hanteera, Professor
- Номер телефона: +201141146700
- Электронная почта: mohamed.hantera@med.tanta.edu.eg
-
-
Gharbia
-
Tanta, Gharbia, Египет, 31527
- Завершенный
- Center of Excellence in Cancer Research, Tanta University Hospital.
-
-
Критерии участия
Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
От 18 лет до 80 лет (Взрослый, Пожилой взрослый)
Принимает здоровых добровольцев
Да
Полы, имеющие право на обучение
Все
Метод выборки
Невероятностная выборка
Исследуемая популяция
Биоинформатика и статистический анализ будут проведены для дифференциации фактической экспрессии генов, экспрессии микроРНК и профиля цитокинового шторма у пациентов с тяжелым и легким течением COVID-19 по сравнению с контролем состояния здоровья.
Описание
Критерии включения:
- В этом проекте будут рассматриваться пациенты с подтвержденным диагнозом COVID-19 и пациенты старше 18 лет.
Критерий исключения:
- Пациенты с более чем одним из этих хронических заболеваний; сахарный диабет, гипертония, болезни сердца и печени 2 и 3 степени будут исключены.
Учебный план
В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
COVID-19 тяжелые симптомы
Пациенты с тяжелыми симптомами нуждаются в кислороде и вентиляции легких.
|
Общий анализ крови (CBC), дифференциальный анализ лейкоцитов, D-димер, С-реактивный белок, тест полимеразной цепной реакции (ПЦР), уровень ферритина, профиль цитокинов, анализ транскриптома, анализ микроРНК.
|
|
Легкие симптомы COVID-19
Пациенты с умеренными симптомами, как обычные симптомы гриппа.
Им не нужен кислород или вентиляция.
|
Общий анализ крови (CBC), дифференциальный анализ лейкоцитов, D-димер, С-реактивный белок, тест полимеразной цепной реакции (ПЦР), уровень ферритина, профиль цитокинов, анализ транскриптома, анализ микроРНК.
|
|
Здоровый контроль
Здоровая группа без какой-либо инфекции или симптомов.
|
Общий анализ крови (CBC), дифференциальный анализ лейкоцитов, D-димер, С-реактивный белок, тест полимеразной цепной реакции (ПЦР), уровень ферритина, профиль цитокинов, анализ транскриптома, анализ микроРНК.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Дифференциальный профиль экспрессии генов.
Временное ограничение: 3 месяца
|
Исследователи проанализируют общий профиль экспрессии генов между 15 тяжелыми и 15 умеренными пациентами с COVID-19 по сравнению с 10 здоровыми с использованием технологии Affymetrix® Microarray.
Необработанные данные микрочипов для всего транскриптома будут извлечены и обработаны для анализа (около 25 000 генов) с использованием различных пакетов программного обеспечения для анализа дифференциальных выражений, которые будут коррелировать с клиническими данными; например (CBC, значение D-димера, значение ферритина…..и т.д.).
|
3 месяца
|
|
Дифференциальный профиль экспрессии микроРНК.
Временное ограничение: 3 месяца
|
Исследователи проанализируют общий профиль экспрессии микроРНК у 15 пациентов с тяжелым и 15 умеренным течением COVID-19 по сравнению с 10 здоровыми с использованием технологии Affymetrix® Microarray.
Необработанные данные микрочипа для полной экспрессии микроРНК будут извлечены и обработаны для анализа с использованием различных пакетов программного обеспечения, чтобы проанализировать дифференциальные экспрессии, которые будут коррелировать с клиническими данными; например (CBC, значение D-димера, значение ферритина…..и т.д.).
|
3 месяца
|
|
Мультиплексный цитокиновый анализ
Временное ограничение: 3 месяца
|
Этот анализ будет проводиться на плазме пациентов.
Исследователи проанализируют различные цитокиновые профили у 15 пациентов с тяжелым и 15 умеренным течением COVID-19 по сравнению с 10 здоровыми пациентами, используя технологию xMAP (Multi-Analyte Profiling) и Luminex 200.
Полученные данные будут проанализированы с использованием статистического программного обеспечения для изучения различных профилей между выбранными участниками.
Полученные данные также будут соотнесены с клиническими данными; например (CBC, значение D-димера, значение ферритина…..и т.д.).
|
3 месяца
|
Соавторы и исследователи
Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.
Спонсор
Следователи
- Главный следователь: Mohammed Eid, Doctor, Botany and Microbiology Department, Faculty of Science, Tanta University Tanta
Даты записи исследования
Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
4 октября 2020 г.
Первичное завершение (Ожидаемый)
3 октября 2021 г.
Завершение исследования (Ожидаемый)
3 октября 2022 г.
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
7 октября 2020 г.
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
8 октября 2020 г.
Первый опубликованный (Действительный)
12 октября 2020 г.
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
14 октября 2020 г.
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
10 октября 2020 г.
Последняя проверка
1 октября 2020 г.
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- CTM_COVID-19
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Нет
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Нет
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .