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Differenzielle Expression von Zytokinen, Transkriptom und miRNA bei ägyptischen Patienten mit Coronavirus-Krankheit 2019 (COVID-19).

10. Oktober 2020 aktualisiert von: Mohammed Ali Ahmed Eid, Tanta University

Studien zur unterschiedlichen Expression von Zytokinen, Transkriptomen und miRNA im Kontext einer COVID-19-Infektion in der ägyptischen Gemeinschaft

Ziel dieser Bemühungen ist die Untersuchung der Wirt-Pathogen-Interaktion bei ägyptischen Patienten, die mit COVID-19 infiziert sind. Die Forscher werden genomweite miRNA- und Transkriptom-Screens bei den infizierten Patienten zusammen mit gesunden Patienten zum Vergleich durchführen. Alle Arten von Zytokinen spielen eine zentrale Rolle bei der Immunität, einschließlich der Reaktionen auf verschiedene Virusinfektionen. Daher werden die Forscher das Zytokinprofil als Reaktion auf diese Infektion untersuchen. Durch den Vergleich von miRNA- und Transkriptom-Screenings mit Zytokinprofilen könnte ein wichtiges Molekül identifiziert werden, das bei der Hemmung des COVID-19-Ausbruchs eine Rolle spielen könnte. Darüber hinaus werden uns diese Informationen dabei helfen, ein Bewusstsein für den Immunprozess zu entwickeln und mehr über die Gene zu erfahren, die an der Immunantwort gegen COVID-19 beteiligt sind, wobei der Schwerpunkt auf der Expression von Zytokinen liegt.

Studienübersicht

Status

Unbekannt

Bedingungen

Intervention / Behandlung

Detaillierte Beschreibung

Coronaviren sind eine Gruppe von Viren, die bei Säugetieren und Vögeln Krankheiten verursachen. Beim Menschen verursachen Coronaviren Infektionen der Atemwege, die leicht verlaufen können, wie z. B. einige Fälle von Erkältungen, und andere, die tödlich sein können, wie z. B. das schwere akute respiratorische Syndrom (SARS), MERS (Middle East Respiratory Syndrome) und COVID-19. 19. Sie enthalten ein einzelsträngiges RNA-Genom mit positivem Sinn. Die Genomgröße reicht von etwa 27 bis 34 Kilobasen. Es verfügt über eine 5'-methylierte Kappe „5'leader, UTR“, Replikate/Transkriptase-Enzym, Spike (S)-Protein, Hüllprotein (E), Membranprotein (M), Nukleokapsidprotein (N), 3'-untranslatierte Region (3 'UTR) bzw. einen Poly(A)-Schwanz. Das S-Protein spielt eine wichtige Rolle bei der Auslösung der schützenden Immunität während einer Infektion mit dem SARS-Coronavirus (SARS-CoV), indem es neutralisierende Antikörper und T-Zell-Reaktionen induziert. Es ist auch der am stärksten mutierte Teil des Coronavirus-Genoms. Ziel dieser Bemühungen ist die Untersuchung der Wirt-Pathogen-Interaktion bei ägyptischen Patienten, die mit COVID-19 infiziert sind. Die Forscher werden genomweite miRNA- und Transkriptom-Screens bei den infizierten Patienten zusammen mit gesunden Patienten zum Vergleich durchführen. Alle Arten von Zytokinen spielen eine zentrale Rolle bei der Immunität, einschließlich der Reaktionen auf verschiedene Virusinfektionen. Daher werden die Forscher das Zytokinprofil als Reaktion auf diese Infektion untersuchen. Durch den Vergleich von miRNA- und Transkriptom-Screenings mit Zytokinprofilen könnte ein wichtiges Molekül identifiziert werden, das bei der Hemmung des COVID-19-Ausbruchs eine Rolle spielen könnte. Darüber hinaus werden uns diese Informationen dabei helfen, ein Bewusstsein für den Immunprozess zu entwickeln und mehr über die Gene zu erfahren, die an der Immunantwort gegen COVID-19 beteiligt sind, wobei der Schwerpunkt auf der Expression von Zytokinen liegt.

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Voraussichtlich)

40

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienorte

  • Ägypten
    • El Gharbia
      • Tanta, El Gharbia, Ägypten, 31527
    • Gharbia
      • Tanta, Gharbia, Ägypten, 31527
        • Abgeschlossen
        • Center of Excellence in Cancer Research, Tanta University Hospital.

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

18 Jahre bis 80 Jahre (Erwachsene, Älterer Erwachsener)

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Ja

Studienberechtigte Geschlechter

Alle

Probenahmeverfahren

Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

Studienpopulation

Die bioinformatischen und statistischen Analysen werden durchgeführt, um die tatsächliche Genexpression, miRNA-Expression und das Zytokinsturmprofil zwischen schweren und milden COVID-19-Patienten im Vergleich zur Gesundheitskontrolle zu unterscheiden.

Beschreibung

Einschlusskriterien:

  • Bestätigte COVID-19-Patienten und Patienten über 18 Jahren werden in diesem Projekt berücksichtigt.

Ausschlusskriterien:

  • Patienten mit mehr als einer dieser chronischen Erkrankungen; Diabetes mellitus, Bluthochdruck, Herzerkrankungen und Lebererkrankungen Grad 2 und 3 werden ausgeschlossen.

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

Kohorten und Interventionen

Gruppe / Kohorte
Intervention / Behandlung
Schwere COVID-19-Symptome
Patienten mit schweren Symptomen benötigen Sauerstoff und Beatmung.
Genetisch: COVID-19-Diagnose- und Beurteilungstests
Komplettes Blutbild (CBC), differenzielle Leukozyten, D-Dimer, C-reaktives Protein, Polymerase-Kettenreaktionstest (PCR), Ferritinspiegel, Zytokinprofil, Transkriptomanalyse, miRNA-Analyse.
Leichte Symptome von COVID-19
Patienten mit mäßigen Symptomen, wie normale Grippesymptome. Sie benötigen weder Sauerstoff noch Belüftung
Genetisch: COVID-19-Diagnose- und Beurteilungstests
Komplettes Blutbild (CBC), differenzielle Leukozyten, D-Dimer, C-reaktives Protein, Polymerase-Kettenreaktionstest (PCR), Ferritinspiegel, Zytokinprofil, Transkriptomanalyse, miRNA-Analyse.
Gesund kontrollieren
Gesunde Gruppe ohne Infektion oder Symptome.
Genetisch: COVID-19-Diagnose- und Beurteilungstests
Komplettes Blutbild (CBC), differenzielle Leukozyten, D-Dimer, C-reaktives Protein, Polymerase-Kettenreaktionstest (PCR), Ferritinspiegel, Zytokinprofil, Transkriptomanalyse, miRNA-Analyse.

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Differenzielles Genexpressionsprofil.
Zeitfenster: 3 Monate
Die Forscher werden das gesamte Genexpressionsprofil zwischen 15 Patienten mit schwerem und 15 mittelschwerem COVID-19 im Vergleich zu 10 Patienten mit Gesundheitszustand analysieren, indem sie die Affymetrix® Microarray-Technologie verwenden. Microarray-Rohdaten für das gesamte Transkriptom werden extrahiert und zur Analyse (ca. 25.000 Gene) mithilfe verschiedener Softwarepakete verarbeitet, um die differentiellen Ausdrücke zu analysieren, die mit den klinischen Daten korreliert werden. zum Beispiel (CBC, D-Dimer-Wert, Ferritin-Wert usw.).
3 Monate
Differenzielles miRNA-Expressionsprofil.
Zeitfenster: 3 Monate
Die Forscher werden das gesamte miRNA-Expressionsprofil zwischen 15 schweren und 15 mittelschweren COVID-19-Patienten im Vergleich zu 10 gesunden Patienten mithilfe der Affymetrix® Microarray-Technologie analysieren. Microarray-Rohdaten für die gesamte miRNA-Expression werden extrahiert und zur Analyse mithilfe verschiedener Softwarepakete verarbeitet, um die differentiellen Ausdrücke zu analysieren, die mit den klinischen Daten korreliert werden. zum Beispiel (CBC, D-Dimer-Wert, Ferritin-Wert usw.).
3 Monate
Multiplex-Zytokin-Assay
Zeitfenster: 3 Monate
Dieser Test wird am Plasma von Patienten durchgeführt. Die Forscher werden das unterschiedliche Zytokinprofil zwischen 15 Patienten mit schwerem und 15 mittelschwerem COVID-19 im Vergleich zu 10 Patienten mit Gesundheitszustand analysieren, indem sie die xMAP-Technologie (Multi-Analyte Profiling) und Luminex 200 verwenden. Die erhaltenen Daten werden mithilfe einer Statistiksoftware analysiert, um die unterschiedlichen Profile zwischen den ausgewählten Teilnehmern zu untersuchen. Die erhaltenen Daten werden auch mit den klinischen Daten korreliert; zum Beispiel (CBC, D-Dimer-Wert, Ferritin-Wert usw.).
3 Monate

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Sponsor

Tanta University

Ermittler

  • Hauptermittler: Mohammed Eid, Doctor, Botany and Microbiology Department, Faculty of Science, Tanta University Tanta

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

4. Oktober 2020

Primärer Abschluss (Voraussichtlich)

3. Oktober 2021

Studienabschluss (Voraussichtlich)

3. Oktober 2022

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

7. Oktober 2020

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

8. Oktober 2020

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

12. Oktober 2020

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

14. Oktober 2020

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

10. Oktober 2020

Zuletzt verifiziert

1. Oktober 2020

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Schlüsselwörter

Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen

Andere Studien-ID-Nummern

  • CTM_COVID-19

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Nein

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

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