Expression différentielle des cytokines, du transcriptome et des miARN chez les patients égyptiens atteints de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19)
10 octobre 2020 mis à jour par: Mohammed Ali Ahmed Eid, Tanta University
Études sur l'expression différentielle des cytokines, du transcriptome et des miARN dans le contexte de l'infection au COVID-19 dans la communauté égyptienne
Le but de cet effort est d'étudier l'interaction hôte-pathogène chez les patients égyptiens infectés par le COVID-19.
Les enquêteurs effectueront des criblages de miARN et de transcriptome à l'échelle du génome chez les patients infectés ainsi que chez les patients sains à des fins de comparaison.
Tous les types de cytokines jouent un rôle central dans l'immunité, y compris les réponses à différentes infections virales.
Par conséquent, les enquêteurs étudieront le profil des cytokines en réponse à cette infection.
En comparant les écrans de miARN et de transcriptome ainsi que les profils de cytokines, une molécule importante pourrait être identifiée qui pourrait jouer un rôle dans l'inhibition de l'épidémie de COVID-19.
De plus, ces informations nous aideront à prendre conscience du processus immunitaire et à connaître les gènes impliqués dans la réponse immunitaire contre le COVID-19 en mettant l'accent sur l'expression des cytokines.
Aperçu de l'étude
Statut
Inconnue
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
Les coronavirus sont un groupe de virus qui causent des maladies chez les mammifères et les oiseaux.
Chez l'homme, les coronavirus provoquent des infections des voies respiratoires qui peuvent être bénignes, comme certains cas de rhume, et d'autres qui peuvent être mortelles, comme le syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS), le MERS (syndrome respiratoire du Moyen-Orient) et le COVID- 19.
Ils contiennent un génome d'ARN simple brin de sens positif.
La taille du génome varie d'environ 27 à 34 kilobases.
Il a une coiffe méthylée en 5' "5'leader, UTR", une enzyme répliques/transcriptase, une protéine de pointe (S), une protéine d'enveloppe (E), une protéine de membrane (M), une protéine de nucléocapside (N), une région 3' non traduite (3 'UTR) et une queue poly (A), respectivement.
La protéine S joue un rôle majeur dans la stimulation de l'immunité protectrice lors de l'infection par le virus corona du SRAS (SRAS-CoV) en induisant des anticorps neutralisants et des réponses des lymphocytes T.
C'est aussi la partie la plus mutée du génome du coronavirus.
Le but de cet effort est d'étudier l'interaction hôte-pathogène chez les patients égyptiens infectés par le COVID-19.
Les enquêteurs effectueront des criblages de miARN et de transcriptome à l'échelle du génome chez les patients infectés ainsi que chez les patients sains à des fins de comparaison.
Tous les types de cytokines jouent un rôle central dans l'immunité, y compris les réponses à différentes infections virales.
Par conséquent, les enquêteurs étudieront le profil des cytokines en réponse à cette infection.
En comparant les écrans de miARN et de transcriptome ainsi que les profils de cytokines, une molécule importante pourrait être identifiée, qui pourrait jouer un rôle dans l'inhibition de l'épidémie de COVID-19.
De plus, ces informations nous aideront à prendre conscience du processus immunitaire et à connaître les gènes impliqués dans la réponse immunitaire contre le COVID-19 en mettant l'accent sur l'expression des cytokines.
Type d'étude
Observationnel
Inscription (Anticipé)
40
Contacts et emplacements
Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.
Lieux d'étude
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El Gharbia
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Tanta, El Gharbia, Egypte, 31527
- Recrutement
- Tanta University Hospital
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Contact:
- Mohammed Hanteera, Professor
- Numéro de téléphone: +201141146700
- E-mail: mohamed.hantera@med.tanta.edu.eg
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Gharbia
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Tanta, Gharbia, Egypte, 31527
- Complété
- Center of Excellence in Cancer Research, Tanta University Hospital.
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Critères de participation
Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
18 ans à 80 ans (Adulte, Adulte plus âgé)
Accepte les volontaires sains
Oui
Sexes éligibles pour l'étude
Tout
Méthode d'échantillonnage
Échantillon non probabiliste
Population étudiée
Les analyses bioinformatiques et statistiques seront effectuées pour différencier l'expression réelle des gènes, l'expression des miARN et le profil de tempête de cytokines entre les patients COVID-19 graves et légers par rapport au contrôle de la santé.
La description
Critère d'intégration:
- Les patients COVID-19 confirmés et les patients âgés de plus de 18 ans seront pris en compte dans ce projet.
Critère d'exclusion:
- Les patients atteints de plus d'une de ces maladies chroniques ; le diabète sucré, l'hypertension, les maladies cardiaques et les maladies du foie de grade 2 et 3 seront exclus.
Plan d'étude
Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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Symptômes graves de la COVID-19
Les patients présentant des symptômes graves ont besoin d'oxygène et de ventilation.
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Numération sanguine complète (CBC), leucocytes différentiels, D-dimères, protéine C-réactive, test de réaction en chaîne par polymérase (PCR), niveau de ferritine, profil des cytokines, analyse du transcriptome, analyse des miARN.
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Symptômes bénins de la COVID-19
Les patients présentant des symptômes modérés, comme les symptômes normaux de la grippe.
Ils n'ont pas besoin d'oxygène ou de ventilation
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Numération sanguine complète (CBC), leucocytes différentiels, D-dimères, protéine C-réactive, test de réaction en chaîne par polymérase (PCR), niveau de ferritine, profil des cytokines, analyse du transcriptome, analyse des miARN.
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Contrôle sain
Groupe sain sans aucune infection ou symptôme.
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Numération sanguine complète (CBC), leucocytes différentiels, D-dimères, protéine C-réactive, test de réaction en chaîne par polymérase (PCR), niveau de ferritine, profil des cytokines, analyse du transcriptome, analyse des miARN.
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Profil d'expression génique différentiel.
Délai: 3 mois
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Les enquêteurs analyseront le profil d'expression génique total entre 15 patients atteints de COVID-19 sévères et 15 patients modérés atteints de COVID-19 par rapport à 10 patients en bonne santé en utilisant la technologie Affymetrix® Microarray.
Les données brutes de la puce à ADN pour le transcriptome entier seront extraites et traitées pour analyse (environ 25 000 gènes) à l'aide de différents progiciels afin de disséquer les expressions différentielles qui seront corrélées aux données cliniques ; par exemple (CBC, indice de D-dimères, indice de ferritine…..etc.).
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3 mois
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Profil d'expression différentielle des miARN.
Délai: 3 mois
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Les chercheurs analyseront le profil d'expression total des miARN entre 15 patients atteints de COVID-19 sévères et 15 patients modérés atteints de COVID-19 par rapport à 10 patients en bonne santé en utilisant la technologie Affymetrix® Microarray.
Les données brutes de la micropuce pour l'expression entière des miARN seront extraites et traitées pour analyse à l'aide de différents progiciels afin de disséquer les expressions différentielles qui seront corrélées aux données cliniques ; par exemple (CBC, indice de D-dimères, indice de ferritine…..etc.).
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3 mois
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Dosage multiplex des cytokines
Délai: 3 mois
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Ce dosage se fera sur plasma de patients.
Les chercheurs analyseront les différents profils de cytokines entre 15 patients atteints de COVID-19 sévères et 15 patients modérés par rapport à 10 patients en bonne santé en utilisant la technologie xMAP (Multi-Analyte Profiling) et Luminex 200.
Les données obtenues seront analysées à l'aide d'un logiciel statistique pour étudier les différents profils entre les participants sélectionnés.
Les données obtenues seront également corrélées aux données cliniques ; par exemple (CBC, indice de D-dimères, indice de ferritine…..etc.).
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3 mois
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Collaborateurs et enquêteurs
C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.
Parrainer
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Mohammed Eid, Doctor, Botany and Microbiology Department, Faculty of Science, Tanta University Tanta
Dates d'enregistrement des études
Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
4 octobre 2020
Achèvement primaire (Anticipé)
3 octobre 2021
Achèvement de l'étude (Anticipé)
3 octobre 2022
Dates d'inscription aux études
Première soumission
7 octobre 2020
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
8 octobre 2020
Première publication (Réel)
12 octobre 2020
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
14 octobre 2020
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
10 octobre 2020
Dernière vérification
1 octobre 2020
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- CTM_COVID-19
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Non
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
Non
Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .