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Expressão diferencial de citocinas, transcriptoma e miRNA em pacientes egípcios com doença de coronavírus 2019 (COVID-19)

10 de outubro de 2020 atualizado por: Mohammed Ali Ahmed Eid, Tanta University

Estudos sobre a expressão diferencial de citocinas, transcriptoma e miRNA no contexto da infecção por COVID-19 na comunidade egípcia

O objetivo deste esforço é estudar a interação hospedeiro-patógeno em pacientes egípcios infectados com COVID-19. Os investigadores realizarão telas de miRNA e transcriptoma em todo o genoma nos pacientes infectados junto com os saudáveis ​​para comparação. Todos os tipos de citocinas desempenham papéis fundamentais na imunidade, incluindo as respostas a diferentes infecções virais. Portanto, os investigadores estudarão o perfil de citocinas em resposta a essa infecção. Ao comparar as telas de miRNA e transcriptoma juntamente com os perfis de citocinas, uma molécula importante pode ser identificada e pode desempenhar um papel na inibição do surto de COVID-19. Além disso, essas informações nos ajudarão a conhecer o processo imunológico e conhecer os genes envolvidos na resposta imune contra o COVID-19 com ênfase na expressão de citocinas.

Visão geral do estudo

Status

Desconhecido

Descrição detalhada

Os coronavírus são um grupo de vírus que causam doenças em mamíferos e aves. Em humanos, os coronavírus causam infecções do trato respiratório que podem ser leves, como alguns casos de resfriado comum, e outras que podem ser letais, como síndrome respiratória aguda grave (SARS), (síndrome respiratória do Oriente Médio) MERS e COVID- 19. Eles contêm um genoma de RNA de cadeia simples de sentido positivo. O tamanho do genoma varia de aproximadamente 27 a 34 quilobases. Possui um cap 5' metilado "5'leader, UTR", réplicas/enzima transcriptase, proteína spike (S), proteína envelope (E), proteína membrana (M), proteína nucleocapsídeo (N), região 3' não traduzida (3 'UTR) e uma cauda poli (A), respectivamente. A proteína S tem um papel importante na obtenção da imunidade protetora durante a infecção pelo vírus SARS-corona (SARS-CoV), induzindo anticorpos neutralizantes e respostas de células T. É também a parte mais mutante do genoma do coronavírus. O objetivo deste esforço é estudar a interação hospedeiro-patógeno em pacientes egípcios infectados com COVID-19. Os investigadores realizarão telas de miRNA e transcriptoma em todo o genoma nos pacientes infectados junto com os saudáveis ​​para comparação. Todos os tipos de citocinas desempenham papéis fundamentais na imunidade, incluindo as respostas a diferentes infecções virais. Portanto, os investigadores estudarão o perfil de citocinas em resposta a essa infecção. Ao comparar as telas de miRNA e transcriptoma juntamente com os perfis de citocinas, uma molécula importante pode ser identificada, o que pode desempenhar um papel na inibição do surto de COVID-19. Além disso, essas informações nos ajudarão a conhecer o processo imunológico e conhecer os genes envolvidos na resposta imune contra o COVID-19 com ênfase na expressão de citocinas.

Tipo de estudo

Observacional

Inscrição (Antecipado)

40

Contactos e Locais

Esta seção fornece os detalhes de contato para aqueles que conduzem o estudo e informações sobre onde este estudo está sendo realizado.

Locais de estudo

    • El Gharbia
      • Tanta, El Gharbia, Egito, 31527
    • Gharbia
      • Tanta, Gharbia, Egito, 31527
        • Concluído
        • Center of Excellence in Cancer Research, Tanta University Hospital.

Critérios de participação

Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.

Critérios de elegibilidade

Idades elegíveis para estudo

18 anos a 80 anos (Adulto, Adulto mais velho)

Aceita Voluntários Saudáveis

Sim

Gêneros Elegíveis para o Estudo

Tudo

Método de amostragem

Amostra Não Probabilística

População do estudo

A bioinformática e as análises estatísticas serão feitas para diferenciar a expressão real do gene, a expressão do miRNA e o perfil da tempestade de citocinas entre pacientes com COVID-19 grave e leve em comparação com o controle de saúde.

Descrição

Critério de inclusão:

  • Pacientes confirmados com COVID-19 e pacientes com idade acima de 18 anos serão considerados neste projeto.

Critério de exclusão:

  • Pacientes com mais de uma dessas doenças crônicas; diabetes mellitus, hipertensão, doenças cardíacas e doenças hepáticas graus 2 e 3 serão excluídas.

Plano de estudo

Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.

Como o estudo é projetado?

Detalhes do projeto

Coortes e Intervenções

Grupo / Coorte
Intervenção / Tratamento
Sintomas graves de COVID-19
Pacientes com sintomas graves precisam de oxigênio e ventilação.
Hemograma completo (CBC), leucócitos diferenciais, dímero D, proteína C reativa, teste de reação em cadeia da polimerase (PCR), nível de ferritina, perfil de citocinas, análise de transcriptoma, análise de miRNA.
Sintomas leves de COVID-19
Pacientes com sintomas moderados, como sintomas normais de gripe. Eles não precisam de oxigênio ou ventilação
Hemograma completo (CBC), leucócitos diferenciais, dímero D, proteína C reativa, teste de reação em cadeia da polimerase (PCR), nível de ferritina, perfil de citocinas, análise de transcriptoma, análise de miRNA.
Controle Saudável
Grupo saudável sem qualquer infecção ou sintomas.
Hemograma completo (CBC), leucócitos diferenciais, dímero D, proteína C reativa, teste de reação em cadeia da polimerase (PCR), nível de ferritina, perfil de citocinas, análise de transcriptoma, análise de miRNA.

O que o estudo está medindo?

Medidas de resultados primários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Perfil diferencial de expressão gênica.
Prazo: 3 meses
Os investigadores analisarão o perfil total de expressão gênica entre 15 pacientes graves e 15 moderados com COVID-19 em comparação com 10 saudáveis ​​usando a tecnologia Affymetrix® Microarray. Dados brutos de microarray para transcriptoma completo serão extraídos e processados ​​para análise (cerca de 25.000 genes) usando diferentes pacotes de software para dissecar as expressões diferenciais que serão correlacionadas aos dados clínicos; por exemplo (hemograma, valor do dímero D, valor da ferritina…..etc.).
3 meses
Perfil de expressão diferencial de miRNA.
Prazo: 3 meses
Os investigadores analisarão o perfil total de expressão de miRNA entre 15 pacientes graves e 15 moderados com COVID-19 em comparação com 10 saudáveis ​​usando a tecnologia Affymetrix® Microarray. Dados brutos de microarray para expressão de miRNA total serão extraídos e processados ​​para análise usando diferentes pacotes de software para dissecar as expressões diferenciais que serão correlacionadas com os dados clínicos; por exemplo (hemograma, valor do dímero D, valor da ferritina…..etc.).
3 meses
Ensaio Multiplex de Citocina
Prazo: 3 meses
Este ensaio será feito no plasma dos pacientes. Os investigadores analisarão o perfil diferente de citocinas entre 15 pacientes graves e 15 moderados com COVID-19 em comparação com 10 saudáveis ​​usando a tecnologia xMAP (Multi-Analyte Profiling) e Luminex 200. Os dados obtidos serão analisados ​​por meio de software estatístico para estudar o perfil diferenciado entre os participantes selecionados. Os dados obtidos também serão correlacionados com os dados clínicos; por exemplo (hemograma, valor do dímero D, valor da ferritina…..etc.).
3 meses

Colaboradores e Investigadores

É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.

Patrocinador

Investigadores

  • Investigador principal: Mohammed Eid, Doctor, Botany and Microbiology Department, Faculty of Science, Tanta University Tanta

Datas de registro do estudo

Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados ​​pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.

Datas Principais do Estudo

Início do estudo (Real)

4 de outubro de 2020

Conclusão Primária (Antecipado)

3 de outubro de 2021

Conclusão do estudo (Antecipado)

3 de outubro de 2022

Datas de inscrição no estudo

Enviado pela primeira vez

7 de outubro de 2020

Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ

8 de outubro de 2020

Primeira postagem (Real)

12 de outubro de 2020

Atualizações de registro de estudo

Última Atualização Postada (Real)

14 de outubro de 2020

Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade

10 de outubro de 2020

Última verificação

1 de outubro de 2020

Mais Informações

Termos relacionados a este estudo

Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo

Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Essas informações foram obtidas diretamente do site clinicaltrials.gov sem nenhuma alteração. Se você tiver alguma solicitação para alterar, remover ou atualizar os detalhes do seu estudo, entre em contato com register@clinicaltrials.gov. Assim que uma alteração for implementada em clinicaltrials.gov, ela também será atualizada automaticamente em nosso site .

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