Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Differentiellt uttryck av cytokiner, transkriptom och miRNA i egyptiska patienter med Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)

10 oktober 2020 uppdaterad av: Mohammed Ali Ahmed Eid, Tanta University

Studier om det differentiella uttrycket av cytokiner, transkriptom och miRNA i samband med COVID-19-infektion i egyptiska gemenskapen

Syftet med detta arbete är att studera värd-patogen-interaktion hos egyptiska patienter infekterade med COVID-19. Utredarna kommer att utföra genomomfattande miRNA- och transkriptomskärmar hos de infekterade patienterna tillsammans med friska för jämförelse. Alla typer av cytokiner spelar centrala roller i immunitet, inklusive svaren på olika virusinfektioner. Därför kommer utredarna att studera cytokinprofilen som svar på den infektionen. Genom att jämföra miRNA- och transkriptomskärmar tillsammans med cytokinprofiler kan en viktig molekyl identifieras som kan spela roll i hämningen av COVID-19-utbrottet. Dessutom kommer denna information att hjälpa oss att bli medvetna om immunförsvaret och veta om generna som är involverade i immunsvaret mot COVID-19 med tonvikt på uttrycket av cytokiner.

Studieöversikt

Status

Okänd

Betingelser

Intervention / Behandling

Detaljerad beskrivning

Coronavirus är en grupp virus som orsakar sjukdomar hos däggdjur och fåglar. Hos människor orsakar koronavirus luftvägsinfektioner som kan vara milda, såsom vissa fall av förkylning, och andra som kan vara dödliga, såsom allvarligt akut respiratoriskt syndrom (SARS), (Mellanösterns respiratoriska syndrom) MERS och COVID- 19. De innehåller ett enkelsträngat RNA-genom med positiv känsla. Genomstorleken varierar från cirka 27 till 34 kilobaser. Den har ett 5' metylerat lock "5'leader, UTR", repliker/transkriptasenzym, spike (S) protein, envelope (E) protein, membran (M) protein, nukleokapsid (N) protein, 3'otranslaterad region (3) 'UTR), respektive en poly (A) svans. S-proteinet har en viktig roll i att framkalla den skyddande immuniteten under infektion med SARS-coronavirus (SARS-CoV) genom att inducera neutraliserande antikroppar och T-cellssvar. Det är också den mest muterade delen av coronavirusets genom. Syftet med detta arbete är att studera värd-patogen-interaktion hos egyptiska patienter infekterade med COVID-19. Utredarna kommer att utföra genomomfattande miRNA- och transkriptomskärmar hos de infekterade patienterna tillsammans med friska för jämförelse. Alla typer av cytokiner spelar centrala roller i immunitet, inklusive svaren på olika virusinfektioner. Därför kommer utredarna att studera cytokinprofilen som svar på den infektionen. Genom att jämföra miRNA- och transkriptomskärmar tillsammans med cytokinprofiler kan en viktig molekyl identifieras som kan spela roll i hämningen av COVID-19-utbrottet. Dessutom kommer denna information att hjälpa oss att bli medvetna om immunförsvaret och veta om generna som är involverade i immunsvaret mot COVID-19 med tonvikt på uttrycket av cytokiner.

Studietyp

Observationell

Inskrivning (Förväntat)

40

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studieorter

  • Egypten
    • El Gharbia
      • Tanta, El Gharbia, Egypten, 31527
    • Gharbia
      • Tanta, Gharbia, Egypten, 31527
        • Avslutad
        • Center of Excellence in Cancer Research, Tanta University Hospital.

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

18 år till 80 år (Vuxen, Äldre vuxen)

Tar emot friska volontärer

Ja

Kön som är behöriga för studier

Allt

Testmetod

Icke-sannolikhetsprov

Studera befolkning

Bioinformatik och statistiska analyser kommer att göras för att differentiera det faktiska genuttrycket, miRNA-uttrycket och cytokinstormprofilen mellan svåra och milda, COVID-19-patienter i jämförelse med hälsokontroll.

Beskrivning

Inklusionskriterier:

  • Bekräftade COVID-19-patienter och patienter över 18 år kommer att beaktas i detta projekt.

Exklusions kriterier:

  • Patienter med mer än en av dessa kroniska sjukdomar; diabetes mellitus, högt blodtryck, hjärtsjukdomar och leversjukdomar grad 2 och 3 kommer att uteslutas.

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

Kohorter och interventioner

Grupp / Kohort
Intervention / Behandling
COVID-19 Allvarliga symtom
Patienter med svåra symtom behöver syrgas och ventilation.
Genetisk: Covid-19 diagnostiska och bedömningstester
Komplett blodräkning (CBC), differentiella leukocyter, D-dimer, C-reaktivt protein, polymeraskedjereaktion (PCR) test, ferritinnivå, cytokinprofil, transkriptomanalys, miRNA-analys.
COVID-19 Milda symtom
Patienter med måttliga symtom, som normala influensasymptom. De behöver inte syre eller ventilation
Genetisk: Covid-19 diagnostiska och bedömningstester
Komplett blodräkning (CBC), differentiella leukocyter, D-dimer, C-reaktivt protein, polymeraskedjereaktion (PCR) test, ferritinnivå, cytokinprofil, transkriptomanalys, miRNA-analys.
Styr Frisk
Frisk grupp utan infektion eller symtom.
Genetisk: Covid-19 diagnostiska och bedömningstester
Komplett blodräkning (CBC), differentiella leukocyter, D-dimer, C-reaktivt protein, polymeraskedjereaktion (PCR) test, ferritinnivå, cytokinprofil, transkriptomanalys, miRNA-analys.

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Differentiell genuttrycksprofil.
Tidsram: 3 månader
Utredarna kommer att analysera den totala genuttrycksprofilen mellan 15 och 15 måttliga COVID-19-patienter jämfört med 10 hälsosamma genom att använda Affymetrix® Microarray Technology. Microarray rådata för hela transkriptom kommer att extraheras och bearbetas för analys (cirka 25 000 gener) med hjälp av olika mjukvarupaket för att dissekera de differentiella uttrycken som kommer att korreleras med kliniska data; till exempel (CBC, D-dimervärde, ferritinvärde…..etc.).
3 månader
Differentiell miRNA-uttrycksprofil.
Tidsram: 3 månader
Utredarna kommer att analysera den totala miRNA-expressionsprofilen mellan 15 och 15 måttliga COVID-19-patienter jämfört med 10 hälsosamma genom att använda Affymetrix® Microarray Technology. Microarray-rådata för hela miRNA-uttryck kommer att extraheras och bearbetas för analys med hjälp av olika mjukvarupaket för att dissekera de differentiella uttrycken som kommer att korreleras med kliniska data; till exempel (CBC, D-dimervärde, ferritinvärde…..etc.).
3 månader
Multiplex cytokinanalys
Tidsram: 3 månader
Denna analys kommer att göras på plasma från patienter. Utredarna kommer att analysera de olika cytokinprofilerna mellan 15 och 15 måttliga covid-19-patienter jämfört med 10 hälsosamma genom att använda xMAP-teknik (Multi-Analyte Profiling) och Luminex 200. Den erhållna informationen kommer att analyseras med hjälp av statistisk programvara för att studera de olika profilerna mellan de utvalda deltagarna. De erhållna data kommer också att vara korrelerade till de kliniska data; till exempel (CBC, D-dimervärde, ferritinvärde…..etc.).
3 månader

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Sponsor

Tanta University

Utredare

  • Huvudutredare: Mohammed Eid, Doctor, Botany and Microbiology Department, Faculty of Science, Tanta University Tanta

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Faktisk)

4 oktober 2020

Primärt slutförande (Förväntat)

3 oktober 2021

Avslutad studie (Förväntat)

3 oktober 2022

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

7 oktober 2020

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

8 oktober 2020

Första postat (Faktisk)

12 oktober 2020

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)

14 oktober 2020

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

10 oktober 2020

Senast verifierad

1 oktober 2020

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Nyckelord

Ytterligare relevanta MeSH-villkor

Andra studie-ID-nummer

  • CTM_COVID-19

Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument

Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt

Nej

Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt

Nej

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Prenumerera