Expresión diferencial de citocinas, transcriptoma y miARN en pacientes egipcios con enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19)
10 de octubre de 2020 actualizado por: Mohammed Ali Ahmed Eid, Tanta University
Estudios sobre la expresión diferencial de citocinas, transcriptomas y miARN en el contexto de la infección por COVID-19 en la comunidad egipcia
El objetivo de este esfuerzo es estudiar la interacción huésped-patógeno en pacientes egipcios infectados con COVID-19.
Los investigadores realizarán pruebas de transcriptoma y miARN de todo el genoma en los pacientes infectados junto con los sanos para comparar.
Todos los tipos de citoquinas juegan un papel fundamental en la inmunidad, incluidas las respuestas a diferentes infecciones virales.
Por lo tanto, los investigadores estudiarán el perfil de citoquinas en respuesta a esa infección.
Al comparar las pantallas de miARN y transcriptoma junto con los perfiles de citocinas, se podría identificar una molécula importante que podría desempeñar un papel en la inhibición del brote de COVID-19.
Además, esta información nos ayudará a tomar conciencia del proceso inmunológico y conocer los genes involucrados en la respuesta inmunológica frente al COVID-19 con énfasis en la expresión de citocinas.
Descripción general del estudio
Estado
Desconocido
Condiciones
Intervención / Tratamiento
Descripción detallada
Los coronavirus son un grupo de virus que causan enfermedades en mamíferos y aves.
En los humanos, los coronavirus causan infecciones del tracto respiratorio que pueden ser leves, como algunos casos de resfriado común, y otros que pueden ser letales, como el síndrome respiratorio agudo severo (SARS), (síndrome respiratorio de Oriente Medio) MERS y COVID- 19
Contienen un genoma de ARN monocatenario de sentido positivo.
El tamaño del genoma oscila entre aproximadamente 27 y 34 kilobases.
Tiene una tapa metilada en 5' "líder 5', UTR", réplicas/enzima transcriptasa, proteína de punta (S), proteína de envoltura (E), proteína de membrana (M), proteína de nucleocápside (N), región 3' no traducida (3 'UTR) y una cola poli (A), respectivamente.
La proteína S tiene un papel importante en la obtención de la inmunidad protectora durante la infección por el virus corona del SARS (SARS-CoV) al inducir respuestas de anticuerpos neutralizantes y células T.
También es la parte más mutada del genoma del coronavirus.
El objetivo de este esfuerzo es estudiar la interacción huésped-patógeno en pacientes egipcios infectados con COVID-19.
Los investigadores realizarán pruebas de transcriptoma y miARN de todo el genoma en los pacientes infectados junto con los sanos para comparar.
Todos los tipos de citoquinas juegan un papel fundamental en la inmunidad, incluidas las respuestas a diferentes infecciones virales.
Por lo tanto, los investigadores estudiarán el perfil de citoquinas en respuesta a esa infección.
Al comparar las pantallas de miARN y transcriptoma junto con los perfiles de citoquinas, se podría identificar una molécula importante, que podría desempeñar un papel en la inhibición del brote de COVID-19.
Además, esta información nos ayudará a tomar conciencia del proceso inmunológico y conocer los genes involucrados en la respuesta inmunológica frente al COVID-19 con énfasis en la expresión de citocinas.
Tipo de estudio
De observación
Inscripción (Anticipado)
40
Contactos y Ubicaciones
Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.
Ubicaciones de estudio
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El Gharbia
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Tanta, El Gharbia, Egipto, 31527
- Reclutamiento
- Tanta University Hospital
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Contacto:
- Mohammed Hanteera, Professor
- Número de teléfono: +201141146700
- Correo electrónico: mohamed.hantera@med.tanta.edu.eg
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Gharbia
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Tanta, Gharbia, Egipto, 31527
- Terminado
- Center of Excellence in Cancer Research, Tanta University Hospital.
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Criterios de participación
Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
18 años a 80 años (Adulto, Adulto Mayor)
Acepta Voluntarios Saludables
Sí
Géneros elegibles para el estudio
Todos
Método de muestreo
Muestra no probabilística
Población de estudio
Los análisis bioinformáticos y estadísticos se realizarán para diferenciar la expresión génica real, la expresión de miARN y el perfil de tormenta de citocinas entre pacientes con COVID-19 grave y leve en comparación con el control de salud.
Descripción
Criterios de inclusión:
- Los pacientes confirmados con COVID-19 y los pacientes mayores de 18 años serán considerados en este proyecto.
Criterio de exclusión:
- Pacientes con más de una de estas enfermedades crónicas; Se excluirán la diabetes mellitus, la hipertensión, las cardiopatías y las hepatopatías grado 2 y 3.
Plan de estudios
Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
Intervención / Tratamiento |
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Síntomas graves de COVID-19
Los pacientes con síntomas graves necesitan oxígeno y ventilación.
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Conteo sanguíneo completo (CBC), leucocitos diferenciales, dímero D, proteína C reactiva, prueba de reacción en cadena de la polimerasa (PCR), nivel de ferritina, perfil de citocinas, análisis de transcriptoma, análisis de miARN.
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Síntomas leves de COVID-19
Pacientes con síntomas moderados, como los síntomas normales de la gripe.
No necesitan oxígeno ni ventilación.
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Conteo sanguíneo completo (CBC), leucocitos diferenciales, dímero D, proteína C reactiva, prueba de reacción en cadena de la polimerasa (PCR), nivel de ferritina, perfil de citocinas, análisis de transcriptoma, análisis de miARN.
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Control Saludable
Grupo sano sin ningún tipo de infección o síntomas.
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Conteo sanguíneo completo (CBC), leucocitos diferenciales, dímero D, proteína C reactiva, prueba de reacción en cadena de la polimerasa (PCR), nivel de ferritina, perfil de citocinas, análisis de transcriptoma, análisis de miARN.
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¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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Perfil de expresión génica diferencial.
Periodo de tiempo: 3 meses
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Los investigadores analizarán el perfil de expresión génica total entre 15 pacientes graves y 15 moderados con COVID-19 en comparación con 10 pacientes sanos mediante el uso de la tecnología de microarrays Affymetrix®.
Los datos sin procesar de micromatrices para el transcriptoma completo se extraerán y procesarán para su análisis (alrededor de 25000 genes) utilizando diferentes paquetes de software para diseccionar las expresiones diferenciales que se correlacionarán con los datos clínicos; por ejemplo (CBC, valor de dímero D, valor de ferritina…..etc.).
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3 meses
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Perfil de expresión diferencial de miARN.
Periodo de tiempo: 3 meses
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Los investigadores analizarán el perfil de expresión total de miARN entre 15 pacientes graves y 15 moderados con COVID-19 en comparación con 10 pacientes sanos mediante el uso de la tecnología de microarrays Affymetrix®.
Los datos sin procesar de micromatrices para la expresión completa de miARN se extraerán y procesarán para su análisis utilizando diferentes paquetes de software para diseccionar las expresiones diferenciales que se correlacionarán con los datos clínicos; por ejemplo (CBC, valor de dímero D, valor de ferritina…..etc.).
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3 meses
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Ensayo de citoquinas multiplex
Periodo de tiempo: 3 meses
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Este ensayo se realizará en plasma de pacientes.
Los investigadores analizarán los diferentes perfiles de citoquinas entre 15 pacientes severos y 15 moderados con COVID-19 en comparación con 10 pacientes sanos mediante el uso de la tecnología xMAP (Multi-Analyte Profiling) y Luminex 200.
Los datos obtenidos serán analizados mediante un software estadístico para estudiar el diferente perfil entre los participantes seleccionados.
Los datos obtenidos también serán correlacionados con los datos clínicos; por ejemplo (CBC, valor de dímero D, valor de ferritina…..etc.).
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3 meses
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Colaboradores e Investigadores
Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.
Patrocinador
Investigadores
- Investigador principal: Mohammed Eid, Doctor, Botany and Microbiology Department, Faculty of Science, Tanta University Tanta
Fechas de registro del estudio
Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Actual)
4 de octubre de 2020
Finalización primaria (Anticipado)
3 de octubre de 2021
Finalización del estudio (Anticipado)
3 de octubre de 2022
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
7 de octubre de 2020
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
8 de octubre de 2020
Publicado por primera vez (Actual)
12 de octubre de 2020
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Actual)
14 de octubre de 2020
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
10 de octubre de 2020
Última verificación
1 de octubre de 2020
Más información
Términos relacionados con este estudio
Palabras clave
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
- CTM_COVID-19
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
No
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
No
Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .