Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Differentiële expressie van cytokines, transcriptoom en miRNA bij patiënten met coronavirusziekte 2019 (COVID-19) in Egypte

10 oktober 2020 bijgewerkt door: Mohammed Ali Ahmed Eid, Tanta University

Studies naar de differentiële expressie van cytokines, transcriptoom en miRNA in de context van COVID-19-infectie in de Egyptische gemeenschap

Het doel van deze inspanning is om de interactie tussen gastheer en ziekteverwekker te bestuderen bij Egyptische patiënten die zijn geïnfecteerd met COVID-19. De onderzoekers zullen ter vergelijking genoombrede miRNA- en transcriptoomscreens uitvoeren bij de geïnfecteerde patiënten, samen met gezonde patiënten. Alle soorten cytokines spelen een cruciale rol bij de immuniteit, inclusief de reacties op verschillende virale infecties. Daarom zullen de onderzoekers het cytokineprofiel bestuderen als reactie op die infectie. Door miRNA- en transcriptoomscreens te vergelijken met cytokineprofielen, kan een belangrijk molecuul worden geïdentificeerd dat een rol zou kunnen spelen bij de remming van de COVID-19-uitbraak. Bovendien zal deze informatie ons helpen om ons bewust te worden van het immuunsysteem en om meer te weten te komen over de genen die betrokken zijn bij de immuunrespons tegen COVID-19, met de nadruk op de expressie van cytokines.

Studie Overzicht

Toestand

Onbekend

Conditie

Interventie / Behandeling

Gedetailleerde beschrijving

Coronavirussen zijn een groep virussen die ziekten veroorzaken bij zoogdieren en vogels. Bij mensen veroorzaken coronavirussen luchtweginfecties die mild kunnen zijn, zoals sommige gevallen van verkoudheid, en andere die dodelijk kunnen zijn, zoals ernstig acuut respiratoir syndroom (SARS), (midden-oosten respiratoir syndroom) MERS en COVID- 19. Ze bevatten een positief-sense, enkelstrengs RNA-genoom. De grootte van het genoom varieert van ongeveer 27 tot 34 kilobasen. Het heeft een 5' gemethyleerde kap "5'leader, UTR", replica's/transcriptase enzym, spike (S) eiwit, envelop (E) eiwit, membraan (M) eiwit, nucleocapside (N) eiwit, 3' onvertaald gebied (3 'UTR), en een poly (A) staart, respectievelijk. Het S-eiwit speelt een belangrijke rol bij het opwekken van de beschermende immuniteit tijdens infectie met het SARS-coronavirus (SARS-CoV) door neutraliserende antilichamen en T-celreacties op te wekken. Het is ook het meest gemuteerde deel van het coronavirusgenoom. Het doel van deze inspanning is om de interactie tussen gastheer en ziekteverwekker te bestuderen bij Egyptische patiënten die zijn geïnfecteerd met COVID-19. De onderzoekers zullen ter vergelijking genoombrede miRNA- en transcriptoomscreens uitvoeren bij de geïnfecteerde patiënten, samen met gezonde patiënten. Alle soorten cytokines spelen een cruciale rol bij de immuniteit, inclusief de reacties op verschillende virale infecties. Daarom zullen de onderzoekers het cytokineprofiel bestuderen als reactie op die infectie. Door miRNA- en transcriptoomscreens te vergelijken met cytokineprofielen, kan een belangrijk molecuul worden geïdentificeerd dat een rol zou kunnen spelen bij de remming van de COVID-19-uitbraak. Bovendien zal deze informatie ons helpen om ons bewust te worden van het immuunsysteem en om meer te weten te komen over de genen die betrokken zijn bij de immuunrespons tegen COVID-19, met de nadruk op de expressie van cytokines.

Studietype

Observationeel

Inschrijving (Verwacht)

40

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studie Locaties

  • Egypte
    • El Gharbia
      • Tanta, El Gharbia, Egypte, 31527
    • Gharbia
      • Tanta, Gharbia, Egypte, 31527
        • Voltooid
        • Center of Excellence in Cancer Research, Tanta University Hospital.

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

18 jaar tot 80 jaar (Volwassen, Oudere volwassene)

Accepteert gezonde vrijwilligers

Ja

Geslachten die in aanmerking komen voor studie

Allemaal

Bemonsteringsmethode

Niet-waarschijnlijkheidssteekproef

Studie Bevolking

De bio-informatica en statistische analyses zullen worden uitgevoerd om de daadwerkelijke genexpressie, miRNA-expressie en cytokine-stormprofiel te differentiëren tussen ernstige en milde COVID-19-patiënten in vergelijking met gezondheidscontrole.

Beschrijving

Inclusiecriteria:

  • Bevestigde COVID-19-patiënten en patiënten ouder dan 18 jaar zullen in dit project worden overwogen.

Uitsluitingscriteria:

  • Patiënten met meer dan één van deze chronische ziekten; diabetes mellitus, hypertensie, hartaandoeningen en leverziekten graad 2 en 3 worden uitgesloten.

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

Cohorten en interventies

Groep / Cohort
Interventie / Behandeling
COVID-19 Ernstige symptomen
Patiënten met ernstige symptomen hebben zuurstof en ventilatie nodig.
Genetisch: COVID-19 diagnostische en beoordelingstests
Compleet bloedbeeld (CBC), differentiële leukocyten, D-dimeer, C-reactief proteïne, polymerasekettingreactie (PCR)-test, ferritineniveau, cytokineprofiel, transcriptoomanalyse, miRNA-analyse.
COVID-19 milde symptomen
Patiënten met matige symptomen, zoals normale griepsymptomen. Ze hebben geen zuurstof of ventilatie nodig
Genetisch: COVID-19 diagnostische en beoordelingstests
Compleet bloedbeeld (CBC), differentiële leukocyten, D-dimeer, C-reactief proteïne, polymerasekettingreactie (PCR)-test, ferritineniveau, cytokineprofiel, transcriptoomanalyse, miRNA-analyse.
Controle Gezond
Gezonde groep zonder infectie of symptomen.
Genetisch: COVID-19 diagnostische en beoordelingstests
Compleet bloedbeeld (CBC), differentiële leukocyten, D-dimeer, C-reactief proteïne, polymerasekettingreactie (PCR)-test, ferritineniveau, cytokineprofiel, transcriptoomanalyse, miRNA-analyse.

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Differentieel genexpressieprofiel.
Tijdsspanne: 3 maanden
De onderzoekers zullen het totale genexpressieprofiel tussen 15 ernstige en 15 matige COVID-19-patiënten analyseren in vergelijking met 10 gezonde patiënten met behulp van Affymetrix® Microarray-technologie. Microarray-ruwe gegevens voor het hele transcriptoom zullen worden geëxtraheerd en verwerkt voor analyse (ongeveer 25.000 genen) met behulp van verschillende softwarepakketten om de differentiële expressies te ontleden die zullen worden gecorreleerd met de klinische gegevens; bijvoorbeeld (CBC, D-dimeerwaarde, ferritinewaarde…..etc.).
3 maanden
Differentieel miRNA-expressieprofiel.
Tijdsspanne: 3 maanden
De onderzoekers zullen het totale miRNA-expressieprofiel analyseren tussen 15 ernstige en 15 matige COVID-19-patiënten in vergelijking met 10 gezonde patiënten met behulp van Affymetrix® Microarray-technologie. Microarray onbewerkte gegevens voor volledige miRNA-expressie zullen worden geëxtraheerd en verwerkt voor analyse met behulp van verschillende softwarepakketten om de differentiële expressies te ontleden die zullen worden gecorreleerd met de klinische gegevens; bijvoorbeeld (CBC, D-dimeerwaarde, ferritinewaarde…..etc.).
3 maanden
Multiplex Cytokine-test
Tijdsspanne: 3 maanden
Deze test zal worden gedaan op plasma van patiënten. De onderzoekers zullen het verschillende cytokineprofiel analyseren tussen 15 ernstige en 15 matige COVID-19-patiënten in vergelijking met 10 gezondheidspatiënten door gebruik te maken van xMAP-technologie (Multi-Analyte Profiling) en Luminex 200. De verkregen gegevens zullen worden geanalyseerd met behulp van statistische software om het verschillende profiel tussen de geselecteerde deelnemers te bestuderen. De verkregen gegevens zullen ook worden gecorreleerd met de klinische gegevens; bijvoorbeeld (CBC, D-dimeerwaarde, ferritinewaarde…..etc.).
3 maanden

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Sponsor

Tanta University

Onderzoekers

  • Hoofdonderzoeker: Mohammed Eid, Doctor, Botany and Microbiology Department, Faculty of Science, Tanta University Tanta

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Werkelijk)

4 oktober 2020

Primaire voltooiing (Verwacht)

3 oktober 2021

Studie voltooiing (Verwacht)

3 oktober 2022

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

7 oktober 2020

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

8 oktober 2020

Eerst geplaatst (Werkelijk)

12 oktober 2020

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Werkelijk)

14 oktober 2020

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

10 oktober 2020

Laatst geverifieerd

1 oktober 2020

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Trefwoorden

Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden

Andere studie-ID-nummers

  • CTM_COVID-19

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Abonneren