Nsclc 中 Ebus-tbna 上清液游离 DNA 的基因分型 (CELTICS)
肺癌超声引导支气管镜细胞穿刺术结果的分子分析
研究概览
详细说明
“液体活检”诊断在晚期癌症患者护理中的广泛应用凸显了改善接近肿瘤以实现准确肿瘤基因分型的愿望 (1)。 血浆 cfDNA 的基因分型现在已成为 NSCLC 诊断时检测 EGFR 驱动突变或检测 TKI 耐药后 EGFR T790M 突变的常规方法,并且是检测其他驱动(HER2 或 BRAF 突变、ALK 或 ROS1)的新兴方法融合…) (2) 或肿瘤突变负荷 (TMB) (3) 的估计。 然而,最敏感的血浆基因分型平台的灵敏度仍然只有 70%-80%,因此阴性结果需要组织活检确认。 这带来了临床挑战,因为阴性血浆基因分型与更有限的转移扩散和更低的肿瘤负荷相关,因此这些患者的活检可能更具挑战性。 由于侵入性活检仍然是诊断策略的一个组成部分,因此需要一些方法来最大限度地提高这些活检程序的产量。
目前,需要大量组织来对越来越多的靶向驱动因素和免疫治疗反应标志物(PD-L1、TMB)进行多重分析,而微创活检程序的发展导致标本有限,这两者之间存在矛盾. 因此,高达 25% 的患者在不知道其肿瘤分子特征的情况下接受了治疗 (4)。 特别是,20% 的支气管内超声检查经支气管针吸活检 (EBUS-TBNA) 由于缺乏组织 (5) 而在基因分型中被拒绝,这些诊断步骤有时并不需要耗费时间和组织(阻力设置)。 循环肿瘤 DNA 是一种新兴的癌症基因分型方法,但由于不一致的肿瘤脱落和低 DNA 浓度,其灵敏度仅限于 70-80% (6),因此组织活检仍然是常规方法。 此外,组织 TMB 评估的可行性仅为 60%(在 EBUS-TBNA 标本上可能要低得多)(7),而在血浆(血液 TMB、bTMB)中大约为 80% (3)。
cfDNA 在几种生物体液中的存在以及在这些体液(尿液、胸膜液、脑脊液)中检测目标突变(通常仅针对 EGFR)的可行性已得到明确证明 (8-12),而血液是研究最广泛的晚期 NSCLC 中的液体活检底物。
此外,我们在概念验证研究中表明,在有限数量的患者中调查各种 FNA 标本,细胞学样本的上清液(通常被丢弃)是 DNA 的丰富来源。 我们的结果表明,上清液游离 DNA (sfDNA) 可用于基线和耐药基因分型 (13)。
研究类型
注册 (预期的)
联系人和位置
学习地点
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Toulouse、法国
- Nicolas Guibert
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
接受健康志愿者
有资格学习的性别
取样方法
研究人群
描述
纳入标准:
- 年龄 > 18 岁
计划进行 EBUS-TBNA 的患者
- 怀疑 IV 期肺癌(PET+ 纵隔淋巴结)(队列 1)
- 具有 EGFR、BRAF、HER2、MET 突变或 ALK、RET 或 ROS1 重排的 IV 期 NSCLC 且对靶向治疗产生耐药性(队列 2)
- 性能状态 0-3
- 知情同意
排除标准:
- 拒绝参加
- 病人在法律监护下
学习计划
研究是如何设计的?
设计细节
- 观测模型:队列
- 时间观点:预期
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
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鉴定突变
上清液识别细胞块(金标准)上检测到的突变的敏感性。
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介入肺科医生选择最可疑的节点。 将相应的 TBNA 置于 Cytolyt 中,并使用标签进行标记,以指示在初始旋转后必须保存上清液的标本。 将上清液转移到“Laboratoire de Biologie Médicale Oncologique”,在那里进行进一步的强力旋转。 剩余的上清液保存在 -80°C,然后将其送往 Foundation One,从 3 ml 上清液中提取 DNA 并进行基因分型。 将两个 7.5 mL 血液管转移到实验室以提取血浆。 血浆储存在 -80°C,然后送往 Foundation One,从 2 mL 血浆中提取 DNA 并进行基因分型。 细胞块中的 10 张载玻片被运送到 Foundation One。 这些标本通过 FoundationOne®CDX(组织)和 FoundationOne®Liquid(上清液和血浆)进行基因组和 TMB 分析(基于杂交捕获的下一代测序)测试。 |
未识别的突变
上清液识别细胞块(金标准)上检测到的突变的敏感性。
|
介入肺科医生选择最可疑的节点。 将相应的 TBNA 置于 Cytolyt 中,并使用标签进行标记,以指示在初始旋转后必须保存上清液的标本。 将上清液转移到“Laboratoire de Biologie Médicale Oncologique”,在那里进行进一步的强力旋转。 剩余的上清液保存在 -80°C,然后将其送往 Foundation One,从 3 ml 上清液中提取 DNA 并进行基因分型。 将两个 7.5 mL 血液管转移到实验室以提取血浆。 血浆储存在 -80°C,然后送往 Foundation One,从 2 mL 血浆中提取 DNA 并进行基因分型。 细胞块中的 10 张载玻片被运送到 Foundation One。 这些标本通过 FoundationOne®CDX(组织)和 FoundationOne®Liquid(上清液和血浆)进行基因组和 TMB 分析(基于杂交捕获的下一代测序)测试。 |
研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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研究的主要目的
大体时间:18个月
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研究 sfDNA 基因分型在各种临床环境中的敏感性,并将其与细胞块进行比较
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18个月
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次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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TMB 估计
大体时间:18个月
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评估对该标本进行 TMB 估计的可行性
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18个月
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血浆敏感性
大体时间:18个月
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比较血浆基因分型对细胞块的敏感性
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18个月
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血浆和上清液之间的一致性
大体时间:18个月
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研究血浆和上清液之间用于突变检测和 TMB 估计的一致性
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18个月
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突变率
大体时间:18个月
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计算与细胞块相比在上清液中检测到至少一个额外突变的患者的比率
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18个月
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上清液和血浆的灵敏度
大体时间:18个月
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比较上清液和血浆对细胞块的敏感性以检测特定改变(EGFR、HER2、BRAF、PIK3CA、KRAS、MET 突变、ALK、ROS1、NTRK、RET 融合)
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18个月
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上清液周转时间
大体时间:18个月
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比较用于基因分型的上清液、血浆和细胞块的周转时间
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18个月
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合作者和调查者
调查人员
- 首席研究员:Nicolas GUIBERT、University Hospital, Toulouse
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (预期的)
初级完成 (预期的)
研究完成 (预期的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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