Ebus-tbna Supernant -soluttoman DNA:n genotyypitys Nsclc:ssä (CELTICS)

"Nestemäisen biopsian" diagnostiikan laaja käyttö edistyneiden syöpäpotilaiden hoidossa korostaa toivetta parantaa kasvaimen saantia, mikä mahdollistaa tarkan kasvaimen genotyypin määrittämisen (1). Plasman cfDNA:n genotyypitys on nyt rutiinia EGFR-ohjainmutaatioiden havaitsemiseksi NSCLC-diagnoosin yhteydessä tai EGFR T790M -mutaation havaitsemiseksi TKI-resistenssin jälkeen, ja se on nouseva lähestymistapa muiden ajureiden havaitsemiseen (HER2- tai BRAF-mutaatiot, ALK tai ROS1). fuusiot…) (2) tai arvio tuumorimutaatiotaakasta (TMB) (3). Herkimpien plasman genotyypitysalustojen herkkyys on kuitenkin edelleen vain 70–80 %, joten negatiivinen tulos vaatii kudosbiopsian vahvistuksen. Tämä on kliininen haaste, koska negatiivinen plasman genotyypitys korreloi rajoitetumman metastaattisen leviämisen ja pienemmän tuumoritaakan kanssa, joten näiden potilaiden biopsia voi olla vieläkin haastavampaa. Koska invasiivinen biopsia on edelleen olennainen osa diagnostista strategiaa, tarvitaan menetelmiä näiden biopsiatoimenpiteiden tuoton maksimoimiseksi.

Nykyinen paradoksi on olemassa suurten kudosmäärien tarve lisääntyvän määrän kohdennettavien tekijöiden ja immuunihoitovasteen merkkiaineiden multipleksausanalyysiin (PD-L1, TMB) ja minimaalisesti invasiivisten biopsiamenetelmien kehittämisen välillä, jotka johtavat rajallisiin näytteisiin. . Jopa 25 % potilaista hoidetaan siten tietämättä kasvaimen molekyyliprofiilia (4). Erityisesti 20 % endobronkiaalisesta ultraäänitutkimuksesta transbronkiaalista neulaaspiraatiota (EBUS-TBNA) hylätään genotyypityksen vuoksi kudoksen puutteen (5) vuoksi ajan ja kudosta kuluttavien diagnostisten vaiheiden vuoksi, joita ei toisinaan tarvita (resistenssiasetus). Kiertävä kasvain-DNA on nouseva lähestymistapa syövän genotyypitykseen, mutta herkkyys on rajoitettu 70–80 prosenttiin (6) epäjohdonmukaisen kasvaimen leviämisen ja alhaisten DNA-pitoisuuksien vuoksi, joten kudosbiopsia on edelleen rutiinia. Myös TMB-arvioinnin toteutettavuus kudoksissa on vain 60 % (todennäköisesti paljon vähemmän EBUS-TBNA-näytteissä) (7) ja noin 80 % plasmassa (veren TMB, bTMB) (3).

cfDNA:n esiintyminen useissa biologisissa nesteissä ja kiinnostavien mutaatioiden havaitsemismahdollisuus (yleensä vain EGFR:ään kohdistettuina) näistä nesteistä (virtsa, keuhkopussin neste, CSF) on osoitettu selvästi (8-12), kun taas veri on laajimmin tutkittu. nestemäinen biopsiasubstraatti kehittyneessä NSCLC:ssä.

Lisäksi osoitimme proof of concept -tutkimuksessa, jossa tutkittiin erilaisia ​​FNA-näytteitä rajoitetulla määrällä potilaita, että sytologisten näytteiden supernatantti (yleensä hylätty) on rikas DNA:n lähde. Tuloksemme viittaavat siihen, että supernatantista vapaata DNA:ta (sfDNA) voidaan käyttää lähtötilanteen ja resistenssin genotyypitykseen (13).