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Genotipado de ADN libre de células sobrenadantes Ebus-tbna en Nsclc (CELTICS)

9 de noviembre de 2020 actualizado por: University Hospital, Toulouse

Análisis molecular de la sobrenadante de citopunciones broncoscópicas ecoguiadas en cáncer de pulmón

La amplia adopción de diagnósticos de "biopsia líquida" en el cuidado de pacientes con cáncer avanzado destaca el deseo de un mejor acceso al tumor que permita una genotipificación tumoral precisa (1). El genotipado de cfDNA en plasma ahora es rutinario para la detección de mutaciones conductoras de EGFR en el momento del diagnóstico de NSCLC, o para la detección de la mutación EGFR T790M después de la resistencia a TKI, y es un enfoque emergente para la detección de otros impulsores (mutaciones HER2 o BRAF, ALK o ROS1 fusiones…) (2) o la estimación de la carga de mutación tumoral (TMB) (3). Sin embargo, las plataformas de genotipado de plasma más sensibles todavía tienen una sensibilidad de solo el 70%-80%, por lo que un resultado negativo requiere la confirmación de una biopsia de tejido.

Descripción general del estudio

Estado

Desconocido

Condiciones

Descripción detallada

La amplia adopción de diagnósticos de "biopsia líquida" en el cuidado de pacientes con cáncer avanzado destaca el deseo de un mejor acceso al tumor que permita una genotipificación tumoral precisa (1). El genotipado de cfDNA en plasma ahora es rutinario para la detección de mutaciones conductoras de EGFR en el momento del diagnóstico de NSCLC, o para la detección de la mutación EGFR T790M después de la resistencia a TKI, y es un enfoque emergente para la detección de otros impulsores (mutaciones HER2 o BRAF, ALK o ROS1 fusiones…) (2) o la estimación de la carga de mutación tumoral (TMB) (3). Sin embargo, las plataformas de genotipado de plasma más sensibles todavía tienen una sensibilidad de solo el 70%-80%, por lo que un resultado negativo requiere la confirmación de una biopsia de tejido. Esto plantea un desafío clínico porque la genotipificación plasmática negativa se correlaciona con una diseminación metastásica más limitada y una menor carga tumoral, de modo que la biopsia de estos pacientes puede ser aún más desafiante. Debido a que la biopsia invasiva sigue siendo una parte integral de la estrategia de diagnóstico, se necesitan métodos para maximizar el rendimiento de estos procedimientos de biopsia.

Existe una paradoja actual entre la necesidad de grandes cantidades de tejido para el análisis multiplex de un número cada vez mayor de impulsores y marcadores de respuesta a la inmunoterapia (PD-L1, TMB) y el desarrollo de procedimientos de biopsia mínimamente invasivos que resultan en muestras limitadas. . Así, hasta un 25% de los pacientes son tratados sin conocer el perfil molecular de su tumor (4). En particular, el 20 % de las ecografías endobronquiales por aspiración transbronquial con aguja (EBUS-TBNA) se rechazan del genotipado debido a la falta de tejido (5) después de pasos de diagnóstico que requieren mucho tiempo y tejido y que a veces no son necesarios (configuración de resistencia). El ADN tumoral circulante es un enfoque emergente para la determinación del genotipo del cáncer, pero la sensibilidad está limitada al 70-80% (6) por la diseminación inconsistente del tumor y las bajas concentraciones de ADN, por lo que la biopsia de tejido sigue siendo rutinaria. Además, la viabilidad de la evaluación de TMB en tejido es solo del 60 % (probablemente mucho menor en muestras EBUS-TBNA) (7) y aproximadamente el 80 % en plasma (TMB en sangre, bTMB) (3).

Se ha demostrado claramente la presencia de cfDNA en varios fluidos biológicos y la viabilidad de detectar mutaciones de interés (generalmente dirigidas solo al EGFR) en estos fluidos (orina, líquido pleural, LCR) (8-12), mientras que la sangre es el más estudiado. sustrato de biopsia líquido en NSCLC avanzado.

Además, demostramos en un estudio de prueba de concepto, investigando varios especímenes FNA en un número limitado de pacientes, que el sobrenadante de las muestras de citología (generalmente descartado) es una fuente rica de ADN. Nuestros resultados sugieren que el ADN libre del sobrenadante (sfDNA) se puede utilizar para el genotipado de referencia y de resistencia (13).

Tipo de estudio

De observación

Inscripción (Anticipado)

50

Contactos y Ubicaciones

Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.

Ubicaciones de estudio

      • Toulouse, Francia
        • Nicolas Guibert

Criterios de participación

Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.

Criterio de elegibilidad

Edades elegibles para estudiar

18 años a 65 años (Adulto, Adulto Mayor)

Acepta Voluntarios Saludables

N/A

Géneros elegibles para el estudio

Todos

Método de muestreo

Muestra de probabilidad

Población de estudio

Los pacientes serán reclutados en nuestro Departamento en el Hospital Universitario de Toulouse, durante la cita necesaria para información y planificación del procedimiento EBUS-TBNA.

Descripción

Criterios de inclusión:

  • Edad > 18 años
  • Pacientes planificados para un EBUS-TBNA para

    1. Sospecha de cáncer de pulmón en estadio IV (PET+ ganglio(s) mediastínico(s)) (Cohorte 1)
    2. NSCLC en estadio IV con mutación en EGFR, BRAF, HER2, MET o NSCLC reorganizado en ALK, RET o ROS1 y resistencia adquirida a la terapia dirigida (Cohorte 2)
  • Estado de rendimiento 0-3
  • Consentimiento informado

Criterio de exclusión:

  • negativa a participar
  • Paciente bajo tutela legal

Plan de estudios

Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.

¿Cómo está diseñado el estudio?

Detalles de diseño

  • Modelos observacionales: Grupo
  • Perspectivas temporales: Futuro

Cohortes e Intervenciones

Grupo / Cohorte
Intervención / Tratamiento
Mutación identificada
La sensibilidad del sobrenadante para identificar las mutaciones detectadas en el bloque celular (estándar de oro).

El neumólogo intervencionista selecciona el ganglio más sospechoso. El TBNA correspondiente se coloca en Cytolyt y se etiqueta con una etiqueta para indicar la muestra de la que se debe guardar el sobrenadante después del centrifugado inicial.

El sobrenadante se transfiere al "Laboratoire de Biologie Médicale Oncologique" donde se somete a un nuevo centrifugado intenso. El sobrenadante restante se almacena a -80 °C antes de enviarlo a Foundation One para la extracción de ADN a partir de 3 ml de sobrenadante y el genotipado.

Se trasladan dos tubos de sangre de 7,5 mL al laboratorio para extraer plasma. El plasma se almacenó a -80 °C y luego se envió a Foundation One para la extracción de ADN de 2 ml de plasma y el genotipado.

Se envían 10 portaobjetos del bloque de celdas a Foundation One. Estos especímenes se analizan con FoundationOne®CDX (tejido) y FoundationOne®Liquid (sobrenadante y plasma) para análisis genómicos y TMB (secuenciación de próxima generación basada en captura híbrida).

Mutación no identificada
La sensibilidad del sobrenadante para identificar las mutaciones detectadas en el bloque celular (estándar de oro).

El neumólogo intervencionista selecciona el ganglio más sospechoso. El TBNA correspondiente se coloca en Cytolyt y se etiqueta con una etiqueta para indicar la muestra de la que se debe guardar el sobrenadante después del centrifugado inicial.

El sobrenadante se transfiere al "Laboratoire de Biologie Médicale Oncologique" donde se somete a un nuevo centrifugado intenso. El sobrenadante restante se almacena a -80 °C antes de enviarlo a Foundation One para la extracción de ADN a partir de 3 ml de sobrenadante y el genotipado.

Se trasladan dos tubos de sangre de 7,5 mL al laboratorio para extraer plasma. El plasma se almacenó a -80 °C y luego se envió a Foundation One para la extracción de ADN de 2 ml de plasma y el genotipado.

Se envían 10 portaobjetos del bloque de celdas a Foundation One. Estos especímenes se analizan con FoundationOne®CDX (tejido) y FoundationOne®Liquid (sobrenadante y plasma) para análisis genómicos y TMB (secuenciación de próxima generación basada en captura híbrida).

¿Qué mide el estudio?

Medidas de resultado primarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
objetivo principal del estudio
Periodo de tiempo: 18 meses
investigar la sensibilidad del genotipado de sfDNA en varios entornos clínicos y compararlo con el bloque celular
18 meses

Medidas de resultado secundarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Estimación TMB
Periodo de tiempo: 18 meses
Para evaluar la viabilidad de la estimación de TMB en este espécimen
18 meses
sensibilidad del plasma
Periodo de tiempo: 18 meses
Comparar la sensibilidad del genotipado plasmático al bloqueo celular
18 meses
concordancia entre plasma y sobrenadante
Periodo de tiempo: 18 meses
Para investigar la concordancia entre el plasma y el sobrenadante para la detección de mutaciones y la estimación de TMB
18 meses
tasa de mutación
Periodo de tiempo: 18 meses
Para calcular la tasa de pacientes con al menos una mutación adicional detectada en el sobrenadante en comparación con el bloque celular
18 meses
Sensibilidad del sobrenadante y del plasma
Periodo de tiempo: 18 meses
Comparar la sensibilidad de sobrenadante y plasma al bloqueo celular para la detección de alteraciones específicas (EGFR, HER2, BRAF, PIK3CA, KRAS, mutaciones MET, fusiones ALK, ROS1, NTRK, RET)
18 meses
Tiempo de respuesta del sobrenadante
Periodo de tiempo: 18 meses
Para comparar el tiempo de respuesta del sobrenadante, el plasma y el bloque celular para el genotipado
18 meses

Colaboradores e Investigadores

Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.

Investigadores

  • Investigador principal: Nicolas GUIBERT, University Hospital, Toulouse

Fechas de registro del estudio

Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados ​​por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.

Fechas importantes del estudio

Inicio del estudio (Anticipado)

31 de diciembre de 2022

Finalización primaria (Anticipado)

31 de diciembre de 2022

Finalización del estudio (Anticipado)

31 de diciembre de 2022

Fechas de registro del estudio

Enviado por primera vez

9 de noviembre de 2020

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

9 de noviembre de 2020

Publicado por primera vez (Actual)

10 de noviembre de 2020

Actualizaciones de registros de estudio

Última actualización publicada (Actual)

10 de noviembre de 2020

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

9 de noviembre de 2020

Última verificación

1 de noviembre de 2020

Más información

Términos relacionados con este estudio

Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio

Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.

No

Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.

No

Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .

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