Az Ebus-tbna szupernáns sejtmentes DNS genotipizálása az Nsclc-ben (CELTICS)

A „folyékony biopsziás” diagnosztika széles körű elterjedése az előrehaladott rákos betegek ellátásában rávilágít a tumorhoz való jobb hozzáférés iránti vágyra, amely lehetővé teszi a tumor pontos genotipizálását (1). A plazma cfDNS genotipizálása ma már rutinszerű az EGFR driver mutációk kimutatására NSCLC diagnosztizálásakor, vagy az EGFR T790M mutáció kimutatására TKI-rezisztencia után, és egy feltörekvő megközelítés más meghajtók (HER2 vagy BRAF mutációk, ALK vagy ROS1) kimutatására. fúziók…) (2) vagy a tumormutációs teher (TMB) becslése (3). A legérzékenyebb plazma genotipizálási platformok azonban még mindig csak 70-80%-os érzékenységgel rendelkeznek, így a negatív eredmény szövetbiopsziás megerősítést igényel. Ez klinikai kihívást jelent, mivel a negatív plazma genotipizálás korrelál a korlátozottabb metasztatikus terjedéssel és alacsonyabb daganatterheléssel, így ezeknek a betegeknek a biopsziája még nagyobb kihívást jelenthet. Mivel az invazív biopszia továbbra is a diagnosztikai stratégia szerves részét képezi, módszerekre van szükség a biopsziás eljárások hozamának maximalizálására.

Jelenleg paradoxon áll fenn a nagy mennyiségű szövet szükségessége az immunterápiára (PD-L1, TMB) adott válaszreakció növekvő számú megcélzható tényezőjének és markereinek multiplex elemzéséhez, valamint a minimálisan invazív biopsziás eljárások kifejlesztése között, amelyek korlátozott mintákat eredményeznek. . A betegek akár 25%-át így kezelik tumoruk molekuláris profiljának ismerete nélkül (4). Különösen az endobronchiális ultrahangos transzbronchiális tűszívás (EBUS-TBNA) 20%-át utasítják el a genotipizálásból a szövethiány miatt (5) időnként és szövetigényes diagnosztikai lépések után, amelyekre néha nincs szükség (rezisztencia beállítása). A keringő tumor-DNS a rák genotipizálásának feltörekvő megközelítése, de az érzékenységet 70-80%-ra (6) korlátozza az inkonzisztens tumorleválasztás és az alacsony DNS-koncentráció, így a szövetbiopszia még mindig rutinszerű. Ezenkívül a TMB-értékelés megvalósíthatósága szöveteken csak 60% (valószínűleg sokkal kevesebb az EBUS-TBNA mintákon) (7) és körülbelül 80% a plazmában (vér TMB, bTMB) (3).

A cfDNS jelenléte számos biológiai folyadékban, valamint az ezekben a folyadékokban (vizeletben, mellhártyafolyadékban, CSF-ben) a kérdéses mutációk (általában csak az EGFR-t célzó) kimutatásának megvalósíthatósága egyértelműen kimutatható (8-12), míg a vér a legszélesebb körben tanulmányozott. folyékony biopsziás szubsztrát előrehaladott NSCLC-ben.

Ezen túlmenően egy proof of concept tanulmányban, amelyben különböző FNS-mintákat vizsgáltunk korlátozott számú betegen, kimutattuk, hogy a citológiai minták felülúszója (általában eldobva) gazdag DNS-forrás. Eredményeink arra utalnak, hogy a felülúszó szabad DNS (sfDNS) felhasználható az alapvonal és a rezisztencia genotipizálására (13).