Генотипирование бесклеточной ДНК супернанта Ebus-tbna при Nsclc (CELTICS)

Широкое внедрение диагностики «жидкой биопсии» при лечении больных раком на поздних стадиях подчеркивает желание улучшить доступ к опухоли, что позволит точно определить генотип опухоли (1). Генотипирование вкДНК плазмы в настоящее время является рутинным для обнаружения мутаций драйвера EGFR при диагностике НМРЛ или для обнаружения мутации EGFR T790M после резистентности к TKI, а также представляет собой новый подход для обнаружения других драйверов (мутации HER2 или BRAF, ALK или ROS1). слияния…) (2) или оценка бремени опухолевых мутаций (TMB) (3). Тем не менее, наиболее чувствительные платформы для генотипирования плазмы по-прежнему имеют чувствительность всего 70-80%, так что отрицательный результат требует подтверждения биопсии ткани. Это представляет собой клиническую проблему, поскольку отрицательное генотипирование плазмы коррелирует с более ограниченным метастатическим распространением и меньшей опухолевой массой, так что биопсия этих пациентов может быть еще более сложной задачей. Поскольку инвазивная биопсия остается неотъемлемой частью диагностической стратегии, необходимы методы для максимизации результатов этих процедур биопсии.

В настоящее время существует парадокс между потребностью в большом количестве ткани для мультиплексного анализа растущего числа целевых драйверов и маркеров ответа на иммунную терапию (PD-L1, TMB) и разработкой минимально инвазивных процедур биопсии, которые приводят к ограниченному количеству образцов. . Таким образом, до 25% пациентов получают лечение без знания молекулярного профиля их опухоли (4). В частности, 20% эндобронхиальной ультрасонографической трансбронхиальной аспирационной иглы (EBUS-TBNA) отклоняются от генотипирования из-за отсутствия ткани (5) после временных и тканевых диагностических этапов, которые иногда не требуются (постановка резистентности). Циркулирующая опухолевая ДНК является новым подходом к генотипированию рака, но чувствительность ограничена 70-80% (6) из-за непостоянного выделения опухоли и низких концентраций ДНК, поэтому биопсия ткани по-прежнему является рутинной процедурой. Кроме того, осуществимость оценки ТМБ на ткани составляет всего 60% (вероятно, гораздо меньше на образцах EBUS-TBNA) (7) и примерно 80% в плазме (ТМБ крови, рТМБ) (3).

Присутствие вкДНК в нескольких биологических жидкостях и возможность обнаружения представляющих интерес мутаций (обычно нацеленных только на EGFR) в этих жидкостях (моча, плевральная жидкость, спинномозговая жидкость) были четко продемонстрированы (8-12), в то время как кровь является наиболее широко изученным жидкий субстрат для биопсии при распространенном НМРЛ.

Кроме того, мы показали в экспериментальном исследовании, исследуя различные образцы FNA у ограниченного числа пациентов, что супернатант цитологических образцов (обычно выбрасываемый) является богатым источником ДНК. Наши результаты показывают, что свободная от надосадочной ДНК ДНК (sfDNA) может использоваться для генотипирования исходного уровня и резистентности (13).