具有不一致癌症病史的家庭的基因组分析
这项研究的目的是确定新的基因突变,这些突变导致了重要的个人和家族癌症史。 患有和未患有癌症的成年人将被纳入研究。 参与者有资格参加这项研究,因为他们的家人中有人被诊断出患有癌症,或者因为他们自己被诊断出患有癌症。
将从血液样本中获取参与者的 DNA 和其他临床信息,以研究癌症和相关并发症的遗传基础。 将研究 DNA 中编码蛋白质的所有部分(即外显子组)。 还可以收集参与者的 DNA 样本和有关家庭结构、家族病史和种族起源的信息,以更好地了解这些信息。 临床信息将被存储,生物样本(包括 DNA)将在收集后最多保存三 (3) 年以备将来使用。 最终,一旦确定,特定遗传学变化在遗传性癌症发展中的作用将得到表征。
研究概览
详细说明
本研究的数据将通过回顾性和前瞻性获得。 具有提示已知遗传综合征或符合国家综合癌症网络 (NCCN) 标准的家族史的受影响个体(患有癌症)将从常规临床护理中累积,以使用多癌症组形成诊断率的“真实世界”基线。 这些参与者将不会额外同意 WES 作为临床研究的一部分。
其他被确定为有五个或更多患有不一致癌症的亲属的受影响个体将接受护理标准 (SOC) 多癌症小组。 未发现任何突变的家庭(至少有 2 名成员患有癌症,1 名没有)将被考虑进行额外的测序,作为本研究描述新型遗传性癌症综合征的主要目标的一部分。
如果在癌症遗传学诊所(即 指数患者)同意并且他们的家人表示对研究感兴趣,他们将继续进行研究访视 1。 在这次访问期间,将解释系谱信息和病史,核实同意,并提供个人遗传咨询。 个人将决定是否通知他们的基因组中存在偶然发现。
将完成实验室申请以方便抽血和 DNA 提取/存储,并完成 WES 分析。 任何确定的感兴趣的单基因变异都将发送给具有临床实验室改进修正案 (CLIA)/美国病理学家学院 (CAP) 认证的行业合作伙伴进行验证。
研究访问 2 将在接下来的 6 个月内完成,届时将与参与者讨论任何确定的感兴趣的单基因变异。 如果接受生殖系高功能影响 (gHFI) 变异计数的人比一般人群多或少,他们将收到通知。 必要时将进行适当的遗传咨询、复发风险和额外的临床转诊。 参与者将收到任何美国医学遗传学学院偶然发现的二元是/否通知,并将进行常规临床遗传学随访预约
该研究的主要目的是确定与普遍癌症易感性相关的新基因变异,这种易感性表现为多种原发性肿瘤的个人史或不一致癌症的家族史。 这将通过探索性研究级(即未经 CLIA/CAP 认证)全外显子组测序 (WES) 研究提供给具有不一致癌症家族史的患者/家族,作为 SOC 临床遗传学评估的辅助手段,以便在临床上描述新的综合征癌症易感性的表现。 支持普遍癌症易感性的可疑种系变异将在 CLIA/CAP 认证实验室进一步验证,然后再报告给患者的病历
研究类型
注册 (估计的)
阶段
- 不适用
联系人和位置
学习联系方式
- 姓名:Anna Mitchell, MD PhD
- 电话号码:1-800-641-2422
- 邮箱:CTUReferral@UHhospitals.org
学习地点
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Ohio
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Cleveland、Ohio、美国、44106
- 招聘中
- University Hospitals Cleveland Medical Center, Case Comprehensive Cancer Center
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接触:
- Anna Mitchell, MD, PhD
- 电话号码:800-641-2422
- 邮箱:CTUReferral@UHhospitals.org
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首席研究员:
- Anna Mitchell, MD, PhD
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
接受健康志愿者
取样方法
研究人群
- 家族史暗示了一种已知的遗传癌综合症
- 有5个或更多不一致的癌症诊断的亲戚
描述
纳入标准:
具有提示已知遗传性综合征家族史或符合 NCCN 种系检测标准并同意多癌症小组的受累患者
--这个队列是指接受常规护理标准的真实世界对照组,不符合 WES 的条件。
受影响的患者在第 3 代谱系中单侧遗传有 5 种或更多不一致癌症的家族史。
- 只要至少 2 名受影响的家庭成员和 1 名未受影响的家庭成员同意 WES 作为试验参与者,此类亲属中未受影响的家庭成员将有资格获得 WES。
排除标准:
- 无法安全地提供血液样本进行基因检测
- 无法通过电话、视频会议或亲自接受遗传咨询
- 已知分离先前通过常规医学遗传学评估确定的高外显率癌症易感基因的家庭不符合 WES 资格
- 家庭不适合常规医学遗传学 SOC 遗传学评估。
学习计划
研究是如何设计的?
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
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患有5种或更多不一致的癌症的参与者-WES
患有5个或更多不一度癌症的家族病史单侧血统的受影响的个体将接受SOC CLIA/CAP多层型面板(通过抽血或打孔活检收集的DNA),以检查单基因变异诊断产量。 合格的参与者(没有突变的家庭,至少有2个受影响的家庭和1名不受影响的家庭成员)可能会与WES一起前进。 任何发现的单基因变体都将发送给具有CLIA/CAP认证验证的行业合作伙伴。 将进行为期6个月的随访访问,在此期间将讨论变体,并将解释进行GHFI变体计数的参与者(那些未被视为基因候选者)的参与者将有结果解释。 必要的 |
测序将在 Illumina 测序系统上进行
抽血将通过任何大学医院实验室站点进行,并在室温下通过快递发送到人类遗传学中心 (CHG) 实验室
通过 3 毫米穿刺活检获得的皮肤样本将悬浮在按照 CHG 常规制备的细胞培养基中,并通过快递发送到人类遗传学实验室中心
参与者将提供唾液样本,在室温下将其运送到大学医院实验室
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SOC遗传咨询(常规临床护理)
患有家族史的受影响的个体(癌症)提示已知的遗传综合征或满足NCCN种系测试标准,将接受SOC CLIA/CAP多层板面板,以检查单基因变异诊断产量(回顾性数据) 该部门还包括来自“ 5个或更多不和谐癌症”组的潜在参与者,他们确实确定了变体,因此没有继续进行WES。 |
抽血将通过任何大学医院实验室站点进行,并在室温下通过快递发送到人类遗传学中心 (CHG) 实验室
通过 3 毫米穿刺活检获得的皮肤样本将悬浮在按照 CHG 常规制备的细胞培养基中,并通过快递发送到人类遗传学实验室中心
参与者将提供唾液样本,在室温下将其运送到大学医院实验室
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研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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具有 5 种或更多不一致癌症家族史且具有可通过 WES 测序识别的单基因种系变异的参与者人数
大体时间:基线平均 1.5 小时
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具有 5 种或更多不一致癌症家族史且具有可通过 WES 测序识别的单基因种系变异的参与者人数 单基因种系变异的诊断率将计算为每个类别中单基因致病变异的发现率(即 10 个致病变异/30 个家族 = 33% 的产率)。 将进行双向方差分析,零假设是“支持已知综合征与不一致癌症的家族史不会显着影响诊断率” |
基线平均 1.5 小时
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GHFI 变体的数量
大体时间:基线平均 1.5 小时
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与人群平均值相比,具有 5 个或更多不一致家族史且 WES 未发现单基因致病性种系变异的参与者的 gHFI 变异数 将此类家族成员中 gHFI 变异的数量和未诊断出癌症的人与诊断出癌症的人进行比较 |
基线平均 1.5 小时
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两组单基因种系变异的诊断率
大体时间:基线平均 1.5 小时
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使用多癌症组对第 I 组(常规真实世界临床实践)与第 II 组(5 个或更多癌症诊断不一致的亲属)的单基因种系变异的诊断率 单基因种系变异的诊断率将计算为每个类别中单基因致病变异的发现率(即 10 个致病变异/30 个家族 = 33% 的产率)。 将进行双向方差分析,零假设是“支持已知综合征与不一致癌症的家族史不会显着影响诊断率” |
基线平均 1.5 小时
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合作者和调查者
调查人员
- 首席研究员:Anna Mitchell, MD PhD、University Hospitals Cleveland Medical Center, Case Comprehensive Cancer Center
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (实际的)
初级完成 (估计的)
研究完成 (估计的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (估计的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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