Genomická analýza rodin s historií nesouhlasných rakovin

Data pro tuto studii budou získávána jak retrospektivně, tak prospektivně. Postižení jedinci (kteří mají rakovinu) s rodinnou anamnézou naznačující známý dědičný syndrom nebo splňující kritéria National Comprehensive Cancer Network (NCCN) budou nashromážděni z rutinní klinické péče, aby vytvořili „skutečný svět“ základní čáru diagnostického výnosu pomocí multikancerogenního panelu. Tito účastníci nebudou dodatečně schváleni pro WES jako součást klinické studie.

Ostatní postižení jedinci, u nichž bylo zjištěno, že mají pět nebo více příbuzných s nesouhlasnými druhy rakoviny, obdrží panel standardní péče (SOC) pro multikancerózu. Rodiny bez jakýchkoli identifikovaných mutací (s alespoň 2 členy s rakovinou, 1 bez) budou zvažovány pro další sekvenování jako součást primárního cíle této studie, kterým je popis nových dědičných rakovinových syndromů.

Pokud je jedinec hodnocen na klinice genetiky rakoviny (tj. indexový pacient) souhlasí a jejich rodinní příslušníci projeví zájem o studii, přejdou na studijní návštěvu 1. Během této návštěvy budou vysvětleny informace o původu a zdravotní historie, bude ověřen souhlas a poskytnuto individuální genetické poradenství. Jednotlivci se rozhodnou, zda budou nebo nebudou informováni, že v jejich genomech existují náhodné nálezy.

Bude provedena laboratorní rekvizice, aby se usnadnily odběry krve a bude dokončena extrakce/skladování DNA a analýza WES. Jakékoli identifikované monogenní varianty, které jsou předmětem zájmu, budou zaslány průmyslovému partnerovi s certifikací Clinical Laboratory Improvement Accessories (CLIA)/College of American Pathologists (CAP) k ověření.

Studijní návštěva 2, která má být dokončena během následujících 6 měsíců, na které budou s účastníkem prodiskutovány jakékoli identifikované monogenetické varianty, které jsou předmětem zájmu. Ti, kteří podstupují počítání variant s vysokým funkčním dopadem zárodečné linie (gHFI), budou informováni, pokud mají více nebo méně než běžná populace. V případě potřeby bude poskytnuto vhodné genetické poradenství, riziko recidivy a další klinická doporučení. Účastníci budou informováni binárním ano/ne o jakýchkoli náhodných nálezech American College of Medical Genetics a bude sjednáno rutinní následné vyšetření klinické genetiky.

Primárním cílem studie je identifikovat nové genové varianty spojené s generalizovanou náchylností k rakovině, která se projevuje jako osobní anamnéza mnohočetných primárních nádorů nebo rodinná anamnéza nesouhlasných rakovin. To bude provedeno prostřednictvím průzkumných studií výzkumného stupně (tj. NEcertifikované CLIA/CAP) úplných exomových sekvenačních studií (WES) poskytovaných pacientům/rodinám s rodinnou anamnézou nesouhlasných rakovin jako doplněk ke klinickému genetickému hodnocení SOC s cílem klinicky popsat nový syndrom projevy náchylnosti k rakovině. Podezřelé zárodečné varianty podporující generalizovanou náchylnost k rakovině budou dále validovány v laboratoři s certifikací CLIA/CAP, než budou nahlášeny do pacientovy lékařské tabulky