Analiza genomowa rodzin z historią niezgodnych nowotworów
Celem tego badania jest identyfikacja nowych mutacji genów, które przyczyniły się do znaczącej osobistej i rodzinnej historii raka. Do badania zostaną włączeni dorośli z rakiem i bez raka. Uczestnicy kwalifikują się do wzięcia udziału w tym badaniu, ponieważ ktoś z ich rodziny został zdiagnozowany lub ponieważ oni sami mają diagnozę raka.
DNA uczestników i inne informacje kliniczne zostaną uzyskane z próbki krwi w celu zbadania genetycznego podłoża raka i związanych z nim powikłań. Zbadane zostaną wszystkie części DNA, które kodują białka (tj. egzom). W celu lepszego zrozumienia tych informacji można również pobrać próbkę DNA uczestnika oraz informacje o strukturze rodziny, historii medycznej rodziny i pochodzeniu etnicznym. Informacje kliniczne będą przechowywane, a próbki biologiczne, w tym DNA, będą przechowywane przez maksymalnie trzy (3) lata po pobraniu na przyszłość. Ostatecznie, po zidentyfikowaniu, scharakteryzowana zostanie rola określonych zmian genetycznych w rozwoju dziedzicznego nowotworu(-ów).
Przegląd badań
Status
Warunki
Szczegółowy opis
Dane do tego badania zostaną uzyskane zarówno retrospektywnie, jak i prospektywnie. Osoby dotknięte chorobą (które mają raka) z historią rodzinną sugerującą znany zespół dziedziczny lub spełniające kryteria National Comprehensive Cancer Network (NCCN) zostaną naliczone z rutynowej opieki klinicznej, aby stworzyć „rzeczywistą” linię bazową wydajności diagnostycznej przy użyciu panelu wielu nowotworów. Ci uczestnicy nie otrzymają dodatkowej zgody na WES w ramach badania klinicznego.
Inne osoby dotknięte chorobą, u których zidentyfikowano pięciu lub więcej krewnych z niezgodnymi nowotworami, otrzymają panel wielonowotworowy standardowej opieki (SOC). Rodziny bez zidentyfikowanych mutacji (z co najmniej 2 członkami z rakiem, 1 bez) zostaną uwzględnione w dodatkowym sekwencjonowaniu w ramach głównego celu tego badania, jakim jest opisanie nowych dziedzicznych zespołów nowotworowych.
Jeśli osoba poddawana ocenie w klinice genetyki raka (tj. pacjent indeksowy) wyrazi zgodę, a członkowie jego rodziny wyrażą zainteresowanie badaniem, przejdą na wizytę studyjną 1. Podczas tej wizyty wyjaśnione zostaną informacje o rodowodzie i historii medycznej, zweryfikowana zgoda i zapewnione indywidualne poradnictwo genetyczne. Osoby same zdecydują, czy chcą być powiadamiane o przypadkowych odkryciach w ich genomach.
Zostaną sporządzone zamówienia laboratoryjne, aby ułatwić pobieranie krwi i ekstrakcję/przechowywanie DNA oraz analizę WES. Wszelkie zidentyfikowane warianty monogenowe będące przedmiotem zainteresowania zostaną przesłane do partnera branżowego posiadającego certyfikat Clinical Laboratory Improvement Improvement (CLIA)/College of American Pathologists (CAP) w celu zatwierdzenia.
Wizyta studyjna 2 do zrealizowania w ciągu najbliższych 6 miesięcy, podczas której wszelkie zidentyfikowane warianty monogenetyczne będące przedmiotem zainteresowania zostaną omówione z uczestnikiem. Osoby przechodzące liczenie wariantów Germline High Functional Impact (gHFI) zostaną powiadomione, jeśli mają więcej lub mniej niż populacja ogólna. Odpowiednie poradnictwo genetyczne, ryzyko nawrotu i dodatkowe skierowania kliniczne zostaną wykonane w razie potrzeby. Uczestnicy zostaną powiadomieni binarnym tak/nie o wszelkich przypadkowych ustaleniach American College of Medical Genetics i zostanie wyznaczona rutynowa wizyta kontrolna w zakresie genetyki klinicznej
Głównym celem badania jest identyfikacja nowych wariantów genów związanych z uogólnioną podatnością na raka, która przejawia się jako osobista historia wielu pierwotnych guzów lub historia rodzinna niezgodnych nowotworów. Odbędzie się to poprzez odkrywcze badania stopnia naukowego (tj. NIE posiadające certyfikatu CLIA/CAP) z sekwencjonowaniem całego egzomu (WES) dostarczane pacjentom/rodzinom z historią rodzinną niezgodnych nowotworów jako uzupełnienie oceny genetyki klinicznej SOC w celu klinicznego opisania nowych syndromów przejawy podatności na raka. Podejrzane warianty linii zarodkowej potwierdzające uogólnioną podatność na raka zostaną poddane dalszej walidacji w laboratorium certyfikowanym przez CLIA/CAP, zanim zostaną zgłoszone do karty medycznej pacjenta
Typ studiów
Zapisy (Szacowany)
Faza
- Nie dotyczy
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Anna Mitchell, MD PhD
- Numer telefonu: 1-800-641-2422
- E-mail: CTUReferral@UHhospitals.org
Lokalizacje studiów
-
-
Ohio
-
Cleveland, Ohio, Stany Zjednoczone, 44106
- Rekrutacyjny
- University Hospitals Cleveland Medical Center, Case Comprehensive Cancer Center
-
Kontakt:
- Anna Mitchell, MD, PhD
- Numer telefonu: 800-641-2422
- E-mail: CTUReferral@UHhospitals.org
-
Główny śledczy:
- Anna Mitchell, MD, PhD
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
- Historia rodziny sugeruje znany dziedziczny zespół raka
- 5 lub więcej krewnych z niezgodnymi diagnozami raka
Opis
Kryteria przyjęcia:
Pacjent dotknięty chorobą z wywiadem rodzinnym sugerującym znany zespół dziedziczny lub spełniający kryteria NCCN dotyczące badania linii zarodkowej i wyrażający zgodę na panel wielonowotworowy
-- Ta kohorta jest pomyślana jako grupa kontrolna ze świata rzeczywistego, otrzymująca rutynową standardową opiekę i nie kwalifikująca się do WES.
Pacjent dotknięty chorobą, u którego w rodzinie występowało 5 lub więcej niezgodnych przypadków raka o jednostronnym pochodzeniu w 3-pokoleniowym rodowodzie.
- Niedotknięci członkowie rodziny w ramach takich pokrewieństw będą kwalifikować się do WES, o ile co najmniej 2 dotkniętych chorobą i 1 zdrowy członek rodziny wyrazi zgodę na WES jako uczestnicy badania.
Kryteria wyłączenia:
- Nie można bezpiecznie dostarczyć próbki krwi do badań genetycznych
- Niemożność otrzymania lub odmowa otrzymania poradnictwa genetycznego przez telefon, wideokonferencję lub osobiście
- Rodziny, o których wiadomo, że segregują wcześniej zidentyfikowany gen podatności na raka o wysokiej penetracji, zidentyfikowany w rutynowej ocenie genetyki medycznej, nie kwalifikują się do WES
- Rodzina nie podlega rutynowej ocenie genetyki medycznej SOC.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Dotkniętych uczestników z 5 lub więcej niezgodnymi nowotworami - WES
Dotknięte osoby z rodzinną historią 5 lub więcej niezgodnych nowotworów w jednostronnym pochodzeniu z rodowacją 3-generacji otrzymają panel wielomarowy SOC CLIA/CAP (DNA zebrane za pomocą losowania krwi lub biopsji uderzenia) w celu zbadania plonu diagnostycznego wariantu monogenicznego. Kwalifikujący się uczestnicy (rodziny bez mutacji i co najmniej 2 dotkniętych i 1 nie dotkniętych członków rodziny) mogą iść naprzód z WES. Wszelkie zidentyfikowane monogeniczne warianty zainteresowania zostaną wysłane do partnera branżowego z certyfikatem CLIA/CAP w celu walidacji. Odbywa się 6-miesięczna wizyta obserwacyjna, podczas której zostaną omówione warianty, a uczestnicy, którzy przeszli liczenie wariantu GHFI (ci, którzy nie zostali uznani za kandydata genowego), wyjaśnią wyniki. Odpowiednie porady genetyczne, ryzyko nawrotu i dodatkowe skierowania kliniczne zostaną w razie potrzeby dokonywane |
Sekwencjonowanie zostanie przeprowadzone w systemie sekwencjonowania Illumina
Pobieranie krwi odbędzie się za pośrednictwem dowolnego laboratorium Szpitala Uniwersyteckiego i zostanie wysłane w temperaturze pokojowej kurierem do laboratorium Centrum Genetyki Człowieka (CHG)
Próbki skóry pobrane za pomocą biopsji 3 mm zostaną zawieszone w pożywce do hodowli komórkowej przygotowanej zgodnie z procedurą CHG i wysłane kurierem do Centrum Laboratorium Genetyki Człowieka
Uczestnik dostarczy próbkę śliny, która zostanie wysłana do Laboratorium Szpitala Uniwersyteckiego w temperaturze pokojowej
|
|
SOC Genetyczna poradnictwo (rutynowa opieka kliniczna)
Dotknięte osoby (rak) z historią rodzinną sugerującą znany zespół dziedziczny lub spełnienie kryteriów NCCN do testowania linii zarodkowej otrzymają panel wielomarowy SOC CLIA/CAP w celu zbadania plonu diagnostycznego wariantu monogenicznego (dane retrospektywne) Ramię to obejmowałyby również potencjalnych uczestników z grupy „5 lub więcej niezgodnych nowotworów”, którzy mieli zidentyfikowany wariant i dlatego nie przeszedł do WES. |
Pobieranie krwi odbędzie się za pośrednictwem dowolnego laboratorium Szpitala Uniwersyteckiego i zostanie wysłane w temperaturze pokojowej kurierem do laboratorium Centrum Genetyki Człowieka (CHG)
Próbki skóry pobrane za pomocą biopsji 3 mm zostaną zawieszone w pożywce do hodowli komórkowej przygotowanej zgodnie z procedurą CHG i wysłane kurierem do Centrum Laboratorium Genetyki Człowieka
Uczestnik dostarczy próbkę śliny, która zostanie wysłana do Laboratorium Szpitala Uniwersyteckiego w temperaturze pokojowej
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Liczba uczestników z historią rodzinną 5 lub więcej niezgodnych nowotworów, które mają monogenowe warianty linii płciowej możliwe do zidentyfikowania za pomocą sekwencjonowania WES
Ramy czasowe: Na linii podstawowej przez średnio 1,5 godziny
|
Liczba uczestników z historią rodzinną 5 lub więcej niezgodnych nowotworów, które mają monogenowe warianty linii płciowej możliwe do zidentyfikowania za pomocą sekwencjonowania WES Wydajność diagnostyczna jednogenowych wariantów linii zarodkowej zostanie obliczona jako wskaźnik wykrycia jednogenowego wariantu patogennego w ramach każdej kategorii (tj. 10 wariantów patogennych / 30 rodzin = 33% współczynnika wydajności). Zostanie przeprowadzona dwukierunkowa analiza ANOVA z hipotezą zerową, zgodnie z którą „wywiad rodzinny potwierdzający znany zespół w porównaniu z niezgodnymi nowotworami nie wpływa znacząco na wydajność diagnostyczną” |
Na linii podstawowej przez średnio 1,5 godziny
|
|
Liczba wariantów gHFI
Ramy czasowe: Na linii podstawowej przez średnio 1,5 godziny
|
Liczba wariantów gHFI u uczestników z historią rodzinną 5 lub więcej niezgodnych i bez zidentyfikowanych monogenicznych patogennych wariantów linii zarodkowej w WES w porównaniu ze średnimi populacji Liczba wariantów gHFI u członków rodziny w obrębie takich pokrewieństw i brak rozpoznania raka będą w porównaniu z osobami z rozpoznaniem raka |
Na linii podstawowej przez średnio 1,5 godziny
|
|
Wydajność diagnostyczna dla monogenicznych wariantów linii zarodkowej w dwóch ramionach
Ramy czasowe: Na linii podstawowej przez średnio 1,5 godziny
|
Wydajność diagnostyczna dla monogenicznych wariantów linii zarodkowej w ramieniu I (rutynowa praktyka kliniczna w świecie rzeczywistym) w porównaniu z ramieniem II (5 lub więcej krewnych z niezgodnymi diagnozami raka) przy użyciu paneli dotyczących wielu nowotworów Wydajność diagnostyczna jednogenowych wariantów linii zarodkowej zostanie obliczona jako wskaźnik wykrycia jednogenowego wariantu patogennego w ramach każdej kategorii (tj. 10 wariantów patogennych / 30 rodzin = 33% współczynnika wydajności). Zostanie przeprowadzona dwukierunkowa analiza ANOVA z hipotezą zerową, zgodnie z którą „wywiad rodzinny potwierdzający znany zespół w porównaniu z niezgodnymi nowotworami nie wpływa znacząco na wydajność diagnostyczną” |
Na linii podstawowej przez średnio 1,5 godziny
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Śledczy
- Główny śledczy: Anna Mitchell, MD PhD, University Hospitals Cleveland Medical Center, Case Comprehensive Cancer Center
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Szacowany)
Ukończenie studiów (Szacowany)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Szacowany)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- CASE13Z20
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Opis planu IPD
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
produkt wyprodukowany i wyeksportowany z USA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .