Genomische analyse van families met een voorgeschiedenis van tegenstrijdige kankers
Het doel van deze studie is het identificeren van nieuwe genmutaties die hebben bijgedragen aan een significante persoonlijke en familiegeschiedenis van kanker. Volwassenen met en zonder kanker zullen worden toegerekend aan de studie. Deelnemers komen in aanmerking voor deelname aan dit onderzoek omdat iemand in hun familie de diagnose kanker heeft gekregen of omdat ze zelf de diagnose kanker hebben.
Het DNA van de deelnemers en andere klinische informatie wordt verkregen uit een bloedmonster om de genetische basis van kanker en gerelateerde complicaties te bestuderen. Alle delen van het DNA die coderen voor eiwitten (d.w.z. het exoom) zullen worden bestudeerd. Er kunnen ook DNA-monsters van deelnemers en informatie over de gezinsstructuur en medische familiegeschiedenis en etnische afkomst worden verzameld om deze informatie beter te begrijpen. Klinische informatie wordt opgeslagen en biologische monsters, inclusief DNA, worden tot drie (3) jaar na verzameling bewaard voor de toekomst. Uiteindelijk zal, eenmaal geïdentificeerd, de rol van de specifieke genetische veranderingen in de ontwikkeling van erfelijke kanker(s) worden gekarakteriseerd.
Studie Overzicht
Toestand
Conditie
Gedetailleerde beschrijving
Gegevens voor deze studie zullen zowel retrospectief als prospectief worden verkregen. Getroffen personen (die kanker hebben) met een familiegeschiedenis die wijst op een bekend erfelijk syndroom of die voldoen aan de criteria van het National Comprehensive Cancer Network (NCCN), zullen worden opgebouwd uit routinematige klinische zorg om een "echte wereld" basislijn van diagnostische opbrengst te vormen met behulp van een multikankerpanel. Deze deelnemers krijgen geen extra toestemming voor WES als onderdeel van de klinische studie.
Andere getroffen personen waarvan is vastgesteld dat ze vijf of meer familieleden hebben met disharmonische kankers, zullen een standaardzorgpanel (SOC) voor meerdere kankers ontvangen. Families zonder enige geïdentificeerde mutaties (met ten minste 2 leden met kanker, 1 zonder) zullen worden overwogen voor aanvullende sequentiebepaling als onderdeel van het primaire doel van deze studie, namelijk het beschrijven van nieuwe erfelijke kankersyndromen.
Als de persoon die wordt geëvalueerd in de kliniek voor kankergenetica (d.w.z. index patiënt) toestemming en hun familieleden interesse tonen in de studie, gaan ze verder met studiebezoek 1. Tijdens dit bezoek wordt stamboominformatie en medische geschiedenis uitgelegd, toestemming geverifieerd en individueel erfelijkheidsadvies gegeven. Individuen zullen beslissen of ze wel of niet op de hoogte willen worden gebracht van nevenbevindingen in hun genomen.
Er zal een laboratoriumaanvraag worden gedaan om bloedafnames en DNA-extractie/-opslag te vergemakkelijken en WES-analyse zal worden voltooid. Alle geïdentificeerde monogene varianten die van belang zijn, worden ter validatie naar een branchepartner met Clinical Laboratory Improvement Amendments (CLIA)/College of American Pathologists (CAP)-certificering gestuurd.
Studiebezoek 2, af te ronden binnen de komende 6 maanden, waarbij geïdentificeerde interessante monogenetische varianten met de deelnemer worden besproken. Degenen die een Germline High Functional Impact (gHFI) varianttelling ondergaan, zullen op de hoogte worden gebracht als ze meer of minder hebben dan de algemene bevolking. Passende erfelijkheidsadvisering, herhalingsrisico en aanvullende klinische verwijzingen zullen indien nodig worden gedaan. Deelnemers worden met een binair ja/nee op de hoogte gebracht van eventuele incidentele bevindingen van het American College of Medical Genetics en er wordt een routinematige afspraak voor klinische genetica-vervolgafspraken gemaakt
Het primaire doel van de studie is om nieuwe genvarianten te identificeren die geassocieerd zijn met gegeneraliseerde vatbaarheid voor kanker die zich manifesteert als een persoonlijke geschiedenis van meerdere primaire tumoren of een familiegeschiedenis van tegenstrijdige kankers. Dit zal worden gedaan door middel van verkennende onderzoeken van onderzoekskwaliteit (dwz NIET CLIA/CAP-gecertificeerd) hele exome sequencing (WES)-onderzoeken die worden verstrekt aan patiënten/families met een familiegeschiedenis van tegenstrijdige kankers als aanvulling op de SOC klinische genetica-evaluatie om nieuwe syndromale kankers klinisch te beschrijven. manifestaties van vatbaarheid voor kanker. Verdachte kiembaanvarianten die een gegeneraliseerde vatbaarheid voor kanker ondersteunen, zullen verder worden gevalideerd in een CLIA/CAP-gecertificeerd laboratorium voordat ze worden gerapporteerd aan de medische kaart van de patiënt
Studietype
Inschrijving (Geschat)
Fase
- Niet toepasbaar
Contacten en locaties
Studiecontact
- Naam: Anna Mitchell, MD PhD
- Telefoonnummer: 1-800-641-2422
- E-mail: CTUReferral@UHhospitals.org
Studie Locaties
-
-
Ohio
-
Cleveland, Ohio, Verenigde Staten, 44106
- Werving
- University Hospitals Cleveland Medical Center, Case Comprehensive Cancer Center
-
Contact:
- Anna Mitchell, MD, PhD
- Telefoonnummer: 800-641-2422
- E-mail: CTUReferral@UHhospitals.org
-
Hoofdonderzoeker:
- Anna Mitchell, MD, PhD
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
- Familiegeschiedenis suggereert een bekend erfelijk kankersyndroom
- 5 of meer familieleden met diagnoses van discordante kanker
Beschrijving
Inclusiecriteria:
Getroffen patiënt met een familiegeschiedenis die wijst op een bekend erfelijk syndroom of die voldoet aan de NCCN-criteria voor kiembaantesten en toestemming voor een multikankerpanel
--Dit cohort is bedoeld als een controlegroep in de echte wereld die routinematige standaardzorg krijgt en komt niet in aanmerking voor WES.
Getroffen patiënt met een familiegeschiedenis van 5 of meer tegenstrijdige kankers in unilaterale afstamming binnen een stamboom van 3 generaties.
- Niet-aangetaste familieleden binnen dergelijke verwantschappen komen in aanmerking voor WES zolang minimaal 2 getroffen en 1 niet-aangetaste gezinsleden instemmen met WES als proefdeelnemers.
Uitsluitingscriteria:
- Niet in staat om veilig een bloedmonster te verstrekken voor genetische tests
- Kan geen genetische counseling ontvangen of weigeren via de telefoon, videoconferentie of persoonlijk
- Families waarvan bekend is dat ze een eerder geïdentificeerd gen met een hoge penetrantie voor kankergevoeligheid scheiden dat is geïdentificeerd door middel van routinematige medische genetica-evaluatie, komen niet in aanmerking voor WES
- Familie is niet vatbaar voor routinematige medische genetica SOC genetica-evaluatie.
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Getroffen deelnemers met 5 of meer discordante kankers - wes
Getroffen personen met een familiegeschiedenis van 5 of meer discordante kankers in unilaterale afkomst met een stamboom van 3 generatie ontvangt SOC CLIA/CAP multicancer panel (DNA verzameld via bloedafname of punch biopsie) om monogene variant diagnostische opbrengst te onderzoeken. In aanmerking komende deelnemers (families zonder mutaties en ten minste 2 getroffen en 1 niet-getroffen familieleden) kunnen verder gaan met Wes. Elke geïdentificeerde monogene varianten van interesse zullen worden verzonden naar een industriële partner met CLIA/CAP -certificering voor validatie. Een follow-upbezoek van 6 maanden zal plaatsvinden waarbij varianten worden besproken en deelnemers die GHFI-variant tellen (degenen die niet als een genkandidaat werden beschouwd) zullen resultaten hebben verklaard. Passende genetische counseling, recidiefrisico en aanvullende klinische verwijzingen zullen als noodzakelijk worden gemaakt |
Sequencing zal worden uitgevoerd op een Illumina sequencing systeem
De bloedafname vindt plaats via elke locatie van het Universitair Ziekenhuis Laboratorium en wordt op kamertemperatuur per koerier verzonden naar het Centrum voor Menselijke Erfelijkheid (CHG) Laboratorium
Huidmonsters verkregen via 3 mm ponsbiopsie zullen worden gesuspendeerd in celkweekmedia die zijn voorbereid volgens de CHG-routine en per koerier worden verzonden naar het Centrum voor Menselijke Erfelijkheid
De deelnemer levert een speekselmonster dat op kamertemperatuur wordt verzonden naar de locatie van het Universitair Ziekenhuis Laboratorium
|
|
SOC genetische counseling (routine klinische zorg)
Getroffen personen (kanker) met een familiegeschiedenis die suggereert dat een bekend erfelijk syndroom of voldoet aan NCCN -criteria voor kiemlijntests, ontvangen SOC CLIA/CAP multicancer panel om monogene variant diagnostische opbrengst (retrospectieve gegevens) te onderzoeken (retrospectieve gegevens) Deze arm zou ook potentiële deelnemers van de groep "5 of meer discordante kanker" omvatten die een variant had geïdentificeerd en daarom niet doorging naar Wes. |
De bloedafname vindt plaats via elke locatie van het Universitair Ziekenhuis Laboratorium en wordt op kamertemperatuur per koerier verzonden naar het Centrum voor Menselijke Erfelijkheid (CHG) Laboratorium
Huidmonsters verkregen via 3 mm ponsbiopsie zullen worden gesuspendeerd in celkweekmedia die zijn voorbereid volgens de CHG-routine en per koerier worden verzonden naar het Centrum voor Menselijke Erfelijkheid
De deelnemer levert een speekselmonster dat op kamertemperatuur wordt verzonden naar de locatie van het Universitair Ziekenhuis Laboratorium
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Aantal deelnemers met een familiegeschiedenis van 5 of meer dissonante kankers met monogene kiembaanvarianten die kunnen worden geïdentificeerd met WES-sequencing
Tijdsspanne: Bij baseline gemiddeld 1,5 uur
|
Aantal deelnemers met een familiegeschiedenis van 5 of meer dissonante kankers met monogene kiembaanvarianten die kunnen worden geïdentificeerd met WES-sequencing De diagnostische opbrengst van monogene kiembaanvarianten zal worden berekend als het ontdekkingspercentage voor een monogene pathogene variant binnen elke categorie (dwz 10 pathogene varianten / 30 families = 33% opbrengstpercentage). Er zal een 2-weg ANOVA worden uitgevoerd, met als nulhypothese dat "familiegeschiedenis die een bekend syndroom ondersteunt versus tegenstrijdige kankers geen significante invloed heeft op de diagnostische opbrengst". |
Bij baseline gemiddeld 1,5 uur
|
|
Aantal gHFI-varianten
Tijdsspanne: Bij baseline gemiddeld 1,5 uur
|
Aantal gHFI-varianten bij deelnemers met een familiegeschiedenis van 5 of meer discordante en geen geïdentificeerde monogene pathogene kiemlijnvarianten op WES in vergelijking met populatiegemiddelden Aantal gHFI-varianten bij familieleden binnen dergelijke verwanten en geen kankerdiagnoses zullen worden vergeleken met die met kankerdiagnoses |
Bij baseline gemiddeld 1,5 uur
|
|
Diagnostische opbrengst voor monogene kiembaanvarianten in twee armen
Tijdsspanne: Bij baseline gemiddeld 1,5 uur
|
Diagnostische opbrengst voor monogene kiembaanvarianten in arm I (routinematige klinische praktijk in de praktijk) versus arm II (5 of meer familieleden met tegenstrijdige kankerdiagnoses) met behulp van multikankerpanels De diagnostische opbrengst van monogene kiembaanvarianten zal worden berekend als het ontdekkingspercentage voor een monogene pathogene variant binnen elke categorie (dwz 10 pathogene varianten / 30 families = 33% opbrengstpercentage). Er zal een 2-weg ANOVA worden uitgevoerd, met als nulhypothese dat "familiegeschiedenis die een bekend syndroom ondersteunt versus tegenstrijdige kankers geen significante invloed heeft op de diagnostische opbrengst". |
Bij baseline gemiddeld 1,5 uur
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Anna Mitchell, MD PhD, University Hospitals Cleveland Medical Center, Case Comprehensive Cancer Center
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Geschat)
Studie voltooiing (Geschat)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Geschat)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- CASE13Z20
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Beschrijving IPD-plan
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
product vervaardigd in en geëxporteerd uit de V.S.
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .