Геномный анализ семей с историей дискордантных видов рака
Целью этого исследования является выявление новых генных мутаций, которые внесли свой вклад в значительный личный и семейный анамнез рака. В исследование будут включены взрослые с раком и без него. Участники имеют право на участие в этом исследовании, потому что у кого-то из членов их семьи был диагностирован рак или потому что у них самих был диагностирован рак.
ДНК участников и другая клиническая информация будут получены из образца крови для изучения генетической основы рака и связанных с ним осложнений. Будут изучены все участки ДНК, которые кодируют белки (т. е. экзом). Образец ДНК участника и информация о структуре семьи, семейной истории болезни и этническом происхождении также могут быть собраны для лучшего понимания этой информации. Клиническая информация будет храниться, а биологические образцы, включая ДНК, будут храниться до трех (3) лет после сбора на будущее. В конечном счете, после идентификации будет охарактеризована роль конкретных генетических изменений в развитии наследственного рака (раков).
Обзор исследования
Статус
Условия
Подробное описание
Данные для этого исследования будут получены как ретроспективно, так и проспективно. Пораженные лица (у которых есть рак) с семейным анамнезом, свидетельствующим об известном наследственном синдроме, или отвечающие критериям Национальной комплексной онкологической сети (NCCN), будут начисляться из рутинной клинической помощи, чтобы сформировать «реальный» базовый уровень диагностической эффективности с использованием мультиканальной панели. Эти участники не получат дополнительного согласия на WES в рамках клинического исследования.
Другие пострадавшие лица, у которых выявлено пять или более родственников с дискордантным раком, получат стандартную панель лечения (SOC) для лечения нескольких видов рака. Семьи без каких-либо выявленных мутаций (как минимум 2 члена с раком, 1 без) будут рассмотрены для дополнительного секвенирования в рамках основной цели этого исследования по описанию новых наследственных раковых синдромов.
Если человек проходит обследование в клинике генетики рака (т. индексный пациент) дает согласие и члены их семей выражают заинтересованность в исследовании, они переходят к учебному визиту 1. Во время этого визита будет объяснена информация о родословной и истории болезни, проверено согласие и предоставлено индивидуальное генетическое консультирование. Люди будут решать, следует ли им быть уведомленными о наличии случайных находок в их геномах.
Будет проведена лабораторная заявка для облегчения забора крови и извлечения/хранения ДНК, а также будет завершен анализ WES. Любые выявленные моногенные варианты, представляющие интерес, будут отправлены отраслевому партнеру с сертификацией поправок к улучшению клинических лабораторий (CLIA)/Колледжа американских патологоанатомов (CAP) для проверки.
Учебный визит 2 должен быть завершен в течение следующих 6 месяцев, во время которого любые выявленные интересующие моногенетические варианты будут обсуждаться с участником. Те, кто подвергается подсчету вариантов с высоким функциональным воздействием зародышевой линии (gHFI), будут уведомлены, если у них будет больше или меньше, чем в общей популяции. При необходимости будет проведено соответствующее генетическое консультирование, риск рецидива и дополнительные клинические направления. Участники будут уведомлены с помощью двоичного кода «да/нет» о любых случайных находках Американского колледжа медицинской генетики, и будет назначено плановое последующее посещение клинической генетики.
Основной целью исследования является выявление новых вариантов генов, связанных с генерализованной предрасположенностью к раку, которая проявляется в индивидуальном анамнезе множественных первичных опухолей или в семейном анамнезе дискордантных видов рака. Это будет сделано с помощью исследовательского уровня (т.е. НЕ сертифицированного CLIA/CAP) исследований секвенирования всего экзома (WES), которые будут предоставлены пациентам/семьям с семейным анамнезом дискордантных видов рака в качестве дополнения к клинической генетической оценке SOC для клинического описания новых синдромальных проявления предрасположенности к раку. Подозреваемые варианты зародышевой линии, поддерживающие общую предрасположенность к раку, будут дополнительно проверены в лаборатории, сертифицированной CLIA/CAP, прежде чем они будут включены в медицинскую карту пациента.
Тип исследования
Регистрация (Оцененный)
Фаза
- Непригодный
Контакты и местонахождение
Контакты исследования
- Имя: Anna Mitchell, MD PhD
- Номер телефона: 1-800-641-2422
- Электронная почта: CTUReferral@UHhospitals.org
Места учебы
-
-
Ohio
-
Cleveland, Ohio, Соединенные Штаты, 44106
- Рекрутинг
- University Hospitals Cleveland Medical Center, Case Comprehensive Cancer Center
-
Контакт:
- Anna Mitchell, MD, PhD
- Номер телефона: 800-641-2422
- Электронная почта: CTUReferral@UHhospitals.org
-
Главный следователь:
- Anna Mitchell, MD, PhD
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
Принимает здоровых добровольцев
Метод выборки
Исследуемая популяция
- Семейная история, наводящая на мысль о известном наследственном синдроме рака
- 5 или более родственников с диагнозом дискордантов рака
Описание
Критерии включения:
Пострадавший пациент с семейным анамнезом, свидетельствующим об известном наследственном синдроме, или отвечающий критериям NCCN для тестирования зародышевой линии и согласием на участие в панели множественного рака.
-- Эта когорта представляет собой реальную контрольную группу, получающую стандартную медицинскую помощь, и не имеет права на участие в программе WES.
Пораженный пациент с семейной историей 5 или более дискордантных видов рака с односторонним происхождением в родословной из 3 поколений.
- Незатронутые члены семьи в пределах таких родов будут иметь право на WES, если как минимум 2 затронутых и 1 не затронутый член семьи согласятся на WES в качестве участников испытания.
Критерий исключения:
- Невозможно безопасно предоставить образец крови для генетического тестирования
- Невозможно получить или отказаться от получения генетической консультации по телефону, видеоконференции или лично
- Семьи, о которых известно, что в них выделяется ранее идентифицированный ген предрасположенности к раку с высокой пенетрантностью, выявленный в ходе обычной медицинской генетической оценки, не подходят для участия в программе WES.
- Семья не поддается рутинной медицинской генетической оценке SOC.
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Пострадавшие участники с 5 или более дискорзами рака - WES
Пострадавшие люди с семейным анамнезом из 5 или более дискордантных раковых заболеваний при одностороннем происхождении с родословной 3-го поколения получат многоквозь панель SOC CLIA/CAP (ДНК, собранная с помощью Blood Draw или Punch Biopsy) для изучения моногенного диагностического урожайности. Приемлемые участники (семьи без мутаций и по крайней мере 2 пострадавших и 1 не затронутые члены семьи) могут двигаться вперед с WES. Любые идентифицированные моногенные варианты, представляющие интерес, будут отправлены партнеру отрасли с сертификацией CLIA/CAP для проверки. На протяжении 6-месячного последующего визита будет проведено обсуждение вариантов, и участники, которые перенесли подсчет варианта GHFI (те, кто не считался кандидатом на ген), будут объяснены результаты. Соответствующее генетическое консультирование, риск рецидивов и дополнительные клинические направления будут сделаны по мере необходимости |
Секвенирование будет проводиться на системе секвенирования Illumina.
Забор крови будет осуществляться через любую лабораторию университетской больницы и отправлен при комнатной температуре курьером в лабораторию Центра генетики человека (CHG).
Образцы кожи, полученные с помощью биопсии 3 мм, будут помещены в среду для культивирования клеток, приготовленную в соответствии с процедурой CHG, и отправлены курьером в лабораторию Центра генетики человека.
Участник предоставит образец слюны, который будет отправлен в лабораторию университетской больницы при комнатной температуре.
|
|
SOC Генетическое консультирование (обычная клиническая помощь)
Пострадавшие люди (рак) с семейной историей, наводящим на мысль об известном наследственном синдроме или соответствующих критериям NCCN для тестирования за зародышевой линии, получит группу SOC Clia/Cap Multicancer, чтобы изучить моногенный диагнозный выход варианта (ретроспективные данные) В это руку также будет включать потенциальных участников из группы «5 или более дискорзативных раковых заболеваний», у которой был выявлен вариант и, следовательно, не перешел на Уэс. |
Забор крови будет осуществляться через любую лабораторию университетской больницы и отправлен при комнатной температуре курьером в лабораторию Центра генетики человека (CHG).
Образцы кожи, полученные с помощью биопсии 3 мм, будут помещены в среду для культивирования клеток, приготовленную в соответствии с процедурой CHG, и отправлены курьером в лабораторию Центра генетики человека.
Участник предоставит образец слюны, который будет отправлен в лабораторию университетской больницы при комнатной температуре.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Количество участников с семейным анамнезом 5 или более дискордантных видов рака, которые имеют моногенные варианты зародышевой линии, идентифицируемые с помощью секвенирования WES.
Временное ограничение: На исходном уровне в среднем 1,5 часа
|
Количество участников с семейным анамнезом 5 или более дискордантных видов рака, которые имеют моногенные варианты зародышевой линии, идентифицируемые с помощью секвенирования WES. Диагностический выход моногенных вариантов зародышевой линии будет рассчитываться как частота обнаружения моногенного патогенного варианта в каждой категории (т. е. 10 патогенных вариантов / 30 семейств = 33% уровня выхода). Будет выполнен двухфакторный ANOVA с нулевой гипотезой, заключающейся в том, что «семейный анамнез, подтверждающий наличие известного синдрома по сравнению с несогласующимися видами рака, не оказывает существенного влияния на диагностическую ценность». |
На исходном уровне в среднем 1,5 часа
|
|
Количество вариантов gHFI
Временное ограничение: На исходном уровне в среднем 1,5 часа
|
Количество вариантов gHFI у участников с семейным анамнезом 5 или более дискордантных и не идентифицированных моногенных патогенных вариантов зародышевой линии на WES по сравнению со средними показателями в популяции. Количество вариантов gHFI у членов семьи в пределах таких родов и отсутствие диагноза рака будет по сравнению с теми, у кого диагноз рака |
На исходном уровне в среднем 1,5 часа
|
|
Диагностический результат для моногенных вариантов зародышевой линии в двух плечах
Временное ограничение: На исходном уровне в среднем 1,5 часа
|
Диагностический результат для моногенных вариантов зародышевой линии в группе I (рутинная реальная клиническая практика) по сравнению с группой II (5 или более родственников с несовпадающими диагнозами рака) с использованием панелей с несколькими раковыми заболеваниями Диагностический выход моногенных вариантов зародышевой линии будет рассчитываться как частота обнаружения моногенного патогенного варианта в каждой категории (т. е. 10 патогенных вариантов / 30 семейств = 33% уровня выхода). Будет выполнен двухфакторный ANOVA с нулевой гипотезой, заключающейся в том, что «семейный анамнез, подтверждающий наличие известного синдрома по сравнению с несогласующимися видами рака, не оказывает существенного влияния на диагностическую ценность». |
На исходном уровне в среднем 1,5 часа
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Следователи
- Главный следователь: Anna Mitchell, MD PhD, University Hospitals Cleveland Medical Center, Case Comprehensive Cancer Center
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Оцененный)
Завершение исследования (Оцененный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Оцененный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- CASE13Z20
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Описание плана IPD
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
продукт, произведенный в США и экспортированный из США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .