Perheiden genomianalyysi, joilla on ollut ristiriitaisia syöpiä
Tämän tutkimuksen tarkoituksena on tunnistaa uusia geenimutaatioita, jotka ovat vaikuttaneet merkittäviin henkilökohtaisiin ja suvussa esiintyviin syöpiin. Aikuiset, joilla on syöpä ja joilla ei ole syöpää, otetaan mukaan tutkimukseen. Osallistujat ovat oikeutettuja osallistumaan tähän tutkimukseen, koska joku heidän perheestään on todettu tai koska heillä itsellään on syöpädiagnoosi.
Verinäytteestä kerätään osallistujien DNA:ta ja muuta kliinistä tietoa syövän ja siihen liittyvien komplikaatioiden geneettisen perustan tutkimiseksi. Kaikki DNA:n osat, jotka koodaavat proteiineja (eli eksomi), tutkitaan. Osallistujan DNA-näyte ja tietoa perheen rakenteesta ja suvun sairaushistoriasta ja etnisestä alkuperästä voidaan myös kerätä näiden tietojen ymmärtämiseksi paremmin. Kliiniset tiedot säilytetään ja biologiset näytteet, mukaan lukien DNA, säilytetään enintään kolme (3) vuotta keräämisen jälkeen tulevaisuutta varten. Lopulta, kun ne on tunnistettu, spesifisten geneettisten muutosten rooli perinnöllisen syövän (syöpien) kehittymisessä karakterisoidaan.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Yksityiskohtainen kuvaus
Tämän tutkimuksen tiedot saadaan sekä takautuvasti että prospektiivisesti. Sairastuneet henkilöt (joilla on syöpä), joiden suvussa on viitteitä tunnettuun perinnölliseen oireyhtymään tai jotka täyttävät National Comprehensive Cancer Networkin (NCCN) kriteerit, kerätään rutiininomaisesta kliinisestä hoidosta "todellisen maailman" diagnostisen tuoton perustamiseksi käyttämällä monisyöpäpaneelia. Näille osallistujille ei myönnetä lisäksi suostumusta WES:iin osana kliinistä tutkimusta.
Muut sairaat henkilöt, joilla on vähintään viisi sukulaista, joilla on ristiriitaisia syöpiä, saavat standardihoidon (SOC) monisyöpäpaneelin. Perheet, joissa ei ole tunnistettu mutaatioita (vähintään 2 jäsentä, joilla on syöpä, 1 ilman), harkitaan lisäsekvensointia osana tämän tutkimuksen ensisijaista tavoitetta kuvata uusia perinnöllisiä syöpäoireyhtymiä.
Jos yksilöä arvioidaan syöpägenetiikkaklinikalla (esim. indeksipotilas) suostumukset ja heidän perheenjäsenensä ilmaisevat kiinnostuksensa tutkimukseen, he siirtyvät opintokäynnille 1. Tämän vierailun aikana selvitetään sukutaulutietoja ja sairaushistoriaa, vahvistetaan suostumus ja tarjotaan yksilöllistä geneettistä neuvontaa. Yksilöt päättävät, ilmoitetaanko heille, että heidän genomissaan on satunnaisia löydöksiä.
Laboratoriopyyntö tehdään verenoton ja DNA:n erottamisen/säilytyksen ja WES-analyysin helpottamiseksi. Kaikki tunnistetut kiinnostavat monogeeniset variantit lähetetään validointia varten alan kumppanille, jolla on Clinical Laboratory Improvement Changes (CLIA)/College of American Pathologists (CAP) -sertifikaatti.
Tutkimuskäynti 2, joka suoritetaan seuraavan 6 kuukauden kuluessa, jossa kaikista tunnistetuista kiinnostavista monogeneettisistä varianteista keskustellaan osallistujan kanssa. Niille, joille tehdään Germline High Functional Impact (gHFI) -muunnoslaskenta, ilmoitetaan, jos heillä on enemmän tai vähemmän kuin tavallisella väestöllä. Tarvittaessa annetaan asianmukaista geneettistä neuvontaa, uusiutumisriskiä ja muita kliinisiä lähetteitä. Osallistujille ilmoitetaan binäärisesti kyllä/ei kaikista American College of Medical Geneticsin satunnaisista löydöksistä, ja rutiininomaiseen kliinisen genetiikan seuranta-aika järjestetään.
Tutkimuksen ensisijaisena tavoitteena on tunnistaa uusia geenivariantteja, jotka liittyvät yleistyneeseen syöpäalttiuteen, joka ilmenee henkilökohtaisena useana primaarisena kasvaimena tai suvussa ristiriitaisia syöpiä. Tämä tehdään kokeellisilla, tutkimustason (eli EI CLIA/CAP-sertifioitu) WES-kokonaissekvensointitutkimuksilla, jotka tarjotaan potilaille/perheille, joiden sukuhistoriassa on ollut ristiriitaisia syöpiä, lisänä SOC:n kliinisen genetiikan arvioinnille, jotta voidaan kliinisesti kuvata uusia syndromia. syöpäalttiuden ilmenemismuotoja. Epäillyt ituradan variantit, jotka tukevat yleistä syöpäalttiutta, validoidaan edelleen CLIA/CAP-sertifioidussa laboratoriossa ennen kuin ne ilmoitetaan potilaan lääketieteelliseen karttaan
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Vaihe
- Ei sovellettavissa
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Anna Mitchell, MD PhD
- Puhelinnumero: 1-800-641-2422
- Sähköposti: CTUReferral@UHhospitals.org
Opiskelupaikat
-
-
Ohio
-
Cleveland, Ohio, Yhdysvallat, 44106
- Rekrytointi
- University Hospitals Cleveland Medical Center, Case Comprehensive Cancer Center
-
Ottaa yhteyttä:
- Anna Mitchell, MD, PhD
- Puhelinnumero: 800-641-2422
- Sähköposti: CTUReferral@UHhospitals.org
-
Päätutkija:
- Anna Mitchell, MD, PhD
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
- Perhehistoria viittaa tunnettuun perinnölliseen syöpäoireyhtymään
- 5 tai useampaa sukulaista, joilla on ristiriitainen syöpädiagnoosi
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
Sairastunut potilas, jonka sukuhistoria viittaa tunnettuun perinnölliseen oireyhtymään tai joka täyttää NCCN-kriteerit ituratatestauksessa ja suostumus monisyöpäpaneeliin
-- Tämä kohortti on tarkoitettu todellisen maailman kontrolliryhmäksi, joka saa rutiininomaista hoitoa, eikä se ole oikeutettu WES:iin.
Sairastunut potilas, jonka suvussa on esiintynyt vähintään 5 ristiriitaista syöpää yksipuolisesti 3 sukupolven sukutaulussa.
- Tällaisiin sukulaisiin kuulumattomat perheenjäsenet ovat oikeutettuja WES:iin, kunhan vähintään 2 sairastuneen perheenjäsentä ja 1 sairaan perheenjäsentä suostuvat WES:n osallistumiseen kokeeseen.
Poissulkemiskriteerit:
- Ei voida turvallisesti toimittaa verinäytettä geneettistä testausta varten
- Ei voida vastaanottaa tai kieltäytyä vastaanottamasta geneettistä neuvontaa puhelimitse, videoneuvottelussa tai henkilökohtaisesti
- Perheet, joiden tiedetään erottavan aiemmin tunnistetun korkean penetranssin syöpäalttiusgeenin, joka on tunnistettu rutiininomaisella lääketieteellisellä geneettisellä arvioinnilla, eivät ole kelvollisia WES:ään
- Perhe ei ole valmis rutiininomaiseen lääketieteellisen genetiikan SOC-genetiikan arviointiin.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Vaikuttavat osallistujat, joilla on vähintään 5 ristiriitaisia syöpiä - wes
Vaikuttavat henkilöt, joiden sukuhistoria on vähintään viisi ristiriitaista syöpää yksipuolisessa laskeutumisessa 3-sukupolven sukutaulun kanssa, saavat Soc Clia/CAP: n monikielen paneelia (DNA: ta kerätty veriveto tai rei'itysbiopsia) monogeenisen variantidiagnostiikan saannon tutkimiseksi. Tukikelpoiset osallistujat (perheet, joilla ei ole mutaatioita, ja vähintään 2 vaikuttavaa ja 1 vaikuttamaton perheenjäsentä) voivat siirtyä eteenpäin WES: n kanssa. Kaikki kiinnostavat tunnistetut monogeeniset variantit lähetetään alan kumppanille, jolla on CLIA/CAP -sertifiointi validointia varten. Kuuden kuukauden seurantavierailu tapahtuu, jonka aikana keskustellaan muunnelmista ja osallistujista, joille tehtiin GHFI-variantin laskenta (joita ei pidetty geeniehdokkaana), saadaan tulokset. Asianmukainen geneettinen neuvonta, toistumisriski ja lisäkliiniset viittaukset tehdään tarpeen mukaan |
Sekvensointi suoritetaan Illumina-sekvensointijärjestelmällä
Veri otetaan minkä tahansa yliopistollisen sairaalan laboratorion kautta ja lähetetään huoneenlämpöisenä kuriirin välityksellä Center for Human Genetics (CHG) -laboratorioon.
3 mm:n biopsialla saadut ihonäytteet suspendoidaan CHG-rutiinia kohti valmistettuun soluviljelyalustaan ja lähetetään kuriirin välityksellä Human Genetics Laboratorylle.
Osallistuja toimittaa sylkinäytteen, joka toimitetaan yliopistollisen sairaalan laboratorioon huoneenlämmössä
|
|
SOC -geneettinen neuvonta (rutiininomainen kliininen hoito)
Vaikuttavat yksilöt (syöpä), jolla on perheen historia, joka viittaa tunnettuun perinnölliseen oireyhtymään tai täyttää NCCN: n ituradan testauskriteerit, saavat Soc Clia/CAP: n monikielen paneelin monogeenisen variantidiagnostisen saannon tutkimiseksi (retrospektiivinen data) Tämä käsivarsi sisältää myös potentiaaliset osallistujat "5 tai enemmän ristiriitaisilta syöpään" -ryhmästä, jolla oli tunnistettu variantti ja siksi ei siirtynyt WES: ään. |
Veri otetaan minkä tahansa yliopistollisen sairaalan laboratorion kautta ja lähetetään huoneenlämpöisenä kuriirin välityksellä Center for Human Genetics (CHG) -laboratorioon.
3 mm:n biopsialla saadut ihonäytteet suspendoidaan CHG-rutiinia kohti valmistettuun soluviljelyalustaan ja lähetetään kuriirin välityksellä Human Genetics Laboratorylle.
Osallistuja toimittaa sylkinäytteen, joka toimitetaan yliopistollisen sairaalan laboratorioon huoneenlämmössä
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Niiden osallistujien määrä, joiden suvussa on esiintynyt vähintään 5 ristiriitaista syöpää, joilla on WES-sekvensoinnilla tunnistettavissa olevia monogeenisia ituradan variantteja
Aikaikkuna: Lähtötilanteessa keskimäärin 1,5 tuntia
|
Niiden osallistujien määrä, joiden suvussa on esiintynyt vähintään 5 ristiriitaista syöpää, joilla on WES-sekvensoinnilla tunnistettavissa olevia monogeenisia ituradan variantteja Monogeenisten ituradan varianttien diagnostinen saanto lasketaan monogeenisen patogeenisen variantin löytöasteena kussakin kategoriassa (eli 10 patogeenistä varianttia / 30 perhettä = 33 %:n saantoaste). Suoritetaan kaksisuuntainen ANOVA, jonka nollahypoteesi on, että "suvuhistoria, joka tukee tunnettua oireyhtymää vs. ristiriitaisia syöpiä, ei vaikuta merkittävästi diagnostiseen tuottoon". |
Lähtötilanteessa keskimäärin 1,5 tuntia
|
|
GHFI-muunnelmien määrä
Aikaikkuna: Lähtötilanteessa keskimäärin 1,5 tuntia
|
gHFI-varianttien määrä osallistujilla, joiden suvussa on ollut 5 tai enemmän ristiriitaisia ja joilla ei ole tunnistettuja monogeenisiä patogeenisiä ituradavariantteja WES:ssä verrattuna populaation keskiarvoihin GHFI-varianttien määrä tällaisten sukulaisten perheenjäsenillä ja ei syöpädiagnooseja verrattuna niihin, joilla on syöpädiagnoosi |
Lähtötilanteessa keskimäärin 1,5 tuntia
|
|
Diagnostinen saanto monogeenisille ituradan varianteille kahdessa haarassa
Aikaikkuna: Lähtötilanteessa keskimäärin 1,5 tuntia
|
Diagnostinen saanto monogeenisille ituradan varianteille haarassa I (rutiini todellinen kliininen käytäntö) vs. haara II (5 tai useampi sukulainen, joilla on ristiriitainen syöpädiagnoosi) käyttämällä monisyöpäpaneeleja Monogeenisten ituradan varianttien diagnostinen saanto lasketaan monogeenisen patogeenisen variantin löytöasteena kussakin kategoriassa (eli 10 patogeenistä varianttia / 30 perhettä = 33 %:n saantoaste). Suoritetaan kaksisuuntainen ANOVA, jonka nollahypoteesi on, että "suvuhistoria, joka tukee tunnettua oireyhtymää vs. ristiriitaisia syöpiä, ei vaikuta merkittävästi diagnostiseen tuottoon". |
Lähtötilanteessa keskimäärin 1,5 tuntia
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Tutkijat
- Päätutkija: Anna Mitchell, MD PhD, University Hospitals Cleveland Medical Center, Case Comprehensive Cancer Center
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Arvioitu)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- CASE13Z20
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Yhdysvalloissa valmistettu ja sieltä viety tuote
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .