通过排序解决谜题 (SIRIUS)

1. 背景和基本原理 血液病的治疗依赖于一个基本先决条件：在由造血系统引起的恶性疾病的广泛范围内进行正确分类。 随着不同但互补的诊断工具的可用性不断扩大，我们对血液病领域的了解稳步增加。 因此，通过 WHO 分类（2017 年）总结的当前共识分类代表了指导诊断算法进行正确诊断的指南针。 如今，常规诊断过程的黄金标准依赖于五个方法学支柱：细胞形态学、组织学、染色体细胞遗传学、免疫表型分析和分子遗传学检测。 这导致在绝大多数情况下能够进行诊断的治疗。 然而，从诊断的角度来看，大约 10% 的病例仍未解决，因此根据当前的 WHO 标准（2017 年），诊断结果不令人满意。 研究人员打算解决这个问题，为最好的患者护理提供有启发性的诊断指导。
2. 目标 为了解决这个问题，研究人员假设新型高通量测序方法（例如全基因组和/或全转录组测序）能够通过绘制更精细的肿瘤样本遗传肖像来提供更准确的诊断。

为此，研究人员生成了包含 5,500 个全谱血液恶性肿瘤样本的参考集合，研究人员对其进行了全基因组测序和全转录组测序。 此外，根据 WHO 分类的黄金标准诊断和所有需要的技术，所有这些都是在 MLL 中进行的，临床数据和治疗反应数据对于这些病例是完全可用的。 该参考资料集的主要优势在于每个诊断的明确性，为任何进一步的分类和诊断提供参考框架，尤其是在疑难病例中。

因此，SIRIUS 将比较 WGS 或 WTS 与结合方法与黄金标准结果的诊断优势，并将获得的结果与我们超过 5,500 个 WGS 和 WTS 的参考队列中最接近的“数字兄弟”相匹配（均在 93%个案）。 为此，研究人员将使用内部开发的匹配算法，该算法能够将基因组或转录组图谱与一组相似病例和本研究时间点的黄金标准结果进行匹配。 当前旨在从患者样本生成 WTS/WGS 数据的工作流程——同时满足最先进的认证 (ISO 15189)——最多需要 5 - 7 天。 这在很大程度上可与经典方法相媲美，但有望取代方法论工作中容易出错且费力的迭代。 目的是测试基于 WTS 和/或 WGS 的方法是否可以在诊断精度和常规可靠性方面超越经典方法。 在这里，研究人员将在诊断困难的情况下，在未来的现实环境中检验这一假设。