시퀀싱을 통한 수수께끼 풀기 (SIRIUS)

1. 배경 및 근거 혈액 질환의 치료는 조혈 시스템에서 발생하는 광범위한 악성 질환 내에서 올바른 분류라는 단일 기본 전제 조건에 의존합니다. 독특하면서도 보완적인 진단 도구의 가용성이 계속 확장됨에 따라 혈액 질환의 환경에 대한 이해가 꾸준히 증가하고 있습니다. 이와 같이 WHO 분류(2017)를 통해 요약된 현재의 합의 분류는 진단 알고리즘을 올바른 진단으로 안내하는 나침반을 나타냅니다. 오늘날 일상적인 진단 프로세스의 황금 표준은 세포 형태학, 조직학, 염색체 세포 유전학, 면역 표현형 및 분자 유전자 검사의 다섯 가지 방법론적 기둥에 의존합니다. 이것은 대부분의 경우에서 진단을 가능하게 하는 치료로 이어집니다. 그러나 약 10%의 사례는 진단적 관점에서 해결되지 않은 상태로 남아 있으므로 현재 WHO 기준(2017)에 따라 만족스러운 진단으로 이어지지 않습니다. 연구자들은 이 문제를 해결하여 최상의 환자 치료를 위한 조명 진단 지침을 제공하고자 합니다.
2. 목표 이 문제를 해결하기 위해 연구자들은 새로운 고처리량 시퀀싱 방법, 예를 들어 전체 게놈 및/또는 전체 전사체 시퀀싱이 종양 샘플의 보다 섬세한 유전적 초상화를 그리는 덕분에 보다 정확한 진단을 제공할 수 있다는 가설을 세웁니다.

이를 위해 연구자들은 전체 스펙트럼의 혈액 악성 종양이 포함된 5,500개 샘플의 참조 컬렉션을 생성했으며, 이를 위해 전체 게놈 시퀀싱과 전체 전사체 시퀀싱을 수행했습니다. 또한, MLL에서 수행되는 모든 필요한 기술, 임상 데이터 및 치료 반응 데이터를 포함하는 WHO 분류에 따른 황금 표준 진단은 이러한 경우에 완전히 사용할 수 있습니다. 이 참조 컬렉션의 주요 장점은 각 진단의 명확성으로 구성되며 특히 어려운 경우에 추가 분류 및 진단을 위한 참조 프레임워크를 제공합니다.

따라서 SIRIUS는 5,500개 이상의 WGS 및 WTS(둘 다 93%의 사례). 이를 위해 조사관은 게놈 또는 전사 프로파일을 유사한 사례 그룹에 일치시킬 수 있는 자체 개발 일치 알고리즘을 사용하고 이 연구 시점의 표준 결과를 사용할 것입니다. 최신 인증(ISO 15189)을 충족하면서 환자 샘플에서 WTS/WGS 데이터를 생성하려는 현재 워크플로는 최대 5~7일이 소요됩니다. 이것은 고전적인 방법과 대체로 비슷하지만 방법론적 작업에서 오류가 발생하기 쉽고 힘든 반복을 대체할 약속을 가지고 있습니다. 목표는 WTS 및/또는 WGS 기반 접근 방식이 진단 정밀도 및 일상적인 신뢰성과 관련하여 고전적인 방법을 능가할 수 있는지 여부를 테스트하는 것입니다. 여기서 조사관은 진단적으로 어려운 상황에서 예상되는 실제 환경에서 이 가설을 테스트합니다.