シーケンシングで謎を解く (SIRIUS)
血液悪性腫瘍におけるシーケンシングのみのアプローチの診断的優位性をテストする: 観察試験
調査の概要
詳細な説明
- 背景と理論的根拠 血液疾患の治療は、造血系に起因する悪性疾患の広範なスペクトル内での正しい分類という 1 つの基本的な前提条件に依存しています。 明確でありながら補完的な診断ツールの利用可能性が拡大し続けているため、血液疾患の状況に対する理解は着実に深まっています。 そのため、WHO 分類 (2017 年) によってまとめられた現在のコンセンサス分類は、診断アルゴリズムを正しい診断に導くコンパスを表しています。 今日、日常的な診断プロセスのゴールド スタンダードは、細胞形態学、組織学、染色体細胞遺伝学、免疫表現型検査、分子遺伝学的検査の 5 つの方法論的柱に依存しています。 これにより、大多数の症例で診断を可能にする治療が可能になります。 しかし、症例の約 10% は診断の観点から未解決のままであり、現在の WHO 基準 (2017) によると満足のいく診断には至りません。 研究者は、この問題を解決して、可能な限り最良の患者ケアのための照明的な診断ガイダンスを提供するつもりです.
- 目的 この問題に対処するために、研究者らは、全ゲノムおよび/または全トランスクリプトームシーケンシングなどの新しいハイスループットシーケンシング法が、腫瘍サンプルのより繊細な遺伝的肖像画を描くことによって、より正確な診断を提供できるという仮説を立てています。
この目的のために、研究者は血液悪性腫瘍の全スペクトルを含む 5,500 サンプルの参照コレクションを作成し、研究者は全ゲノム配列決定と全トランスクリプトーム配列決定を行いました。 さらに、すべての必要な技術を使用した WHO 分類によるゴールド スタンダード診断、すべて MLL で実行されるもの、臨床データ、および治療反応データは、これらのケースで完全に利用可能です。 この参照コレクションの主な利点は、各診断が明確であることであり、特に困難なケースでさらに分類および診断するための参照フレームワークを提供します。
したがって、SIRIUS は、WGS または WTS の診断上の優位性を、ゴールド スタンダードの結果と組み合わせたアプローチと比較し、得られた結果を 5,500 を超える WGS および WTS の参照コホート内の最も近い「デジタル兄弟」と照合します (両方とも 93% のケース)。 この目的のために、研究者は社内で開発されたマッチング アルゴリズムを使用します。このアルゴリズムは、ゲノムまたはトランスクリプトーム プロファイルを、この研究の時点からの類似のケースおよびゴールド スタンダードの結果のグループに一致させることができます。 最先端の認定 (ISO 15189) を満たしながら、患者サンプルから WTS/WGS データを生成することを目的とした現在のワークフローでは、最大 5 ~ 7 日かかります。 これは、従来の方法にほぼ匹敵しますが、方法論的な作業におけるエラーが発生しやすく困難な反復に取って代わる可能性があります。 目的は、WTS および/または WGS ベースのアプローチが、診断の精度とルーチンの信頼性に関して従来の方法を超えることができるかどうかをテストすることです。 ここで研究者は、診断が困難な状況下で、将来の現実世界の設定でこの仮説をテストします。
研究の種類
入学 (推定)
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前:Torsten Haferlach, MD
- 電話番号:+49 (0)89 99017-100
- メール:torsten.haferlach@mll.com
研究連絡先のバックアップ
- 名前:Adam Wahida, MD
- 電話番号:004917664982845
- メール:adam.wahida@tum.de
研究場所
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Munich、ドイツ
- 募集
- MLL Munich Leukemia Laboratory
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コンタクト:
- Torsten Haferlach, MD
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- 血液疾患が疑われ、以下の検査を受けた患者:
- 内部ルーチン診断後に診断が不明な場合
- 異常な臨床経過
- 異常な r/r ステータスまたは無応答者
- 複数の並行する血液学的状態
- 困難/まれな治療に関連する/二次性新生物
- 現在の診断精密検査は、(1) 精度 (2) 臨床行動の点で満足のいくものではありません
- 患者のサンプルのみ 18歳から利用します
- 骨髄または末梢血サンプルの腫瘍含有量が最低 20% の材料
- 患者のインフォームドコンセント
除外基準:
- サンプルは最先端の診断に適しておらず、初期の品質管理に失敗しています。 品質保証のため、間違った抗凝固剤が送られたサンプルは除外されます。 気象学的理由による損傷(凍結融解損傷または温度上昇)のあるサンプルは除外されます。
- ルーチンのゴールドスタンダード診断を危険にさらす材料が少ないサンプルは除外されます(腫瘍含有量<20%)。
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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従来の方法による不明確な診断
研究集団は、血液悪性腫瘍の可能性がある慎重に選択された患者で構成されており、現在の診断方法では明確な診断と決定的な臨床ガイダンスを提供するには不十分でした。
SIRIUS は、最初の登録から合計で最大 9 か月間、ゴールド スタンダード手法による診断が確定していない合計 110 人の患者に対して実施されます。
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シーケンスのみのアプローチを従来の診断方法と比較する非介入観察のみの研究
他の名前:
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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シーケンスのみとゴールド スタンダード診断
時間枠:結果の時間枠: 各ケース/患者の診断時、約 1 年間の全研究期間中。
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主要エンドポイントは次のように評価されます: 不明なケースは、3 つの診断アルゴリズムの対象となります:
シーケンシングの結果を domo の治療ガイド アプローチおよび MLL が日常的に実施している現在のゴールド スタンダードの診断精密検査と比較することにより、各患者/ケースのアプローチ #3 の精度を比較します。 精度と重複または不一致は、コホート全体のパーセンテージ (%) で測定されます。 結果の時間枠: 各ケース/患者の診断時、約 1 年間の全研究期間中。 |
結果の時間枠: 各ケース/患者の診断時、約 1 年間の全研究期間中。
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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ターンアラウンドタイム
時間枠:時間枠は、症例/患者ごとに次の14日間の診断時の評価で構成されます。
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診断を導く潜在的な治療法が測定され、数日で比較されるまでのターンアラウンドタイム。
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時間枠は、症例/患者ごとに次の14日間の診断時の評価で構成されます。
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実行可能な目標
時間枠:この転帰は、診断の 1 年後に測定されます。 (診断後1年)
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潜在的な実行可能なターゲットの数は、ケースごとに決定されます。
この数を各患者の絶対数で評価し、治療が承認されているが、古典的なゴールドスタンダード診断中に識別が見逃されました。
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この転帰は、診断の 1 年後に測定されます。 (診断後1年)
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病期
時間枠:この転帰は、診断の 1 年後に測定されます。 (診断後1年)
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通常のゴールドスタンダード診断や病歴と比較して、シーケンスのみのアプローチに基づいて、推定される病期を特定します。
結果は、正しく分類されたケースのパーセンテージ (%) として示されます。
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この転帰は、診断の 1 年後に測定されます。 (診断後1年)
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ミクロコスト分析
時間枠:この結果の推定時間枠は、各患者の診断の時点になります (約 5 日)
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最終的にワークフロー 2 と 3 を比較するために、それぞれのアッセイと人員のすべてのコストを測定します (主要な結果 1 を参照してください)。
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この結果の推定時間枠は、各患者の診断の時点になります (約 5 日)
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協力者と研究者
協力者
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。
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