一项检查比利时 NGS 实验室进行的全面基因组分析的临床价值的研究:比利时 BSMO 与癌症中心合作的精确研究 (BALLETT)
一项检查比利时 NGS 实验室进行的全面基因组分析的临床价值的研究:比利时 BSMO 与癌症中心合作的精确研究 - 比利时当地实验室广泛肿瘤检测方法 (BALLETT)
该项目称为“BALLETT”(比利时本地实验室广泛肿瘤检测方法),具有双重目标:(1) 显示广泛分子谱分析与改善肿瘤患者护理的相关性,(2) 证明可以进行广泛分子检测由地方诊断实验室在分散的环境中以完全标准化和统一的方式进行,同时遵守最高质量标准。
这项为期 2 年的研究涉及由 9 个合作的比利时 NGS 实验室组成的联盟,并将招募来自比利时 13 家不同医院和癌症中心的 936 名转移性或局部晚期癌症患者。 纳入后,将使用 Illumina 的 TSO500 NGS panel 为所有癌症患者提供“综合基因组分析”(CGP)。 这个包含 523 个基因的靶向 NGS panel 允许检测单核苷酸变异、小插入缺失、拷贝数变异和融合,以及确定“肿瘤突变负荷”(TMB)和“微卫星不稳定性”状态(微星)。 CGP 的湿实验室执行以及变体的生物学和临床分类都将在 9 个参与的比利时本地 NGS 实验室中以完全标准化的方式进行。
CGP 结果将在 BALLETT 国家分子肿瘤委员会 (MTB) 的每周会议上进行解释和讨论,该委员会由肿瘤学家、病理学家、分子生物学家、遗传学家和生物信息学家组成。 MTB 将根据 CGP 结果提供靶向治疗或免疫治疗的建议。 将使用临床决策支持平台 OncoKDM (OncoDNA) 和 Clinical Genomics Workspace (PierianDx),这两种专家软件都可以将 NGS 数据转化为可操作的临床信息。 由此产生的治疗建议可能包括批准的治疗、临床试验、医疗需求计划或癌症药物的标签外使用。 治疗医生将收到 MTB 的建议,并决定对患者的实际管理。 将记录不遵循 MTB 建议的原因。
该项目的目标是:
- 评估 CGP 在“真实世界”实践中的临床价值,让晚期/转移性实体瘤患者更广泛地获得精准医疗
- 描述基因组改变的概况并量化通过综合小组测试检测到的可操作变异
- 评估如果 NGS 分析仅限于报销的 NGS 面板(ComPerMed 面板),将会遗漏的可操作变体的数量。
- 评估 CGP 的技术成功
- 尽可能标准化参与实验室之间的 CGP 数据分析、临床解释、治疗建议和报告
- 描述和量化治疗的采用,以及 CGP 指导的分子肿瘤委员会推荐的临床试验的纳入
- 通过计算个体患者的 PFS 比率(CGP 选择治疗的 PFS/先前治疗的 PFS)来评估临床获益(零假设:≤ 15% 的患者群体的 PFS 比率≥ 1.3)
- 以多方利益相关者的方式开展工作,以在比利时吸引更多创新疗法和临床试验
- 在政府“Sciensano”的授权下建立比利时基因组肿瘤数据库,从而增加比利时的公共卫生知识
研究概览
研究类型
注册 (预期的)
阶段
- 不适用
联系人和位置
学习联系方式
- 姓名:Brigitte Maes, Dr
- 电话号码:+32 11 33 83 41
- 邮箱:Brigitte.Maes@jessazh.be
研究联系人备份
- 姓名:Gordana Raicevic Toungouz
- 邮箱:Gordana.RaicevicToungouz@sciensano.be
学习地点
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Aalst、比利时
- 尚未招聘
- ASZ Aalst
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接触:
- Max Schreuer
- 邮箱:Max.Schreuer@asz.be
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首席研究员:
- Max Schreuer
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Antwerp、比利时、2610
- 招聘中
- GZA
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接触:
- Jo Horemans
- 电话号码:+32 3 443 37 59
- 邮箱:jo.horemans@gza.be
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首席研究员:
- Annemie Rutten, Dr
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Antwerp、比利时、2020
- 尚未招聘
- ZNA
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首席研究员:
- Joanna Vermeij, Dr
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接触:
- Joke van Gaelen
- 邮箱:ctuklinischestudies@zna.be
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Brugge、比利时
- 招聘中
- AZ Sint-Jan
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接触:
- Lies Pottel
- 邮箱:ctc@azsintjan.be
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首席研究员:
- Jacques Van Huysse
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Brussels、比利时、1090
- 尚未招聘
- AZ VUB
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首席研究员:
- Lore Decoster, Dr
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接触:
- Vanessa Fastenaekels
- 电话号码:+32 2 474 94 78
- 邮箱:Vanessa.Fastenaekels@uzbrussel.be
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接触:
- Malika Tahiri
- 电话号码:+32 2 474 94 78
- 邮箱:Malika.Tahiri@uzbrussel.be
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Charleroi、比利时、6000
- 尚未招聘
- Grand Hôpital de Charleroi
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接触:
- Stéphanie Warnon
- 电话号码:+32 71 10 47 47
- 邮箱:Stephanie.WARNON@ghdc.be
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首席研究员:
- Jean-Luc Canon, Dr
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Edegem、比利时、2650
- 招聘中
- Universitaire Ziekenhuis Antwerpen
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接触:
- Julia Lenaerts
- 邮箱:Julia.Lenaerts@uza.be
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首席研究员:
- Hans Prenen, Dr
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Gent、比利时、9000
- 尚未招聘
- UZ Gent
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接触:
- Lore Vansteelant
- 邮箱:Lore.Vansteelant@uzgent.be
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首席研究员:
- Sylvie Rottey, Prof. Dr
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Hasselt、比利时、3500
- 招聘中
- Jessa Ziekenhuis
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接触:
- Ann Tullen
- 电话号码:+32 11 33 79 91
- 邮箱:ann.tullen@jessazh.be
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首席研究员:
- Jeroen Mebis, Prof. Dr
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Leuven、比利时、3000
- 尚未招聘
- UZ Leuven
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接触:
- Isabelle Vanden Bempt
- 邮箱:isabelle.vandenbempt@uzleuven.be
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首席研究员:
- Sabine Tejpar, Prof. Dr
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Roeselare、比利时
- 招聘中
- AZ Delta
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接触:
- Sophie Adriaens
- 邮箱:sophie.adriaens@azdelta.be
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首席研究员:
- Francesca Dedeurwaerdere, Dr
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Turnhout、比利时
- 招聘中
- AZ Turnhout
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接触:
- Lynn Decoster
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接触:
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首席研究员:
- Lynn Decoster, Dr
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
接受健康志愿者
有资格学习的性别
描述
纳入标准:
- 成年患者(18岁及以上)
- 适合全身治疗的转移性实体瘤患者(首选早期线)。 常见肿瘤类型的数量将受到限制(乳腺癌:120 名患者,NSCLC:120 名患者,结直肠癌:120 名患者)。 将有 150 名患有罕见肿瘤或具有罕见组织学的肿瘤的患者队列(Eur. J. 癌症 2011 年; 47:2493-2511)。 患者将在临床实践中出现时被招募。
- 预期寿命 > 12 周。
- 东部合作肿瘤组 (ECOG) 表现状态≤ 2 的患者。
- 有资格获得 NGS 报销的患者(cfr. 适应症 NGS 公约)也将由当地的 NGS 小组进行测试,尽管如果 CGP 获得 ISO 15189 认证则不需要这样做。 在这种情况下,CGP 被视为本地 NGS。 不符合报销 NGS 检测条件的患者只能由 CGP 进行检测。
- 患者必须有足够的来自转移性(首选)或原发性病变活检的组织用于局部检测和 CGP 检测,足以提取至少 80 ng 稀释在 TE 1x 中的 DNA 和 40-80 ng(推荐 80 ng)稀释在 RNA-中的 RNA用于 TSO500 文库制备的纯水。 核酸提取物必须满足方案中规定的质量要求(参见“TruSight Oncology 500 (TSO500) 工作流程 - 参与实验室的工作流程说明”)。 组织不应超过 2 年,并固定在 10% 中性缓冲福尔马林中。 对于使用已知会诱导获得性耐药机制的疗法(NSCLC 中的 EGFR TKI、乳腺癌中的芳香化酶抑制剂、GIST 中的 TKI 等)进行治疗的患者,必须在先前的治疗线后获取转移性活检的可用性。 不允许进行脱钙的骨活检。
- 只有当患者也同时注册在 Precision-1 研究中并且研究者同意随后注册 CGP 驱动的治疗并且研究者评估该治疗和之前治疗的结果(基于 RECIST 1.1 评估的 PFS)时,才能招募患者。
- 患者能够在参加潜在的后续临床试验之前提供书面知情同意书。
排除标准:
- 预期寿命少于 12 周。
- 无法遵守协议程序。
- 已知存在严重的造血、肾脏和/或肝脏功能障碍(根据当地 PI)。
- 未提供知情同意书。
- 患者未按照 Precision-1 中的规定进行登记和随访。
- DNA/RNA 数量不足(<80 ng DNA,<40-80 ng RNA)和质量(DNA 的 dCq 值 >5,RNA 的 DV200 值 <20%),(参见“TruSight Oncology 500 (TSO500) 工作流程 - 工作流程说明对于参与实验室”)。
学习计划
研究是如何设计的?
设计细节
- 主要用途:诊断
- 分配:不适用
- 介入模型:单组作业
- 屏蔽:无(打开标签)
研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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具有临床意义的变异的数量/流行率
大体时间:通过学习完成,平均1年
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使用 CGP 与本地 NGS 测试(如果可用)和/或与最低要求的 ComPerMed 小组相比,具有临床意义 1A 或 1B 级(强烈临床意义)和 2C 和 2D 级(潜在临床意义)分类的变体的数量/流行率。 根据 Li 等人的分层。 AMP/ASCO/帽。 J Mol Diagn 19:4-23, 2017。 |
通过学习完成,平均1年
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按类型(SNV、CNV、融合)改变的数量/普遍性
大体时间:通过学习完成,平均1年
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通过学习完成,平均1年
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患者旅程描述
大体时间:通过学习完成,平均1年
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根据变异治疗匹配评分系统分类的 MTB 推荐患者百分比、接受基因型知情治疗的患者百分比、从 CGP 请求到 MTB 推荐的周转时间、接受分子引导治疗或免疫检查点抑制剂或组合的患者比例CGP 的结果,根据 MTB 推荐开始治疗的时间,偏离治疗推荐的比例和原因(临床快速恶化,其他方案,患者不合格,不可用的超适应症治疗,临床试验不可行(例如
物理距离),临床试验不招募,医生的决定,病人的选择,......)
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通过学习完成,平均1年
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次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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成功进行 CGP 的患者百分比
大体时间:通过学习完成,平均1年
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通过学习完成,平均1年
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PFS比率
大体时间:通过学习完成,平均1年
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PFS 基于 RECIST 1.1 评估患者接受 CGP 推荐治疗和 PFS 比率(CGP 选择治疗的 PFS/先前治疗的 PFS)(无效假设:≤ 15% 的患者群体的 PFS 比率≥ 1.3)
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通过学习完成,平均1年
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参与的 NGS 实验室在研究后继续进行 CGP 的数量
大体时间:通过学习完成,平均1年
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包括成本计算和报销数据,以支持经济分析(从实验室角度进行微观成本核算,从付款人角度进行预算影响)。
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通过学习完成,平均1年
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合作者和调查者
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (实际的)
初级完成 (预期的)
研究完成 (预期的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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