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Une étude pour examiner la valeur clinique du profilage génomique complet réalisé par les laboratoires belges NGS : une étude belge de précision du BSMO en collaboration avec le Centre du cancer (BALLETT)

16 septembre 2021 mis à jour par: The Belgian Society of Medical Oncology

Une étude pour examiner la valeur clinique du profilage génomique complet réalisé par les laboratoires belges NGS : une étude belge de précision du BSMO en collaboration avec le Centre du cancer - Approche belge pour les tests de tumeurs étendus en laboratoire local (BALLETT)

Le projet, baptisé "BALLETT" (Belgian Approach of Local Laboratory Extensive Tumor Testing), a un double objectif : (1) montrer la pertinence d'un profilage moléculaire large pour améliorer la prise en charge des patients oncologiques, (2) démontrer que des tests moléculaires larges peuvent être réalisés dans un cadre décentralisé par des laboratoires de diagnostic locaux de manière entièrement standardisée et uniforme tout en respectant les normes de qualité les plus élevées.

Cette étude de 2 ans implique le consortium de 9 laboratoires NGS belges coopérants et recrutera 936 patients atteints d'un cancer métastatique ou localement avancé provenant de 13 hôpitaux et centres anticancéreux belges différents. Lors de l'inclusion, tous les patients atteints de cancer se verront proposer un "profilage génomique complet" (CGP) à l'aide du panel TSO500 NGS d'Illumina. Ce panel NGS ciblé de 523 gènes permet la détection de variants mononucléotidiques, de petits indels, de variations du nombre de copies et de fusions, ainsi que la détermination de la « charge mutationnelle tumorale » (TMB) et de l'état « d'instabilité des microsatellites » ( MSI). L'exécution en laboratoire humide du CGP ainsi que la classification biologique et clinique des variants seront effectuées de manière entièrement standardisée parmi les 9 laboratoires NGS locaux belges participants.

Les résultats du CGP seront interprétés et discutés lors de la réunion hebdomadaire du conseil national des tumeurs moléculaires BALLETT (MTB), composé d'oncologues, de pathologistes, de biologistes moléculaires, de généticiens et de bioinformaticiens. Le MTB fournira des recommandations de ciblage ou d'immunothérapie en fonction des résultats du CGP. Les plateformes d'aide à la décision clinique OncoKDM (OncoDNA) et Clinical Genomics Workspace (PierianDx), deux logiciels experts qui transforment les données NGS en informations cliniques exploitables, seront utilisées. La recommandation thérapeutique qui en résulte peut consister en une thérapie approuvée, un essai clinique, un programme de besoins médicaux ou une utilisation non conforme de médicaments anticancéreux. Les médecins traitants recevront les recommandations MTB et décideront de la prise en charge effective de leurs patients. Les raisons pour ne pas suivre la recommandation VTT seront enregistrées.

Les objectifs du projet sont :

  1. Évaluer la valeur clinique de la CGP dans la pratique « réelle » en donnant aux patients atteints de tumeurs solides avancées/métastatiques un accès plus large à la médecine de précision
  2. Décrire le paysage des altérations génomiques et quantifier les variantes actionnables détectées par des tests de panel complets
  3. Évaluer le nombre de variantes actionnables qui auraient été manquées si l'analyse NGS était limitée au panel NGS remboursé (panel ComPerMed).
  4. Évaluer le succès technique de CGP
  5. Normaliser l'analyse des données CGP, l'interprétation clinique, les recommandations thérapeutiques et les rapports entre les laboratoires participants dans la mesure du possible
  6. Décrire et quantifier l'adoption des traitements et l'inclusion dans les essais cliniques recommandés par le comité des tumeurs moléculaires guidé par le CGP
  7. Évaluer le bénéfice clinique en calculant le ratio de SSP pour chaque patient (SSP sous traitement sélectionné par CGP/SSP sous traitement antérieur) (hypothèse nulle : ≤ 15 % de la population de patients a un ratio de SSP ≥ 1,3)
  8. Travailler dans une approche multipartite pour attirer plus de traitements innovants et d'essais cliniques en Belgique
  9. Établir une base de données belge sur les tumeurs génomiques sous l'autorité du 'Sciensano' gouvernemental, augmentant ainsi les connaissances en matière de santé publique en Belgique

Aperçu de l'étude

Statut

Recrutement

Les conditions

Intervention / Traitement

Type d'étude

Interventionnel

Inscription (Anticipé)

936

Phase

  • N'est pas applicable

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

Sauvegarde des contacts de l'étude

Lieux d'étude

  • Belgique
      • Aalst, Belgique
        • Pas encore de recrutement
        • ASZ Aalst
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Max Schreuer
      • Antwerp, Belgique, 2610
        • Recrutement
        • GZA
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Annemie Rutten, Dr
      • Antwerp, Belgique, 2020
        • Pas encore de recrutement
        • ZNA
        • Chercheur principal:
          • Joanna Vermeij, Dr
        • Contact:
      • Brugge, Belgique
        • Recrutement
        • AZ Sint-Jan
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Jacques Van Huysse
      • Brussels, Belgique, 1090
      • Charleroi, Belgique, 6000
        • Pas encore de recrutement
        • Grand Hôpital de Charleroi
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Jean-Luc Canon, Dr
      • Edegem, Belgique, 2650
        • Recrutement
        • Universitaire Ziekenhuis Antwerpen
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Hans Prenen, Dr
      • Gent, Belgique, 9000
        • Pas encore de recrutement
        • UZ Gent
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Sylvie Rottey, Prof. Dr
      • Hasselt, Belgique, 3500
        • Recrutement
        • Jessa Ziekenhuis
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Jeroen Mebis, Prof. Dr
      • Leuven, Belgique, 3000
      • Roeselare, Belgique
        • Recrutement
        • AZ Delta
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Francesca Dedeurwaerdere, Dr
      • Turnhout, Belgique

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

14 ans et plus (Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Non

Sexes éligibles pour l'étude

Tout

La description

Critère d'intégration:

  • Patients adultes (18 ans et plus)
  • Patients atteints de tumeurs solides métastatiques qui sont candidats à un traitement systémique (les lignes précoces sont préférées). Les effectifs seront plafonnés pour les types de tumeurs fréquentes (cancer du sein : 120 patientes, NSCLC : 120 patientes, cancer colorectal : 120 patientes). Il y aura une cohorte de 150 patients atteints de tumeurs rares ou de tumeurs à histologie rare (Eur. J. Cancer 2011; 47 : 2493-2511). Les patients seront recrutés au fur et à mesure de leur apparition dans la pratique clinique.
  • Espérance de vie > 12 semaines.
  • Patient présentant un indice de performance Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) ≤ 2.
  • Les patients éligibles aux NGS remboursés (cfr. (convention NGS) seront également testés par le panel NGS local, bien que cela ne soit pas obligatoire si le CGP est accrédité ISO 15189. Dans cette situation, le CGP est considéré comme le NGS local. Les patients qui ne sont pas éligibles aux tests NGS remboursés ne peuvent être testés que par le CGP.
  • Les patients doivent avoir suffisamment de tissu provenant d'une biopsie de lésion métastatique (préférée) ou primaire pour les tests locaux et les tests CGP, suffisant pour extraire un minimum de 80 ng d'ADN dilué dans du TE 1x et 40-80 ng (80 ng recommandé) d'ARN dilué dans de l'ARN- eau de qualité pour la préparation de la bibliothèque TSO500. L'extrait d'acide nucléique doit répondre aux exigences de qualité spécifiées dans le protocole (Voir « Flux de travail TruSight Oncology 500 (TSO500) - Instructions de flux de travail pour les laboratoires participants »). Le tissu ne doit pas avoir plus de 2 ans et être fixé dans du formol tamponné neutre à 10 %. La disponibilité de biopsies métastatiques récupérées après une précédente ligne thérapeutique est obligatoire pour les patients traités par des thérapies connues pour induire des mécanismes acquis de résistance (EGFR TKI dans le NSCLC, inhibiteurs de l'aromatase dans le cancer du sein, TKI dans les GIST…). Les biopsies osseuses qui subissent une décalcification ne sont pas autorisées.
  • Les patients ne peuvent être recrutés que s'ils sont également enregistrés simultanément dans l'étude Precision-1 et que l'investigateur accepte l'enregistrement ultérieur du traitement dirigé par le CGP administré et que l'investigateur a évalué les résultats de ce traitement et des traitements antérieurs (PFS basé sur l'évaluation RECIST 1.1).
  • Patients en mesure de fournir un consentement éclairé écrit avant l'inscription à un éventuel essai clinique ultérieur.

Critère d'exclusion:

  • Espérance de vie inférieure à 12 semaines.
  • Incapacité à se conformer aux procédures protocolaires.
  • Présence connue d'un dysfonctionnement hématopoïétique, rénal et/ou hépatique sévère (selon l'IP local).
  • Aucun consentement éclairé fourni.
  • Le patient n'est pas inscrit et suivi comme prévu dans Précision-1.
  • Quantité d'ADN/ARN insuffisante (<80 ng d'ADN, <40-80 ng d'ARN) et qualité (valeur dCq > 5 pour l'ADN, valeur DV200 < 20 % pour l'ARN), (voir « Flux de travail TruSight Oncology 500 (TSO500) - Instructions de flux de travail pour les laboratoires participants »).

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Objectif principal: Diagnostique
  • Répartition: N / A
  • Modèle interventionnel: Affectation à un seul groupe
  • Masquage: Aucun (étiquette ouverte)

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Nombre/prévalence des variantes ayant une signification clinique
Délai: jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an

Nombre/prévalence de variantes avec une classification de signification clinique Niveau 1A ou 1B (forte signification clinique) et Niveau 2C et 2D (signification clinique potentielle) en utilisant le CGP par rapport aux tests NGS locaux (si disponible) et/ou par rapport au panel ComPerMed minimalement requis.

Hiérarchisation selon Li et al. AMP/ASCO/CAP. J Mol Diagn 19:4-23, 2017.
jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an
Nombre/prévalence des altérations par type (SNV, CNV, fusions)
Délai: jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an
jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an
Description du parcours du patient
Délai: jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an
Pourcentage de patients avec recommandation MTB classés selon le système de notation de correspondance de thérapie variante, pourcentage de patients ayant accès à un traitement tenant compte du génotype, délai d'exécution entre la demande CGP et la recommandation MTB, proportion de patients ayant accès à une thérapie guidée moléculaire ou à des inhibiteurs de point de contrôle immunitaire ou à des combinaisons basées sur le résultat du CGP, moment de l'initiation du traitement suivant la recommandation MTB, proportion d'écarts par rapport aux recommandations de traitement et raisons (détérioration clinique rapide, autre protocole, patient inéligible, traitement hors indication non disponible, essai clinique impossible (par ex. distance physique), essai clinique ne recrutant pas, décision du médecin, choix du patient, …)
jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Pourcentage de patients avec succès CGP
Délai: jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an
jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an
Ratio SSP
Délai: jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an
SSP basée sur l'évaluation RECIST 1.1 des patients sous traitement recommandé par le CGP et le ratio de SSP (SSP sous traitement sélectionné par le CGP/SSP sous traitement antérieur) (hypothèse nulle : ≤ 15 % de la population de patients a un ratio de SSP ≥ 1,3)
jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an
Nombre de laboratoires NGS participants poursuivant le CGP après l'étude
Délai: jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an
Y compris le calcul des coûts et les données de remboursement pour soutenir l'analyse économique (microcoûts du point de vue du laboratoire et impact budgétaire du point de vue du payeur).
jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

The Belgian Society of Medical Oncology

Collaborateurs

Illumina, Inc.
OncoDNA
PierianDx

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

1 juin 2021

Achèvement primaire (Anticipé)

1 mai 2023

Achèvement de l'étude (Anticipé)

1 mai 2026

Dates d'inscription aux études

Première soumission

6 septembre 2021

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

16 septembre 2021

Première publication (Réel)

28 septembre 2021

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

28 septembre 2021

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

16 septembre 2021

Dernière vérification

1 septembre 2021

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Mots clés

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

  • BSMO2020-2

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

Non

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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