长期抗生素治疗对共生微生物群落基因表达的影响。
2021年12月9日 更新者:David Pride、University of California, San Diego
长期抗生素研究
抗生素是挽救生命的主要干预措施,在医疗实践中经常用于对抗感染。
这些药物不仅针对所开处方的致病菌,而且还针对栖息在肠道、皮肤和口咽部的共生细菌群落发挥作用。
这些本地细菌群落在正常宿主功能(例如营养和宿主免疫)中所起的作用,以及由于抗生素使用的各种改变而导致的群落及其功能的变化,才刚刚开始被探索。
短期抗生素疗程已被证明会影响本地细菌群落的多样性,并影响存在的抗生素抗性基因的丰度。
例如,已经证明在人类受试者中使用克林霉素 7 天会导致持续数月或数年的克林霉素耐药性。
长期抗生素治疗对宿主微生物组的影响(包括存在的微生物和抗生素基因的多样性)尚未得到研究,而且我们对抗菌治疗对人类微生物群落中存在的遗传库的纵向影响知之甚少。
在这项研究中,我们将纵向检查微生物群的变化以及皮肤、唾液和结肠微生物群中的抗菌素耐药基因的频率,这些受试者包括接受长期抗菌治疗的受试者,以及接受抗生素治疗的人的家庭成员。
在开始抗生素治疗之前,在诊断出需要长期抗生素治疗的感染(例如骨髓炎或假体关节感染)后,将招募既往健康且先前接触抗生素最少的患者。
我们将在使用抗生素之前检查皮肤、唾液和肠道的微生物群,以及这些微生物群落中抗生素抗性基因的频率。
我们将比较抗生素患者在延长抗生素疗程之前、期间和之后的微生物群落和抗生素耐药基因频率。
我们还将寻找使用抗生素的家庭成员中微生物组或抗生素抗性基因发生的变化。
研究概览
详细说明
共生菌群被认为在维持人类健康方面发挥着重要作用。 细菌群落和其中隐藏的抗生素抗性基因可能会因临床环境中使用抗生素所施加的选择压力而改变。 抗生素使用对内源性微生物群落的扰动可能对微生物组和其中携带的抗生素抗性基因产生重大影响。 我们的目标是使用宏基因组学技术研究长期抗生素治疗如何改变微生物群落。 除了测量存在的细菌基因型的多样性外,我们还计划对暴露于长期抗生素疗程的人类受试者的抗生素抗性基因库进行表征。 我们还将通过评估与其他受试者相比居住在同一家庭的受试者中存在的抗生素基因,来衡量环境对人类微生物群落抗生素耐药性库的影响。
目标 1:提高我们对延长抗生素疗程在抗生素疗程期间和之后对人体皮肤、口腔和结肠天然细菌群落的影响的理解。 我们将使用宏基因组学研究这些群落中细菌多样性在数量和质量(细菌类别如何改变)方面的变化。
目标 2:提高我们对长期使用抗生素对人类微生物组中抗生素抗性基因随时间存在的影响的理解。 我们将在延长的抗生素疗程之前、期间和之后纵向跟踪共生细菌群落中存在的抗生素抗性基因的存在、多样性和数量。
目标 3:评估存在于同一家庭成员中的细菌群落是否因环境影响而不是直接使用抗生素而发生变化。
研究类型
介入性
注册 (实际的)
60
阶段
- 第三阶段
参与标准
研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。
资格标准
适合学习的年龄
18年 至 75年 (成人、年长者)
接受健康志愿者
是的
有资格学习的性别
全部
描述
纳入标准:
- 18-75岁
- 在例行诊所预约中给予同意、提供样本和跟进的能力
排除标准:
- 入组前 3 个月内使用抗生素(诊断前 72 小时或围手术期短疗程以外)
- 无法提供同意书或样品
- 免疫功能低下的疾病,如 HIV/AIDS、SLE、器官或骨髓移植受者、自身免疫性疾病的免疫抑制剂、囊性纤维化等遗传疾病,可能导致殖民社区发生重大变化。
- 在没有刺激的情况下无法提供 3mL 唾液
- 严重的疾病
学习计划
本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。
合作者和调查者
在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。
出版物和有用的链接
负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。
一般刊物
- Ly M, Jones MB, Abeles SR, Santiago-Rodriguez TM, Gao J, Chan IC, Ghose C, Pride DT. Transmission of viruses via our microbiomes. Microbiome. 2016 Dec 2;4(1):64. doi: 10.1186/s40168-016-0212-z.
- Abeles SR, Jones MB, Santiago-Rodriguez TM, Ly M, Klitgord N, Yooseph S, Nelson KE, Pride DT. Microbial diversity in individuals and their household contacts following typical antibiotic courses. Microbiome. 2016 Jul 30;4(1):39. doi: 10.1186/s40168-016-0187-9.
研究记录日期
这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。
研究主要日期
学习开始 (实际的)
2012年12月7日
初级完成 (实际的)
2016年4月22日
研究完成 (实际的)
2016年4月22日
研究注册日期
首次提交
2021年12月9日
首先提交符合 QC 标准的
2021年12月9日
首次发布 (实际的)
2021年12月23日
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
2021年12月23日
上次提交的符合 QC 标准的更新
2021年12月9日
最后验证
2021年12月1日
更多信息
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