Impatto della terapia antibiotica prolungata sull'espressione genica della comunità microbica commensale.

Gli antibiotici sono un pilastro degli interventi salvavita usati frequentemente nella pratica medica per combattere le infezioni. Questi farmaci non solo prendono di mira i batteri patogeni per i quali sono prescritti, ma agiscono anche contro le comunità batteriche commensali che abitano l'intestino, la pelle e l'orofaringe. Il ruolo che queste comunità batteriche native svolgono nella normale funzione dell'ospite, come nella nutrizione e nell'immunità dell'ospite, sta solo iniziando a essere esplorato, così come i cambiamenti nelle comunità e nella loro funzione come risultato di varie alterazioni dell'uso di antibiotici. È stato dimostrato che brevi cicli di antibiotici influenzano la diversità delle comunità batteriche native e influenzano l'abbondanza di geni di resistenza agli antibiotici presenti. Ad esempio, è stato dimostrato che l'uso di clindamicina in soggetti umani per 7 giorni provoca una resistenza persistente alla clindamicina per mesi o anni. L'impatto della terapia antibiotica prolungata sul microbioma ospite, inclusi sia gli organismi presenti sia la diversità dei geni antibiotici, non è stato studiato e abbiamo una conoscenza molto scarsa degli effetti longitudinali della terapia antimicrobica sul repertorio genetico presente nelle comunità microbiche umane. In questo studio, esamineremo i cambiamenti nel microbiota e la frequenza dei geni di resistenza antibatterica ospitati longitudinalmente nella pelle, nella saliva e nei microbiomi del colon nei soggetti in terapia antimicrobica prolungata, nonché nei membri della famiglia della persona in terapia antibiotica. I pazienti precedentemente sani con un'esposizione minima agli antibiotici saranno arruolati al momento della diagnosi di un'infezione che richiede una terapia antibiotica a lungo termine, come l'osteomielite o l'infezione dell'articolazione protesica, prima di iniziare la terapia antibiotica. Esamineremo il microbiota della pelle, della saliva e dell'intestino prima degli antibiotici, nonché la frequenza dei geni di resistenza agli antibiotici ospitati all'interno di queste comunità microbiche. Confronteremo le comunità microbiche e le frequenze dei geni di resistenza agli antibiotici prima, durante e dopo un ciclo prolungato di antibiotici in pazienti che assumono antibiotici. Cercheremo anche alterazioni che si verificano tra microbiomi o geni di resistenza agli antibiotici tra i membri della famiglia di persone che assumono antibiotici.