Effekten av langvarig antibiotikaterapi på kommensal mikrobiell fellesskapsgenuttrykk.

Antibiotika er en bærebjelke i livreddende intervensjoner som ofte brukes i medisinsk praksis for å bekjempe infeksjoner. Disse medisinene retter seg ikke bare mot de patogene bakteriene de er foreskrevet for, men fungerer også mot kommensale bakteriesamfunn som bor i tarmen, huden og orofarynx. Rollen som disse innfødte bakteriesamfunnene spiller i normal vertsfunksjon, for eksempel i ernæring og vertsimmunitet, begynner bare å bli utforsket, det samme er endringene i samfunnene og deres funksjon som et resultat av ulike endringer i antibiotikabruk. Korte kurer med antibiotika har vist seg å påvirke mangfoldet av innfødte bakteriesamfunn, og å påvirke mengden av antibiotikaresistensgener tilstede. For eksempel har bruk av klindamycin hos mennesker i 7 dager vist seg å resultere i vedvarende klindamycinresistens i måneder eller år. Virkningen av langvarig antibiotikabehandling på vertsmikrobiomet, inkludert både de tilstedeværende organismene og mangfoldet av antibiotikagener, har ikke blitt studert, og vi har svært liten forståelse av de langsgående effektene av antimikrobiell terapi på det genetiske repertoaret som er tilstede i menneskelige mikrobielle samfunn. I denne studien vil vi undersøke endringer i mikrobiotaen så vel som hyppigheten av antibakterielle resistensgener i hud-, spytt- og tykktarmsmikrobiomer i lengderetningen hos personer på langvarig antimikrobiell terapi, samt husstandsmedlemmer til personen som får antibiotikabehandling. Tidligere friske pasienter med minimal tidligere antibiotikaeksponering vil bli registrert ved diagnose av en infeksjon som krever langvarig antibiotikabehandling, slik som osteomyelitt eller protetisk leddinfeksjon, før oppstart av antibiotikabehandling. Vi vil undersøke mikrobiotaen i huden, spytt og tarm før antibiotika, samt frekvensen av antibiotikaresistensgener som finnes i disse mikrobielle samfunnene. Vi vil sammenligne mikrobielle samfunn og antibiotikaresistensgenfrekvenser før, under og etter forlenget antibiotikakur hos pasienter på antibiotika. Vi vil også se etter endringer som forekommer blant mikrobiomer eller antibiotikaresistensgener blant husstandsmedlemmer av personer på antibiotika.