Wpływ przedłużonej antybiotykoterapii na ekspresję genów społeczności drobnoustrojów komensalnych.

Antybiotyki są podstawą interwencji ratujących życie, często stosowanych w praktyce medycznej do zwalczania infekcji. Leki te nie tylko atakują bakterie chorobotwórcze, dla których są przepisywane, ale także działają przeciwko komensalnym społecznościom bakteryjnym, które zamieszkują jelita, skórę i jamę ustną gardła. Rola, jaką te rodzime społeczności bakteryjne odgrywają w normalnych funkcjach gospodarza, takich jak odżywianie i odporność gospodarza, dopiero zaczyna być badana, podobnie jak zmiany w społecznościach i ich funkcjach w wyniku różnych zmian w stosowaniu antybiotyków. Wykazano, że krótkie cykle antybiotykoterapii wpływają na różnorodność rodzimych społeczności bakteryjnych i na obfitość obecnych genów oporności na antybiotyki. Na przykład wykazano, że stosowanie klindamycyny u ludzi przez 7 dni skutkuje trwałą opornością na klindamycynę przez miesiące lub lata. Wpływ długotrwałej antybiotykoterapii na mikrobiom gospodarza, w tym zarówno obecne organizmy, jak i różnorodność genów antybiotyków, nie został zbadany, a my mamy bardzo mało wiedzy na temat długofalowych skutków terapii przeciwdrobnoustrojowej na repertuar genetyczny obecny w ludzkich społecznościach drobnoustrojów. W tym badaniu zbadamy zmiany w mikroflorze, a także częstotliwość genów oporności na środki przeciwbakteryjne w skórze, ślinie i mikrobiomach okrężnicy wzdłużnie u osób poddanych długotrwałej terapii przeciwbakteryjnej, a także członków gospodarstwa domowego osoby poddawanej antybiotykoterapii. Wcześniej zdrowi pacjenci z minimalną wcześniejszą ekspozycją na antybiotyki zostaną włączeni po rozpoznaniu zakażenia wymagającego długotrwałej antybiotykoterapii, takiego jak zapalenie kości i szpiku lub zakażenie protezy stawu, przed rozpoczęciem antybiotykoterapii. Zbadamy mikroflorę skóry, śliny i jelit przed antybiotykami, a także częstotliwość występowania genów oporności na antybiotyki w tych społecznościach drobnoustrojów. Porównamy społeczności drobnoustrojów i częstotliwości genów oporności na antybiotyki przed, w trakcie i po przedłużonym kursie antybiotyków u pacjentów stosujących antybiotyki. Poszukamy również zmian zachodzących wśród mikrobiomów lub genów oporności na antybiotyki wśród domowników osób stosujących antybiotyki.