Impacto da antibioticoterapia prolongada na expressão gênica da comunidade microbiana comensal.

Os antibióticos são um dos pilares das intervenções que salvam vidas, usadas com frequência na prática médica para combater infecções. Esses medicamentos não apenas visam as bactérias patogênicas para as quais são prescritos, mas também atuam contra as comunidades bacterianas comensais que habitam o intestino, a pele e a orofaringe. O papel que essas comunidades bacterianas nativas desempenham na função normal do hospedeiro, como nutrição e imunidade do hospedeiro, está apenas começando a ser explorado, assim como as mudanças nas comunidades e sua função como resultado de várias alterações do uso de antibióticos. Foi demonstrado que cursos curtos de antibióticos afetam a diversidade de comunidades bacterianas nativas e afetam a abundância de genes de resistência a antibióticos presentes. Por exemplo, o uso de clindamicina em seres humanos por 7 dias demonstrou resultar em resistência persistente à clindamicina por meses ou anos. O impacto da antibioticoterapia prolongada no microbioma hospedeiro, incluindo os organismos presentes e a diversidade de genes de antibióticos, não foi estudado, e temos muito pouco entendimento dos efeitos longitudinais da terapia antimicrobiana no repertório genético presente nas comunidades microbianas humanas. Neste estudo, examinaremos mudanças na microbiota, bem como a frequência de genes de resistência antibacteriana abrigados na pele, saliva e microbiomas colônicos longitudinalmente em indivíduos em terapia antimicrobiana prolongada, bem como membros da família da pessoa em terapia antibiótica. Pacientes previamente bem com exposição prévia mínima a antibióticos serão inscritos após o diagnóstico de uma infecção que requer terapia antibiótica de longo prazo, como osteomielite ou infecção de prótese articular, antes de iniciar a terapia antibiótica. Examinaremos a microbiota da pele, saliva e intestino antes dos antibióticos, bem como a frequência de genes de resistência a antibióticos abrigados nessas comunidades microbianas. Compararemos as comunidades microbianas e as frequências de genes de resistência a antibióticos antes, durante e após um curso prolongado de antibióticos em pacientes em uso de antibióticos. Também procuraremos alterações que ocorram entre microbiomas ou genes de resistência a antibióticos entre membros da família de pessoas que tomam antibióticos.