Indvirkning af langvarig antibiotikaterapi på kommensal mikrobiel fællesskabsgenekspression.

Antibiotika er en grundpille i livreddende indgreb, der ofte anvendes i medicinsk praksis for at bekæmpe infektioner. Disse medikamenter er ikke kun rettet mod de patogene bakterier, som de er ordineret til, men fungerer også mod kommensale bakteriesamfund, der bor i tarmen, huden og oropharynx. Den rolle, som disse indfødte bakteriesamfund spiller i normal værtsfunktion, såsom i ernæring og værtsimmunitet, er kun begyndt at blive udforsket, ligesom ændringerne i samfundene og deres funktion som følge af forskellige ændringer af antibiotikabrug. Korte forløb med antibiotika har vist sig at påvirke mangfoldigheden af ​​indfødte bakteriesamfund og at påvirke mængden af ​​antibiotikaresistensgener til stede. For eksempel har brug af clindamycin hos mennesker i 7 dage vist sig at resultere i vedvarende clindamycinresistens i måneder eller år. Indvirkningen af ​​langvarig antibiotikabehandling på værtsmikrobiomet, herunder både de tilstedeværende organismer og mangfoldigheden af ​​antibiotikagener, er ikke blevet undersøgt, og vi har meget lidt forståelse af de longitudinelle virkninger af antimikrobiel terapi på det genetiske repertoire, der er til stede i menneskelige mikrobielle samfund. I denne undersøgelse vil vi undersøge ændringer i mikrobiotaen samt hyppigheden af ​​antibakterielle resistensgener i hud-, spyt- og tyktarmsmikrobiomer i længderetningen hos personer på langvarig antimikrobiel terapi, såvel som husstandsmedlemmer af personen i antibiotikabehandling. Tidligere raske patienter med minimal tidligere antibiotikaeksponering vil blive indskrevet ved diagnose af en infektion, der kræver langvarig antibiotikabehandling, såsom osteomyelitis eller protetisk ledinfektion, før antibiotikabehandling påbegyndes. Vi vil undersøge mikrobiotaen i huden, spyt og tarm forud for antibiotika samt hyppigheden af ​​antibiotikaresistensgener i disse mikrobielle samfund. Vi vil sammenligne mikrobielle samfund og antibiotikaresistensgenfrekvenser før, under og efter forlænget forløb med antibiotika hos patienter på antibiotika. Vi vil også se efter ændringer, der forekommer blandt mikrobiomer eller antibiotikaresistensgener blandt husstandsmedlemmer af mennesker på antibiotika.