Impacto de la terapia prolongada con antibióticos en la expresión génica de la comunidad microbiana comensal.

Los antibióticos son un pilar de las intervenciones que salvan vidas y se utilizan con frecuencia en la práctica médica para combatir las infecciones. Estos medicamentos no solo se dirigen a las bacterias patógenas para las que se prescriben, sino que también funcionan contra las comunidades bacterianas comensales que habitan en el intestino, la piel y la orofaringe. El papel que desempeñan estas comunidades bacterianas nativas en la función normal del huésped, como la nutrición y la inmunidad del huésped, apenas comienza a explorarse, al igual que los cambios en las comunidades y su función como resultado de diversas alteraciones del uso de antibióticos. Se ha demostrado que los ciclos cortos de antibióticos afectan la diversidad de las comunidades bacterianas nativas y afectan la abundancia de genes de resistencia a los antibióticos presentes. Por ejemplo, se ha demostrado que el uso de clindamicina en sujetos humanos durante 7 días da como resultado una resistencia persistente a la clindamicina durante meses o años. No se ha estudiado el impacto de la terapia prolongada con antibióticos en el microbioma del huésped, incluidos los organismos presentes y la diversidad de genes de antibióticos, y tenemos muy poca comprensión de los efectos longitudinales de la terapia antimicrobiana en el repertorio genético presente en las comunidades microbianas humanas. En este estudio, examinaremos los cambios en la microbiota, así como la frecuencia de los genes de resistencia a los antibacterianos albergados en la piel, la saliva y los microbiomas colónicos longitudinalmente en sujetos que reciben terapia antimicrobiana prolongada, así como en los miembros del hogar de la persona que recibe terapia con antibióticos. Los pacientes previamente sanos con una exposición previa mínima a los antibióticos se incluirán en el diagnóstico de una infección que requiera una terapia con antibióticos a largo plazo, como osteomielitis o infección de prótesis articular, antes de comenzar la terapia con antibióticos. Examinaremos la microbiota de la piel, la saliva y el intestino antes de los antibióticos, así como la frecuencia de los genes de resistencia a los antibióticos albergados dentro de estas comunidades microbianas. Compararemos las comunidades microbianas y las frecuencias de los genes de resistencia a los antibióticos antes, durante y después del tratamiento prolongado con antibióticos en pacientes que toman antibióticos. También buscaremos alteraciones que ocurran entre los microbiomas o los genes de resistencia a los antibióticos entre los miembros del hogar de las personas que toman antibióticos.