Влияние продолжительной антибиотикотерапии на экспрессию генов комменсального микробного сообщества.

Антибиотики являются основой жизненно важных вмешательств, часто используемых в медицинской практике для борьбы с инфекциями. Эти лекарства не только нацелены на патогенные бактерии, для которых они прописаны, но также действуют против комменсальных бактериальных сообществ, населяющих кишечник, кожу и ротоглотку. Роль, которую эти нативные бактериальные сообщества играют в нормальных функциях хозяина, таких как питание и иммунитет хозяина, только начинают изучать, как и изменения в сообществах и их функциях в результате различных изменений в использовании антибиотиков. Было показано, что короткие курсы антибиотиков влияют на разнообразие местных бактериальных сообществ и влияют на обилие присутствующих генов устойчивости к антибиотикам. Например, было показано, что применение клиндамицина у людей в течение 7 дней приводит к стойкой резистентности к клиндамицину в течение месяцев или лет. Влияние длительной антибиотикотерапии на микробиом хозяина, включая как присутствующие организмы, так и разнообразие генов антибиотиков, не изучалось, и у нас очень мало понимания продольных эффектов антимикробной терапии на генетический репертуар, присутствующий в микробных сообществах человека. В этом исследовании мы изучим изменения в микробиоте, а также частоту генов устойчивости к антибиотикам, обнаруженных в микробиомах кожи, слюны и толстой кишки, в продольном направлении у субъектов, получающих длительную противомикробную терапию, а также у членов семьи человека, получающего антибактериальную терапию. Ранее здоровые пациенты с минимальным предшествующим воздействием антибиотиков будут включены в исследование при диагностировании инфекции, требующей длительной антибактериальной терапии, такой как остеомиелит или инфекция протезированных суставов, до начала антибактериальной терапии. Мы изучим микробиоту кожи, слюны и кишечника до антибиотиков, а также частоту генов устойчивости к антибиотикам, содержащихся в этих микробных сообществах. Мы сравним микробные сообщества и частоты генов устойчивости к антибиотикам до, во время и после длительного курса антибиотикотерапии у пациентов, принимающих антибиотики. Мы также будем искать изменения, которые происходят среди микробиомов или генов устойчивости к антибиотикам среди членов семьи людей, принимающих антибиотики.