揭示 KCTD 蛋白家族在儿童急性淋巴细胞白血病临床管理中的作用
2024年3月22日 更新者：IRCCS SYNLAB SDN
我们的研究小组对 B-ALL 患者的骨髓进行了转录组学分析，以鉴定具有疾病生物标志物推定作用的新型蛋白质/因子。
与一些已知的 B-ALL 生物标志物一起，我们的分析强调了新兴蛋白质类的一些成员的放松管制，这些蛋白质类被称为 KCTD（含钾通道四聚化结构域的蛋白质）。
从我们的初步观察开始，并考虑到 KCTD 从未在 ALL 中进行过研究，我们决定在我们的研究小组与 AORN Santobono-Pausilipon 儿科肿瘤医院合作招募的受 B 和 T-ALL 影响的儿科患者中研究这些蛋白质。确实, 目前的研究计划旨在为儿童白血病中 KCTD 蛋白的研究开辟一个新的场景。
该项目的最终目标是评估选定解除管制的 KCTD 作为可用于 B-ALL 和 T-ALL 诊断以及患者管理的新型生物标志物的转化相关性。
研究概览
研究类型
观察性的
注册 (估计的)
80
联系人和位置
本节提供了进行研究的人员的详细联系信息，以及有关进行该研究的地点的信息。
学习联系方式
- 姓名：Laura Pierri, MSC
- 电话号码：0812408470
- 邮箱：direzionescientifica.irccssdn@synlab.it
学习地点
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Naples、意大利、80143
- 招聘中
- Irccs Synlab Sdn
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接触：
- Laura Pierri, MSC
- 电话号码：0812408470
- 邮箱：direzionescientifica.irccssdn@synlab.it
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参与标准
研究人员寻找符合特定描述的人，称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。
资格标准
适合学习的年龄
1年 至 18年 (孩子、成人)
接受健康志愿者
是的
取样方法
非概率样本
研究人群
该研究预计有可能招募大约 60 名 B-ALL 患者和 15-20 名 T-ALL 患者。
此外，将招募年龄和性别与患者相当的对照受试者。
最后，将使用约100单位不符合治疗性冷冻保存标准且已同意用于科学研究的脐带血
描述
纳入标准：
- 诊断为 B-ALL 和 T-ALL 的 1-18 岁男女患者；
- 将签署知情同意书的患者
排除标准：
- 拒绝参加研究的患者；
- 不属于上述年龄范围的患者
学习计划
本节提供研究计划的详细信息，包括研究的设计方式和研究的衡量标准。
研究是如何设计的？
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
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小儿急性淋巴细胞白血病患者
1-16岁儿童急性淋巴细胞白血病患者
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从受试者血液中纯化的 MNC 中感兴趣的生物标志物（DNA-RNA 和蛋白质）的分析
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健康受试者
来自不能用于临床目的的健康捐赠者的脐带血
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从受试者血液中纯化的 MNC 中感兴趣的生物标志物（DNA-RNA 和蛋白质）的分析
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研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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与未受影响的对照相比，KCTD 表达水平，通过 RNAseq 方法，在 B 和 T 细胞 ALL 受影响的患者队列中
大体时间：1-12个月
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我们在这个项目中招募了大约 15-20 名 B-ALL 和 3-6 名 T-ALL 患者。用于转录组分析的 RNAseq 实验将在至少 8 名 B-ALL 患者和 3-4 名 T-ALL 患者的研究队列中进行, 以及从脐带血中纯化的幼稚 B 或 T 细胞相应地作为 B-ALL 和 T-ALL 的对照。
将使用原始计数并应用经验贝叶斯方法（DESeq2，R 包）。
对于每个基因，结果将包括对数倍变化 (log2)、基本平均值、p 值和调整后的 p 值 (Benjamimi-Hochberg)。 DEgenes 输出将导出为适合 IPA Ingenuity 通路分析软件 (Qiagen) 的格式，用于基因注释、功能分析和生物标志物预测。
将详细研究将在 B-ALL 和 T-ALL 中解除管制的 KCTD 蛋白。
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1-12个月
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通过功能蛋白质组学方法对解除管制的 KCTD 进行 RT-PCR 验证并鉴定白血病中可能的 KCTD 相互作用因子
大体时间：13-24个月
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在解释转录组数据后，我们将通过实时 pcr、westernblotting、流式细胞术和显微镜进行特定的验证实验。
简言之，将从约5e6个总MNC中纯化总RNA并用于RT-PCR实验；将收集 BM 涂片用于解除管制的 KCTD 的免疫荧光分析；蛋白质总提取物将从至少 1 e 6 个总 MNC 中获得，并储存在 -80°C 直至进行蛋白质印迹；最后，活的单核细胞将被处理用于感兴趣的 KCTD 的透化和细胞质免疫染色。
所有实验都将在 B-ALL 和 T-ALL 体外人体模型系统上进行，然后在患者和对照细胞上进行。
此外，为了确定 KCTD 蛋白可能的相互作用因子，我们将使用 B-ALL 和 T-ALL 细胞系进行功能蛋白质组学分析。
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13-24个月
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B-ALL患者临床资料与KCTDs表达水平的相关性
大体时间：25-36个月
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首先，我们将评估解除管制的 KCTD 蛋白作为新的白血病标志物的有效性，以通过多参数临床流式细胞术进行测试。
我们的研究团队已经制定了一个特定的协议，它能够用通常用于通过流式细胞术研究血液隔室的表面抗原染色细胞质抗原（如 KCTD 蛋白）。
这种方法在监测患者对治疗的反应以及检测微小残留病方面尤其有用。
此外，由于能够结合表面抗原检测细胞质 KCTD，我们计划描述骨髓和外周血中多个细胞群中的 KCTD 表达水平。其次，本研究中获得的总体数据也将根据患者进行解释特别参考对治疗的反应、复发的风险以及在可能的情况下对治疗的抵抗力。
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25-36个月
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合作者和调查者
在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。
研究记录日期
这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查，以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。
研究主要日期
学习开始 (实际的)
2020年3月2日
初级完成 (实际的)
2024年2月1日
研究完成 (估计的)
2025年7月31日
研究注册日期
首次提交
2023年1月27日
首先提交符合 QC 标准的
2023年2月6日
首次发布 (实际的)
2023年2月15日
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
2024年3月25日
上次提交的符合 QC 标准的更新
2024年3月22日
最后验证
2024年2月1日
更多信息
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