소아 급성 림프구성 백혈병의 임상적 관리에서 KCTD 단백질군의 역할 규명
2024년 3월 22일 업데이트: IRCCS SYNLAB SDN
B-ALL 환자의 골수에 대한 transcriptomic 분석은 질병 바이오 마커의 추정 역할을 가진 새로운 단백질/요인을 식별하기 위해 우리 연구 그룹에 의해 수행되었습니다.
이미 알려진 일부 B-ALL 바이오마커와 함께 우리의 분석은 KCTD(칼륨 채널 사분자화 도메인 함유 단백질)로 표시된 신흥 단백질 클래스의 일부 구성원의 규제 완화를 강조했습니다.
예비 관찰에서 시작하여 KCTD가 ALL에서 연구된 적이 없다는 점을 고려하여 우리는 AORN Santobono-Pausilipon 소아 종양 병원과 협력하여 연구 그룹에 등록된 B- 및 T-ALL 영향을 받는 소아 환자에서 이러한 단백질을 연구하기로 결정했습니다. , 현재 연구 프로그램은 소아 백혈병에서 KCTD 단백질 연구를 위한 새로운 시나리오를 여는 것을 목표로 합니다.
프로젝트의 최종 목표는 B-ALL 및 T-ALL 진단 및 환자 관리에 유용한 새로운 바이오마커로서 선택된 규제 완화된 KCTD의 번역 관련성을 평가하는 것입니다.
연구 개요
연구 유형
관찰
등록 (추정된)
80
연락처 및 위치
이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.
연구 연락처
- 이름: Laura Pierri, MSC
- 전화번호: 0812408470
- 이메일: direzionescientifica.irccssdn@synlab.it
연구 장소
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Naples, 이탈리아, 80143
- 모병
- Irccs Synlab Sdn
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연락하다:
- Laura Pierri, MSC
- 전화번호: 0812408470
- 이메일: direzionescientifica.irccssdn@synlab.it
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참여기준
연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.
자격 기준
공부할 수 있는 나이
1년 (어린이, 성인)
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
예
샘플링 방법
비확률 샘플
연구 인구
이 연구는 B-ALL 환자 약 60명과 T-ALL 환자 15-20명을 모집할 가능성을 예견합니다.
또한, 환자와 비슷한 연령 및 성별의 대조군을 모집할 것이다.
마지막으로 치료적 동결보존 기준에 맞지 않아 과학적 연구용으로 사용이 승인된 제대혈 약 100단위를 사용하게 된다.
설명
포함 기준:
- B-ALL 및 T-ALL로 진단된 남녀 모두 1-18세의 환자;
- 정보에 입각한 동의서에 서명할 환자
제외 기준:
- 연구 참여를 거부하는 환자
- 위에 언급된 연령대에 속하지 않는 환자
공부 계획
이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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소아 급성 림프구성 백혈병 환자
급성 림프구성 백혈병에 걸린 1-16세의 소아 환자
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대상자의 혈액에서 정제된 MNC의 관심 바이오마커(DNA-RNA 및 단백질) 분석
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건강한 과목
임상 목적으로 사용할 수 없는 건강한 기증자의 제대혈
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대상자의 혈액에서 정제된 MNC의 관심 바이오마커(DNA-RNA 및 단백질) 분석
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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영향을 받지 않은 대조군과 비교하여 B 및 T 세포 ALL 영향을 받은 환자의 코호트에서 RNAseq 접근법에 의한 KCTD 발현 수준
기간: 1-12개월
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우리는 이 프로젝트 동안 약 15-20명의 B-ALL 환자와 3-6명의 T-ALL 환자를 등록합니다. 트랜스크립톰 분석을 위한 RNAseq 실험은 최소 8명의 B-ALL 환자, 3-4명의 T-ALL 환자로 구성된 연구 코호트에서 수행됩니다. , 및 B-및 T-ALL에 대한 대조군으로서 제대혈로부터 정제된 나이브 B 또는 T 세포.
원시 카운트가 사용되고 경험적 Bayes 접근법이 적용됩니다(DESeq2, R 패키지).
결과에는 각 유전자에 대한 로그 배수 변화(log2), 기본 평균, p-값 및 조정된 p-값(Benjamimi-Hochberg)이 포함됩니다. DEgenes 출력은 유전자 주석, 기능 분석 및 바이오마커 예측을 위해 IPA 독창성 경로 분석 소프트웨어(Qiagen)에 적합한 형식으로 내보내집니다.
B-ALL과 T-ALL에서 규제완화될 KCTD 단백질에 대해 자세히 연구할 예정이다.
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1-12개월
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탈규제된 KCTD의 RT-PCR 검증 및 기능적 프로테오믹 접근법에 의한 백혈병에서 가능한 KCTD 상호작용자의 식별
기간: 13-24개월
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Transcriptome 데이터를 해석한 후 실시간 pcr, westernblotting, 유동 세포 계측법 및 현미경 검사를 통해 특정 검증 실험을 수행합니다.
간단히 말해서 총 RNA는 약 5e6 총 MNC에서 정제되어 RT-PCR 실험에 사용됩니다. 규제 해제된 KCTD의 면역형광 분석을 위해 BM 스미어를 수집합니다. 단백질 총 추출물은 최소 1e 6 총 MNC에서 얻어지고 Western Blotting까지 -80°C에서 보관됩니다. 마지막으로, 살아있는 단핵 세포는 관심 있는 KCTD의 투과성 및 세포질 면역염색을 위해 처리될 것입니다.
모든 실험은 B- 및 T-ALL in vitro 인간 모델 시스템에 정착한 다음 환자 및 대조군 세포에서 수행됩니다.
또한 KCTD 단백질의 가능한 상호 작용자를 확인하기 위해 기능적 프로테오믹스 분석을 위해 B-ALL 및 T-ALL 세포주를 사용할 것입니다.
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13-24개월
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KCTD 발현 수준과 B-ALL 환자 임상 데이터의 상관관계
기간: 25~36개월
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첫째, 우리는 다중 매개변수 임상 유세포 분석법으로 테스트할 백혈병의 새로운 마커로서 탈조절된 KCTD 단백질의 유용성을 평가할 것입니다.
우리 연구팀은 특정 프로토콜을 이미 설정했으며, 유세포 분석법으로 혈액 구획을 연구하는 데 일반적으로 사용되는 표면 항원으로 세포질 항원(예: KCTD 단백질)을 염색할 수 있습니다.
이 접근법은 치료에 대한 환자의 반응을 모니터링하고 최소 잔여 질병을 감지하는 데 특히 유용합니다.
또한 표면항원과 결합하여 세포질 KCTD를 검출할 수 있으므로 골수 및 말초혈액에 상주하는 다세포 집단에서 KCTD 발현 수준을 기술하고자 하였다. 치료에 대한 반응, 재발 위험 및 가능할 경우 치료에 대한 내성을 특별히 참조하는 클리닉.
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25~36개월
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공동 작업자 및 조사자
여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.
연구 기록 날짜
이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
2020년 3월 2일
기본 완료 (실제)
2024년 2월 1일
연구 완료 (추정된)
2025년 7월 31일
연구 등록 날짜
최초 제출
2023년 1월 27일
QC 기준을 충족하는 최초 제출
2023년 2월 6일
처음 게시됨 (실제)
2023년 2월 15일
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
2024년 3월 25일
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
2024년 3월 22일
마지막으로 확인됨
2024년 2월 1일
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
추가 관련 MeSH 약관
기타 연구 ID 번호
- 5/19
개별 참가자 데이터(IPD) 계획
개별 참가자 데이터(IPD)를 공유할 계획입니까?
아니요
약물 및 장치 정보, 연구 문서
미국 FDA 규제 의약품 연구
아니
미국 FDA 규제 기기 제품 연구
아니
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관찰 연구에 대한 임상 시험
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Guangzhou Women and Children's Medical Center아직 모집하지 않음NEC - 괴사성 장염
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Monash UniversityThe Alfred; Melbourne Sexual Health Centre모병매독중국, 호주, 남아프리카, 영국
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IRCCS San Raffaele모집하지 않고 적극적으로
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University of CagliariUniversity of Milano Bicocca; University of Milan; University of Cagliari, Cagliari, Italy; Università Cattolica del Sacro Cuore, Rome, Italy모병연조직 감염 | Fournier 괴저 | 괴사성 근막염 | Fournier의 괴저이탈리아
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IRCCS San Raffaele아직 모집하지 않음
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PeriPharm완전한