Avdekke rollen til KCTD-proteinfamilien i den kliniske behandlingen av akutte lymfoblastiske leukemier i barndommen
22. mars 2024 oppdatert av: IRCCS SYNLAB SDN
En transkriptomisk analyse av benmarg fra B-ALL-pasienter ble utført av vår forskningsgruppe for å identifisere nytt protein/faktor med en antatt rolle som sykdomsbiomarkør.
Sammen med noen allerede kjente B-ALL-biomarkører, fremhevet vår analyse deregulering av noen medlemmer av en fremvoksende proteinklasse betegnet som KCTD (Potassium ChannelTetramerization Domain-containing proteins).
Med utgangspunkt i våre foreløpige observasjoner, og tatt i betraktning at KCTD-er aldri har blitt studert i ALL, bestemte vi oss for å studere disse proteinene i B- og T-ALL-påvirkede pediatriske pasienter, registrert av vår forskningsgruppe i samarbeid med AORN Santobono-Pausilipon pediatrisk onkologisk sykehus. , har det nåværende forskningsprogrammet som mål å åpne et nytt scenario for studiet av KCTD-proteiner i barneleukemier.
Det endelige målet med prosjektet vil være å evaluere translasjonsrelevansen til utvalgte deregulerte KCTD-er som nye biomarkører som er nyttige for B-ALL- og T-ALL-diagnostikk, og pasientbehandling.
Studieoversikt
Status
Rekruttering
Intervensjon / Behandling
Studietype
Observasjonsmessig
Registrering (Antatt)
80
Kontakter og plasseringer
Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.
Studiekontakt
- Navn: Laura Pierri, MSC
- Telefonnummer: 0812408470
- E-post: direzionescientifica.irccssdn@synlab.it
Studiesteder
-
-
-
Naples, Italia, 80143
- Rekruttering
- Irccs Synlab Sdn
-
Ta kontakt med:
- Laura Pierri, MSC
- Telefonnummer: 0812408470
- E-post: direzionescientifica.irccssdn@synlab.it
-
-
Deltakelseskriterier
Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
1 år til 18 år (Barn, Voksen)
Tar imot friske frivillige
Ja
Prøvetakingsmetode
Ikke-sannsynlighetsprøve
Studiepopulasjon
Studien legger opp til muligheten for å rekruttere ca. 60 pasienter med B-ALL og 15-20 pasienter med T-ALL.
Videre skal det rekrutteres kontrollpersoner med alder og kjønn som kan sammenlignes med pasientene.
Til slutt vil det bli brukt om lag 100 enheter navlestrengsblod som ikke oppfyller kriteriene for terapeutisk kryokonservering og som det er gitt samtykke til for bruk til vitenskapelig forskning.
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Pasienter i alderen 1-18 år av begge kjønn diagnostisert med B-ALL og T-ALL;
- Pasienter som skal ha signert det informerte samtykket
Ekskluderingskriterier:
- Pasienter som nekter å delta i studien;
- Pasienter som ikke faller innenfor aldersområdet nevnt ovenfor
Studieplan
Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Pediatriske pasienter med akutt lymfatisk leukemi
pediatriske pasienter i alderen 1-16 år rammet av akutt lymfatisk leukemi
|
analyse av biomarkører av interesse (DNA-RNA og proteiner) i MNC renset fra forsøkspersonenes blod
|
|
friske forsøkspersoner
navlestrengsblod fra friske givere som ikke kan brukes til kliniske formål
|
analyse av biomarkører av interesse (DNA-RNA og proteiner) i MNC renset fra forsøkspersonenes blod
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
KCTD-ekspresjonsnivåer, ved RNAseq-tilnærming, i en kohort av B- og T-celle-alle berørte pasienter sammenlignet med upåvirkede kontroller
Tidsramme: 1-12 måneder
|
Vi registrerer i løpet av dette prosjektet ca. 15-20 B-ALL-pasienter og 3-6 T-ALL-pasienter. RNAseq-eksperimenter for transkriptomanalyse vil bli utført på en studiekohort med minst 8 B-ALL-pasienter, 3-4 T-ALL-pasienter , og naive B- eller T-celler renset fra navlestrengsblod som kontroll for B- og T-ALL tilsvarende.
Råtellinger vil bli brukt og en empirisk Bayes-tilnærming brukt (DESeq2, R-pakke).
Resultatene vil inkludere, for hvert gen, log-fold endring (log2), basismiddelverdi, p-verdi og justerte p-verdier (Benjamimi-Hochberg). DEgenes utdata vil bli eksportert til et format som er egnet for IPA Ingenuity pathway AnalysisSoftware (Qiagen), for genkommentarer, funksjonell analyse og biomarkørprediksjon.
KCTD-proteinene som vil bli deregulert i B-ALL og T-ALL vil bli studert i detalj.
|
1-12 måneder
|
|
RT-PCR-validering av deregulerte KCTD-er og identifisering av mulige KCTD-interaktører i leukemi ved funksjonell proteomisk tilnærming
Tidsramme: 13-24 måneder
|
Etter tolkningen av transkriptomdata vil vi utføre spesifikke valideringseksperimenter ved reat-time pcr, westernblotting, flowcytometri og mikroskopi.
Kort fortalt vil totalt RNA bli renset fra ca. 5e6 total MNC og brukt til RT-PCR-eksperimenter; BM-utstryk vil bli samlet inn for immunfluorescensanalyse av deregulerte KCTD-er; protein totalt ekstrakt vil bli oppnådd fra minst 1 e 6 total MNC og lagret ved -80°C inntil Western Blotting; til slutt vil levende mononukleære celler bli behandlet for permeabilisering og cytoplasmatisk immunfarging av KCTDene av interesse.
Alle eksperimenter vil bli satt opp på B- og T-ALL in vitro humane modellsystemer og deretter utført på pasient- og kontrollceller.
For å identifisere mulige interaktører av KCTDs proteiner vil vi dessuten bruke B-ALL og T-ALL cellelinjer for funksjonell proteomikkanalyse.
|
13-24 måneder
|
|
Korrelasjon av B-ALL-pasienters kliniske data med KCTDs ekspresjonsnivå
Tidsramme: 25-36 måneder
|
For det første vil vi evaluere nytten av de deregulerte KCTD-proteinene som nye markører for leukemi som skal testes ved multiparametrisk klinisk flowcytometri.
En spesifikk protokoll er allerede satt opp av vårt forskningsteam, og den er i stand til å farge cytoplasmiske antigener (som KCTD-proteiner) med overflateantigener som vanligvis brukes til å studere hematoogiske rom ved hjelp av flowcytometri.
Denne tilnærmingen vil være nyttig spesielt for å overvåke pasientrespons på behandling samt påvisning av minimal gjenværende sykdom.
For å kunne påvise cytoplasmatiske KCTD-er i kombinasjon med overflateantigener, planla vi dessuten å beskrive KCTD-ekspresjonsnivåene i multiple cellulære populasjoner som bor i marg og perifert blod. For det andre vil de samlede dataene som er oppnådd i denne studien også bli tolket ved å se på pasienten klinikker med særlig referanse til respons på terapi, risiko for tilbakefall og, når mulig, motstand mot terapi.
|
25-36 måneder
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.
Sponsor
Samarbeidspartnere
Studierekorddatoer
Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
2. mars 2020
Primær fullføring (Faktiske)
1. februar 2024
Studiet fullført (Antatt)
31. juli 2025
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
27. januar 2023
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
6. februar 2023
Først lagt ut (Faktiske)
15. februar 2023
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
25. mars 2024
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
22. mars 2024
Sist bekreftet
1. februar 2024
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- 5/19
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
NEI
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Nei
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Nei
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .