Ta strona została przetłumaczona automatycznie i dokładność tłumaczenia nie jest gwarantowana. Proszę odnieść się do angielska wersja za tekst źródłowy.

Odkrywanie roli rodziny białek KCTD w leczeniu klinicznym ostrych białaczek limfoblastycznych wieku dziecięcego

22 marca 2024 zaktualizowane przez: IRCCS SYNLAB SDN
Nasza grupa badawcza przeprowadziła transkryptomiczną analizę szpiku kostnego pacjentów z B-ALL w celu zidentyfikowania nowego białka/czynnika o przypuszczalnej roli biomarkera choroby. Wraz z niektórymi już znanymi biomarkerami B-ALL, nasza analiza ujawniła deregulację niektórych członków powstającej klasy białek oznaczonej jako KCTD (białka zawierające domenę tetrameryzacji kanałów potasowych). Rozpoczynając od naszych wstępnych obserwacji i biorąc pod uwagę, że KCTD nigdy nie były badane w ALL, zdecydowaliśmy się zbadać te białka u pacjentów pediatrycznych dotkniętych B- i T-ALL, włączonych przez naszą grupę badawczą we współpracy z pediatrycznym szpitalem onkologicznym AORN Santobono-Pausilipon. Rzeczywiście , obecny program badawczy ma na celu otwarcie nowego scenariusza badań białek KCTD w białaczkach dziecięcych. Ostatecznym celem projektu będzie ocena znaczenia translacyjnego wybranych zderegulowanych KCTD jako nowych biomarkerów przydatnych w diagnostyce B-ALL i T-ALL oraz leczeniu pacjentów.

Przegląd badań

Status

Rekrutacyjny

Warunki

Interwencja / Leczenie

Typ studiów

Obserwacyjny

Zapisy (Szacowany)

80

Kontakty i lokalizacje

Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.

Kontakt w sprawie studiów

Lokalizacje studiów

Kryteria uczestnictwa

Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.

Kryteria kwalifikacji

Wiek uprawniający do nauki

1 rok do 18 lat (Dziecko, Dorosły)

Akceptuje zdrowych ochotników

Tak

Metoda próbkowania

Próbka bez prawdopodobieństwa

Badana populacja

Do badania przewiduje się możliwość rekrutacji około 60 pacjentów z B-ALL i 15-20 pacjentów z T-ALL. Ponadto rekrutowane będą osoby kontrolne w wieku i płci porównywalne z pacjentami. Docelowo wykorzystanych zostanie ok. 100 jednostek krwi pępowinowej niespełniającej kryteriów kriokonserwacji terapeutycznej, co do której wyrażono zgodę na ich wykorzystanie do badań naukowych

Opis

Kryteria przyjęcia:

  • Pacjenci w wieku 1-18 lat obojga płci z rozpoznaniem B-ALL i T-ALL;
  • Pacjenci, którzy podpiszą świadomą zgodę

Kryteria wyłączenia:

  • Pacjenci, którzy odmówią udziału w badaniu;
  • Pacjenci, którzy nie mieszczą się w podanym powyżej przedziale wiekowym

Plan studiów

Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.

Jak projektuje się badanie?

Szczegóły projektu

Kohorty i interwencje

Grupa / Kohorta
Interwencja / Leczenie
Pacjenci z ostrą białaczką limfoblastyczną u dzieci
dzieci w wieku 1-16 lat dotkniętych ostrą białaczką limfoblastyczną
Inny: badania obserwacyjne
analiza interesujących biomarkerów (DNA-RNA i białek) w MNC oczyszczonych z krwi badanych
zdrowe przedmioty
krwi pępowinowej od zdrowych dawców, której nie można wykorzystać do celów klinicznych
Inny: badania obserwacyjne
analiza interesujących biomarkerów (DNA-RNA i białek) w MNC oczyszczonych z krwi badanych

Co mierzy badanie?

Podstawowe miary wyniku

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Poziomy ekspresji KCTD, według podejścia RNAseq, w kohorcie pacjentów dotkniętych ALL komórkami B i T w porównaniu z kontrolami zdrowymi
Ramy czasowe: 1-12 miesięcy
W ramach tego projektu zapiszemy około 15-20 pacjentów z B-ALL i 3-6 pacjentów z T-ALL. Eksperymenty RNAseq do analizy transkryptomu zostaną przeprowadzone na kohorcie badawczej obejmującej co najmniej 8 pacjentów z B-ALL, 3-4 pacjentów z T-ALL i naiwne komórki B lub T oczyszczone z krwi pępowinowej jako odpowiednio kontrola dla B- i T-ALL. Zostaną użyte surowe obliczenia i zastosowane zostanie empiryczne podejście Bayesa (DESeq2, pakiet R). Wyniki będą obejmować, dla każdego genu, zmianę logarytmiczną (log2), średnią podstawową, wartość p i skorygowane wartości p (Benjamimi-Hochberg). Dane wyjściowe DEgenes zostaną wyeksportowane do formatu odpowiedniego dla oprogramowania IPA Ingenuity path Analysis Software (Qiagen), do adnotacji genów, analizy funkcjonalnej i przewidywania biomarkerów. Białka KCTD, które zostaną rozregulowane w B-ALL i T-ALL, zostaną szczegółowo zbadane.
1-12 miesięcy
Walidacja RT-PCR zderegulowanych KCTD i identyfikacja możliwych interakcji KCTD w białaczce za pomocą funkcjonalnego podejścia proteomicznego
Ramy czasowe: 13-24 miesiące
Po interpretacji danych z transkryptomu przeprowadzimy specyficzne eksperymenty walidacyjne poprzez reat-time PCR, westernblotting, cytometrię przepływową i mikroskopię. Pokrótce, całkowity RNA zostanie oczyszczony z około 5e6 całkowitych MNC i użyty do eksperymentów RT-PCR; Rozmaz BM zostanie pobrany do analizy immunofluorescencyjnej rozregulowanych KCTD; całkowity ekstrakt białkowy zostanie uzyskany z co najmniej 1 e 6 całkowitych MNC i będzie przechowywany w -80°C aż do analizy Western Blot; wreszcie, żywe komórki jednojądrzaste zostaną poddane obróbce pod kątem permeabilizacji i immunobarwienia cytoplazmatycznego KCTD będących przedmiotem zainteresowania. Wszystkie eksperymenty zostaną przeprowadzone na ludzkich modelach B- i T-ALL in vitro, a następnie przeprowadzone na pacjentach i komórkach kontrolnych. Ponadto, w celu identyfikacji możliwych interakcji białek KCTD, do analizy proteomiki funkcjonalnej wykorzystamy linie komórkowe B-ALL i T-ALL.
13-24 miesiące
Korelacja danych klinicznych pacjentów z B-ALL z poziomem ekspresji KCTD
Ramy czasowe: 25-36 miesięcy
Po pierwsze, ocenimy przydatność rozregulowanych białek KCTD jako nowych markerów białaczki do testowania za pomocą wieloparametrycznej klinicznej cytometrii przepływowej. Specjalny protokół został już opracowany przez nasz zespół badawczy i umożliwia barwienie antygenów cytoplazmatycznych (takich jak białka KCTD) antygenami powierzchniowymi powszechnie używanymi do badania kompartmentów hematoogicznych za pomocą cytometrii przepływowej. Takie podejście będzie przydatne zwłaszcza w monitorowaniu odpowiedzi pacjenta na leczenie, a także wykrywaniu minimalnej choroby resztkowej. Ponadto, będąc w stanie wykryć cytoplazmatyczne KCTD w połączeniu z antygenami powierzchniowymi, planowaliśmy opisać poziomy ekspresji KCTD w populacji wielu komórek rezydujących w szpiku i krwi obwodowej. Po drugie, ogólne dane uzyskane w tym badaniu będą również interpretowane patrząc na pacjenta klinik, ze szczególnym uwzględnieniem odpowiedzi na terapię, ryzyka nawrotu choroby oraz, jeśli to możliwe, oporności na terapię.
25-36 miesięcy

Współpracownicy i badacze

Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.

Sponsor

IRCCS SYNLAB SDN

Współpracownicy

Santobono-Pausilipon Hospital

Daty zapisu na studia

Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.

Główne daty studiów

Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)

2 marca 2020

Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)

1 lutego 2024

Ukończenie studiów (Szacowany)

31 lipca 2025

Daty rejestracji na studia

Pierwszy przesłany

27 stycznia 2023

Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości

6 lutego 2023

Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)

15 lutego 2023

Aktualizacje rekordów badań

Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)

25 marca 2024

Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości

22 marca 2024

Ostatnia weryfikacja

1 lutego 2024

Więcej informacji

Terminy związane z tym badaniem

Dodatkowe istotne warunki MeSH

Inne numery identyfikacyjne badania

  • 5/19

Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)

Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?

NIE

Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze

Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .

Badania kliniczne na Dziecięca ostra białaczka limfoblastyczna

Badania kliniczne na badania obserwacyjne

Wyszukaj podobne próby

Sponsorzy i współpracownicy

Warunki medyczne

Interwencje lekowe

CROs by country

CROs in Czech Republic

Warunki

Rzadkie choroby

Interwencje lekowe

Suplementy diety

Sponsor / Współpracownicy

Lokalizacje

Subskrybuj