Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Optrævling af KCTD-proteinfamiliens rolle i den kliniske behandling af akutte lymfoblastiske leukæmier i barndommen

22. marts 2024 opdateret af: IRCCS SYNLAB SDN
En transkriptomisk analyse af knoglemarv fra B-ALL-patienter blev udført af vores forskningsgruppe for at identificere nyt protein/faktor med en formodet rolle som sygdomsbiomarkør. Sammen med nogle allerede kendte B-ALL-biomarkører fremhævede vores analyse deregulering af nogle medlemmer af en spirende proteinklasse betegnet som KCTD (Kalium ChannelTetramerization Domain-holdige proteiner). Med udgangspunkt i vores foreløbige observationer og i betragtning af, at KCTD'er aldrig er blevet undersøgt i ALLE, besluttede vi at undersøge disse proteiner i B- og T-ALL-ramte pædiatriske patienter, indskrevet af vores forskningsgruppe i samarbejde med AORN Santobono-Pausilipon pædiatrisk onkologisk hospital. , sigter det nuværende forskningsprogram på at åbne et nyt scenarie for undersøgelse af KCTD-proteiner i børneleukæmi. Det endelige mål med projektet vil være at evaluere den translationelle relevans af udvalgte deregulerede KCTD'er som nye biomarkører, der er nyttige til B-ALL- og T-ALL-diagnostik og patientbehandling.

Studieoversigt

Status

Rekruttering

Intervention / Behandling

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Anslået)

80

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiekontakt

Studiesteder

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

1 år til 18 år (Barn, Voksen)

Tager imod sunde frivillige

Ja

Prøveudtagningsmetode

Ikke-sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Undersøgelsen forudser muligheden for at rekruttere ca. 60 patienter med B-ALL og 15-20 patienter med T-ALL. Endvidere vil der blive rekrutteret kontrolpersoner med alder og køn, der kan sammenlignes med patienternes. Endelig vil der blive brugt omkring 100 enheder navlestrengsblod, der ikke opfylder kriterierne for terapeutisk kryokonservering, og som der er givet samtykke til til brug for videnskabelig forskning.

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • Patienter i alderen 1-18 år af begge køn diagnosticeret med B-ALL og T-ALL;
  • Patienter, der vil have underskrevet det informerede samtykke

Ekskluderingskriterier:

  • Patienter, der nægter at deltage i undersøgelsen;
  • Patienter, der ikke falder inden for aldersgruppen nævnt ovenfor

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

Kohorter og interventioner

Gruppe / kohorte
Intervention / Behandling
Pædiatriske patienter med akut lymfatisk leukæmi
pædiatriske patienter i alderen 1-16 år ramt af akut lymfatisk leukæmi
analyse af biomarkører af interesse (DNA-RNA og proteiner) i MNC oprenset fra forsøgspersonernes blod
sunde forsøgspersoner
navlestrengsblod fra raske donorer, der ikke kan bruges til kliniske formål
analyse af biomarkører af interesse (DNA-RNA og proteiner) i MNC oprenset fra forsøgspersonernes blod

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
KCTD-ekspressionsniveauer, ved RNAseq-tilgang, i en kohorte af B- og T-celle-ALL påvirkede patienter sammenlignet med upåvirkede kontroller
Tidsramme: 1-12 måneder
Vi tilmelder i løbet af dette projekt omkring 15-20 B-ALL- og 3-6 T-ALL-patienter. RNAseq-eksperimenter til transkriptomanalyse vil blive udført på en studiekohorte på mindst 8 B-ALL-patienter, 3-4 T-ALL-patienter og naive B- eller T-celler oprenset fra navlestrengsblod som kontrol for B- og T-ALL tilsvarende. Råtællinger vil blive brugt og en empirisk Bayes-tilgang anvendt (DESeq2, R-pakke). Resultaterne vil for hvert gen inkludere log-fold ændring (log2), basismiddelværdi, p-værdi og justerede p-værdier (Benjamimi-Hochberg). DEgenes output vil blive eksporteret til et format, der er egnet til IPA Ingenuity pathway AnalysisSoftware (Qiagen), til genannoteringer, funktionel analyse og biomarkør forudsigelse. KCTD-proteinerne, der vil blive dereguleret i B-ALL og T-ALL, vil blive undersøgt i detaljer.
1-12 måneder
RT-PCR validering af deregulerede KCTD'er og identifikation af mulige KCTD'er interaktorer i leukæmi ved funktionel proteomisk tilgang
Tidsramme: 13-24 måneder
Efter fortolkningen af ​​transkriptomdata vil vi udføre specifikke valideringseksperimenter ved reat-time pcr, westernblotting, flowcytometri og mikroskopi. Kort fortalt vil total RNA blive oprenset fra ca. 5e6 total MNC og anvendt til RT-PCR eksperimenter; BM-udstrygning vil blive indsamlet til immunfluorescensanalyse af deregulerede KCTD'er; protein totalekstrakt vil blive opnået fra mindst 1 e 6 total MNC og opbevaret ved -80°C indtil Western Blotting; endelig vil levende mononukleære celler blive behandlet for permeabilisering og cytoplasmatisk immunfarvning af KCTD'erne af interesse. Alle eksperimenter vil blive afviklet på B- og T-ALL in vitro humane modelsystemer og derefter udført på patienter og kontrolceller. For at identificere mulige interaktorer af KCTDs proteiner vil vi desuden bruge B-ALL og T-ALL cellelinjer til funktionel proteomisk analyse.
13-24 måneder
Korrelation af B-ALL patienters kliniske data med KCTDs ekspressionsniveau
Tidsramme: 25-36 måneder
For det første vil vi evaluere anvendeligheden af ​​de deregulerede KCTD-proteiner som nye markører for leukæmi, der skal testes ved multiparametrisk klinisk flowcytometri. En specifik protokol er allerede blevet sat op af vores forskerhold, og den er i stand til at farve cytoplasmiske antigener (såsom KCTD-proteiner) med overfladeantigener, der almindeligvis bruges til at studere hæmatoogiske rum ved flowcytometri. Denne tilgang vil især være nyttig til overvågning af patientrespons på behandling samt påvisning af minimal resterende sygdom. Da vi desuden var i stand til at påvise cytoplasmatiske KCTD'er i kombination med overfladeantigener, planlagde vi at beskrive KCTD's ekspressionsniveauer i multiple cellulære populationer, der bor i marv og perifert blod. For det andet vil de overordnede data opnået i denne undersøgelse også blive fortolket under hensyntagen til patienten klinikker med særlig henvisning til respons på terapi, risiko for tilbagefald og, når det er muligt, modstand mod terapi.
25-36 måneder

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Samarbejdspartnere

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

2. marts 2020

Primær færdiggørelse (Faktiske)

1. februar 2024

Studieafslutning (Anslået)

31. juli 2025

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

27. januar 2023

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

6. februar 2023

Først opslået (Faktiske)

15. februar 2023

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

25. marts 2024

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

22. marts 2024

Sidst verificeret

1. februar 2024

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Plan for individuelle deltagerdata (IPD)

Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?

INGEN

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Akut lymfoblastisk leukæmi i barndommen

Kliniske forsøg med observationsstudie

Abonner