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Aufklärung der Rolle der KCTD-Proteinfamilie bei der klinischen Behandlung akuter lymphoblastischer Leukämien im Kindesalter

22. März 2024 aktualisiert von: IRCCS SYNLAB SDN
Eine transkriptomische Analyse des Knochenmarks von B-ALL-Patienten wurde von unserer Forschungsgruppe durchgeführt, um neue Proteine/Faktoren mit einer mutmaßlichen Rolle als Krankheits-Biomarker zu identifizieren. Neben einigen bereits bekannten B-ALL-Biomarkern hob unsere Analyse die Deregulierung einiger Mitglieder einer neuen Proteinklasse hervor, die als KCTD (Kaliumkanal-Tetramerisierungsdomänen enthaltende Proteine) bezeichnet wird. Ausgehend von unseren vorläufigen Beobachtungen und unter Berücksichtigung der Tatsache, dass KCTDs noch nie bei ALL untersucht wurden, entschieden wir uns, diese Proteine ​​bei von B- und T-ALL betroffenen pädiatrischen Patienten zu untersuchen, die von unserer Forschungsgruppe in Zusammenarbeit mit dem pädiatrischen onkologischen Krankenhaus AORN Santobono-Pausilipon aufgenommen wurden. In der Tat zielt das vorliegende Forschungsprogramm darauf ab, ein neues Szenario für die Untersuchung von KCTD-Proteinen bei Leukämien im Kindesalter zu eröffnen. Das endgültige Ziel des Projekts wird es sein, die translationale Relevanz ausgewählter deregulierter KCTDs als neuartige Biomarker zu bewerten, die für die B-ALL- und T-ALL-Diagnostik und das Patientenmanagement nützlich sind.

Studienübersicht

Status

Rekrutierung

Bedingungen

Intervention / Behandlung

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Geschätzt)

80

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienkontakt

Studienorte

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

1 Jahr bis 18 Jahre (Kind, Erwachsene)

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Ja

Probenahmeverfahren

Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

Studienpopulation

Die Studie sieht die Möglichkeit vor, etwa 60 Patienten mit B-ALL und 15-20 Patienten mit T-ALL zu rekrutieren. Darüber hinaus werden Kontrollpersonen mit vergleichbarem Alter und Geschlecht wie die Patienten rekrutiert. Schließlich werden etwa 100 Einheiten Nabelschnurblut verwendet, die die Kriterien für eine therapeutische Kryokonservierung nicht erfüllen und für deren Verwendung für die wissenschaftliche Forschung eine Einwilligung erteilt wurde

Beschreibung

Einschlusskriterien:

  • Patienten im Alter von 1-18 Jahren beiderlei Geschlechts mit diagnostizierter B-ALL und T-ALL;
  • Patienten, die die Einverständniserklärung unterschrieben haben

Ausschlusskriterien:

  • Patienten, die sich weigern, an der Studie teilzunehmen;
  • Patienten, die nicht in die oben genannte Altersgruppe fallen

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

Kohorten und Interventionen

Gruppe / Kohorte
Intervention / Behandlung
Pädiatrische Patienten mit akuter lymphoblastischer Leukämie
pädiatrische Patienten im Alter von 1-16 Jahren mit akuter lymphoblastischer Leukämie
Sonstiges: Beobachtungsstudie
Analyse von Biomarkern von Interesse (DNA-RNA und Proteine) in MNC, die aus dem Blut der Probanden gereinigt wurden
gesunde Themen
Nabelschnurblut von gesunden Spendern, das nicht für klinische Zwecke verwendet werden kann
Sonstiges: Beobachtungsstudie
Analyse von Biomarkern von Interesse (DNA-RNA und Proteine) in MNC, die aus dem Blut der Probanden gereinigt wurden

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
KCTD-Expressionsniveaus nach RNAseq-Ansatz in einer Kohorte von B- und T-Zell-ALL-betroffenen Patienten im Vergleich zu nicht betroffenen Kontrollen
Zeitfenster: 1-12 Monate
Wir nehmen während dieses Projekts etwa 15–20 B-ALL- und 3–6 T-ALL-Patienten auf. RNAseq-Experimente zur Transkriptomanalyse werden an einer Studienkohorte von mindestens 8 B-ALL-Patienten und 3–4 T-ALL-Patienten durchgeführt und aus Nabelschnurblut gereinigte naive B- oder T-Zellen als Kontrolle für B- und T-ALL entsprechend. Es werden Rohzählungen verwendet und ein empirischer Bayes-Ansatz angewendet (DESeq2, R-Paket). Die Ergebnisse umfassen für jedes Gen die logarithmische Änderung (log2), den Basismittelwert, den p-Wert und die angepassten p-Werte (Benjamimi-Hochberg). Die DEgenes-Ausgabe wird in ein Format exportiert, das für die IPA Ingenuity Pathway AnalysisSoftware (Qiagen) für Genannotationen, Funktionsanalyse und Biomarkervorhersage geeignet ist. Die KCTD-Proteine, die in B-ALL und T-ALL dereguliert werden, werden im Detail untersucht.
1-12 Monate
RT-PCR-Validierung von deregulierten KCTDs und Identifizierung möglicher KCTDs-Interaktoren bei Leukämie durch einen funktionellen proteomischen Ansatz
Zeitfenster: 13-24 Monate
Nach der Interpretation der Transkriptomdaten führen wir spezifische Validierungsexperimente durch Echtzeit-PCR, Westernblot, Durchflusszytometrie und Mikroskopie durch. Kurz gesagt, Gesamt-RNA wird aus etwa 5e6 Gesamt-MNC gereinigt und für RT-PCR-Experimente verwendet; BM-Abstrich wird für die Immunfluoreszenzanalyse von deregulierten KCTDs gesammelt; Protein-Gesamtextrakt wird aus mindestens 1 e 6 Gesamt-MNC erhalten und bis zum Western Blotting bei –80 °C gelagert; Schließlich werden lebende mononukleäre Zellen auf Permeabilisierung und zytoplasmatische Immunfärbung der interessierenden KCTDs untersucht. Alle Experimente werden an B- und T-ALL-In-vitro-Menschmodellsystemen durchgeführt und dann an Patienten und Kontrollzellen durchgeführt. Um mögliche Interaktoren von KCTDs-Proteinen zu identifizieren, werden wir außerdem B-ALL- und T-ALL-Zelllinien für funktionelle Proteomik-Analysen verwenden.
13-24 Monate
Korrelation der klinischen Daten von B-ALL-Patienten mit dem KCTD-Expressionsniveau
Zeitfenster: 25-36 Monate
Zunächst werden wir die Nützlichkeit der deregulierten KCTD-Proteine ​​als neuartige Marker für Leukämie evaluieren, die durch multiparametrische klinische Durchflusszytometrie getestet werden sollen. Ein spezifisches Protokoll wurde bereits von unserem Forschungsteam erstellt und ist in der Lage, zytoplasmatische Antigene (wie KCTD-Proteine) mit Oberflächenantigenen zu färben, die üblicherweise zur Untersuchung hämatologischer Kompartimente durch Durchflusszytometrie verwendet werden. Dieser Ansatz ist insbesondere bei der Überwachung des Ansprechens des Patienten auf die Behandlung sowie beim Nachweis einer minimalen Resterkrankung nützlich. Da wir außerdem zytoplasmatische KCTDs in Kombination mit Oberflächenantigenen nachweisen konnten, planten wir, die KCTDs-Expressionsniveaus in mehreren Zellpopulationen zu beschreiben, die sich im Knochenmark und im peripheren Blut befinden. Zweitens werden die in dieser Studie erhaltenen Gesamtdaten auch mit Blick auf den Patienten interpretiert Kliniken unter besonderer Berücksichtigung des Ansprechens auf die Therapie, des Rückfallrisikos und, wenn möglich, der Therapieresistenz.
25-36 Monate

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Sponsor

IRCCS SYNLAB SDN

Mitarbeiter

Santobono-Pausilipon Hospital

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

2. März 2020

Primärer Abschluss (Tatsächlich)

1. Februar 2024

Studienabschluss (Geschätzt)

31. Juli 2025

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

27. Januar 2023

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

6. Februar 2023

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

15. Februar 2023

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

25. März 2024

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

22. März 2024

Zuletzt verifiziert

1. Februar 2024

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen

Andere Studien-ID-Nummern

  • 5/19

Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)

Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?

NEIN

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Nein

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

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