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Desvendando o papel da família de proteínas KCTD no manejo clínico de leucemias linfoblásticas agudas infantis

22 de março de 2024 atualizado por: IRCCS SYNLAB SDN
Uma análise transcriptômica da medula óssea de pacientes B-ALL foi realizada por nosso grupo de pesquisa para identificar uma nova proteína/fator com um papel putativo de biomarcador da doença. Juntamente com alguns biomarcadores B-ALL já conhecidos, nossa análise destacou a desregulação de alguns membros de uma classe de proteína emergente denominada KCTD (Potassium Channel Tetramerization Domain-containing protein). Partindo de nossas observações preliminares, e considerando que KCTDs nunca foram estudados em ALL, decidimos estudar essas proteínas em pacientes pediátricos afetados por B e T-ALL, inscritos por nosso grupo de pesquisa em colaboração com o hospital oncológico pediátrico AORN Santobono-Pausilipon. , o presente programa de pesquisa visa abrir um novo cenário para o estudo das proteínas KCTD em leucemias infantis. O objetivo final do projeto será avaliar a relevância translacional de KCTDs desregulados selecionados como novos biomarcadores úteis para diagnósticos de B-ALL e T-ALL e gerenciamento de pacientes.

Visão geral do estudo

Status

Recrutamento

Condições

Intervenção / Tratamento

Tipo de estudo

Observacional

Inscrição (Estimado)

80

Contactos e Locais

Esta seção fornece os detalhes de contato para aqueles que conduzem o estudo e informações sobre onde este estudo está sendo realizado.

Contato de estudo

Locais de estudo

Critérios de participação

Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.

Critérios de elegibilidade

Idades elegíveis para estudo

1 ano a 18 anos (Filho, Adulto)

Aceita Voluntários Saudáveis

Sim

Método de amostragem

Amostra Não Probabilística

População do estudo

O estudo prevê a possibilidade de recrutar aproximadamente 60 pacientes com B-ALL e 15-20 pacientes com T-ALL. Além disso, serão recrutados indivíduos controle com idade e sexo comparáveis ​​aos dos pacientes. Por fim, serão utilizadas cerca de 100 unidades de sangue do cordão umbilical que não cumprem os critérios de criopreservação terapêutica e para as quais foi dado consentimento para a sua utilização para investigação científica

Descrição

Critério de inclusão:

  • Pacientes de 1 a 18 anos de ambos os sexos com diagnóstico de B-ALL e T-ALL;
  • Pacientes que terão assinado o consentimento informado

Critério de exclusão:

  • Pacientes que se recusarem a participar do estudo;
  • Pacientes que não se enquadram na faixa etária mencionada acima

Plano de estudo

Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.

Como o estudo é projetado?

Detalhes do projeto

Coortes e Intervenções

Grupo / Coorte
Intervenção / Tratamento
Pacientes pediátricos com leucemia linfoblástica aguda
pacientes pediátricos de 1 a 16 anos afetados por leucemia linfoblástica aguda
Outro: estudo de observação
análise de biomarcadores de interesse (DNA-RNA e proteínas) em MNC purificadas do sangue dos sujeitos
indivíduos saudáveis
sangue do cordão umbilical de dadores saudáveis ​​que não pode ser utilizado para fins clínicos
Outro: estudo de observação
análise de biomarcadores de interesse (DNA-RNA e proteínas) em MNC purificadas do sangue dos sujeitos

O que o estudo está medindo?

Medidas de resultados primários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Níveis de expressão de KCTD, por abordagem de RNAseq, em uma coorte de pacientes afetados por LLA de células B e T em comparação com controles não afetados
Prazo: 1-12 meses
Inscrevemos durante este projeto cerca de 15-20 pacientes B-ALL e 3-6 pacientes T-ALL. Experimentos de RNAseq para análise de transcriptoma serão realizados em uma coorte de estudo de pelo menos 8 pacientes B-ALL, 3-4 pacientes T-ALL , e células B ou T virgens purificadas a partir do sangue do cordão como controlo para B- e T-ALL correspondentemente. Contagens brutas serão usadas e uma abordagem Bayes empírica aplicada (DESeq2, pacote R). Os resultados incluirão, para cada gene, alteração log-fold (log2), média de base, p-valor e p-valores ajustados (Benjamimi-Hochberg). A saída do DEgenes será exportada para um formato adequado para IPA Ingenuity Path AnalysisSoftware (Qiagen), para anotações de genes, análise funcional e previsão de biomarcadores. As proteínas KCTD que serão desreguladas em B-ALL e T-ALL serão estudadas detalhadamente.
1-12 meses
Validação por RT-PCR de KCTDs desregulados e identificação de possíveis interatores de KCTDs em leucemia por abordagem proteômica funcional
Prazo: 13-24 meses
Após a interpretação dos dados do transcriptoma serão realizados experimentos específicos de validação por reat-time pcr, westernblotting, citometria de fluxo e microscopia. Resumidamente, o RNA total será purificado de cerca de 5e6 MNC totais e usado para experimentos de RT-PCR; O esfregaço de MO será coletado para análise de imunofluorescência de KCTDs desregulados; o extrato proteico total será obtido de pelo menos 1 e 6 MNC totais e armazenado a -80°C até Western Blotting; finalmente, células mononucleares vivas serão tratadas para permeabilização e imunocoloração citoplasmática dos KCTDs de interesse. Todos os experimentos serão estabelecidos em sistemas de modelos humanos in vitro B- e T-ALL e, em seguida, realizados em células de pacientes e controles. Além disso, a fim de identificar possíveis interatores de proteínas KCTDs, usaremos linhagens de células B-ALL e T-ALL para análises proteômicas funcionais.
13-24 meses
Correlação dos dados clínicos dos pacientes B-ALL com o nível de expressão de KCTDs
Prazo: 25-36 meses
Primeiramente, avaliaremos a utilidade das proteínas KCTD desreguladas como novos marcadores de leucemia a serem testados por citometria de fluxo clínica multiparamétrica. Um protocolo específico já foi estabelecido por nossa equipe de pesquisa e é capaz de corar antígenos citoplasmáticos (como proteínas KCTD) com antígenos de superfície comumente usados ​​para estudar compartimentos hematológicos por citometria de fluxo. Essa abordagem será útil especialmente no monitoramento da resposta do paciente ao tratamento, bem como na detecção de doença residual mínima. Além disso, sendo capaz de detectar KCTDs citoplasmáticos em combinação com antígenos de superfície, planejamos descrever os níveis de expressão de KCTDs em múltiplas populações celulares residentes na medula e no sangue periférico. Em segundo lugar, os dados gerais obtidos neste estudo também serão interpretados olhando para o paciente clínicas com referência particular à resposta à terapia, ao risco de recaída e, quando possível, à resistência à terapia.
25-36 meses

Colaboradores e Investigadores

É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.

Patrocinador

IRCCS SYNLAB SDN

Colaboradores

Santobono-Pausilipon Hospital

Datas de registro do estudo

Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados ​​pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.

Datas Principais do Estudo

Início do estudo (Real)

2 de março de 2020

Conclusão Primária (Real)

1 de fevereiro de 2024

Conclusão do estudo (Estimado)

31 de julho de 2025

Datas de inscrição no estudo

Enviado pela primeira vez

27 de janeiro de 2023

Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ

6 de fevereiro de 2023

Primeira postagem (Real)

15 de fevereiro de 2023

Atualizações de registro de estudo

Última Atualização Postada (Real)

25 de março de 2024

Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade

22 de março de 2024

Última verificação

1 de fevereiro de 2024

Mais Informações

Termos relacionados a este estudo

Termos MeSH relevantes adicionais

Outros números de identificação do estudo

  • 5/19

Plano para dados de participantes individuais (IPD)

Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?

NÃO

Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo

Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Essas informações foram obtidas diretamente do site clinicaltrials.gov sem nenhuma alteração. Se você tiver alguma solicitação para alterar, remover ou atualizar os detalhes do seu estudo, entre em contato com register@clinicaltrials.gov. Assim que uma alteração for implementada em clinicaltrials.gov, ela também será atualizada automaticamente em nosso site .

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