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Découvrir le rôle de la famille de protéines KCTD dans la prise en charge clinique des leucémies lymphoblastiques aiguës de l'enfant

22 mars 2024 mis à jour par: IRCCS SYNLAB SDN
Une analyse transcriptomique de la moelle osseuse de patients atteints de LAL-B a été réalisée par notre groupe de recherche pour identifier une nouvelle protéine/facteur ayant un rôle putatif de biomarqueur de la maladie. En plus de certains biomarqueurs B-ALL déjà connus, notre analyse a mis en évidence la dérégulation de certains membres d'une classe de protéines émergentes appelée KCTD (Potassium ChannelTetramerization Domain-contenant des protéines). Partant de nos observations préliminaires, et considérant que les KCTD n'ont jamais été étudiés dans la LAL, nous avons décidé d'étudier ces protéines chez des patients pédiatriques atteints de LAL-B et T, recrutés par notre groupe de recherche en collaboration avec l'hôpital oncologique pédiatrique AORN Santobono-Pausilipon. , le présent programme de recherche vise à ouvrir un nouveau scénario pour l'étude des protéines KCTD dans les leucémies infantiles. L'objectif final du projet sera d'évaluer la pertinence translationnelle de certains KCTD dérégulés en tant que nouveaux biomarqueurs utiles pour le diagnostic de la LAL-B et de la LAL-T, et la prise en charge des patients.

Aperçu de l'étude

Statut

Recrutement

Les conditions

Intervention / Traitement

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Estimé)

80

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

Lieux d'étude

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

1 an à 18 ans (Enfant, Adulte)

Accepte les volontaires sains

Oui

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

L'étude prévoit la possibilité de recruter environ 60 patients atteints de LAL-B et 15 à 20 patients atteints de LAL-T. De plus, des sujets témoins d'âge et de sexe comparables à ceux des patients seront recrutés. Enfin, une centaine d'unités de sang de cordon ne répondant pas aux critères de cryoconservation thérapeutique et pour lesquelles un consentement a été donné pour leur utilisation à des fins de recherche scientifique seront utilisées

La description

Critère d'intégration:

  • Patients âgés de 1 à 18 ans des deux sexes ayant reçu un diagnostic de LAL-B et de LAL-T ;
  • Patients qui auront signé le consentement éclairé

Critère d'exclusion:

  • Les patients qui refusent de participer à l'étude ;
  • Patients n'appartenant pas à la tranche d'âge mentionnée ci-dessus

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Intervention / Traitement
Patients pédiatriques atteints de leucémie aiguë lymphoblastique
patients pédiatriques de 1 à 16 ans atteints de leucémie aiguë lymphoblastique
Autre: étude observationnelle
analyse de biomarqueurs d'intérêt (ADN-ARN et protéines) dans les MNC purifiées à partir du sang des sujets
sujets sains
sang de cordon ombilical provenant de donneurs sains qui ne peut être utilisé à des fins cliniques
Autre: étude observationnelle
analyse de biomarqueurs d'intérêt (ADN-ARN et protéines) dans les MNC purifiées à partir du sang des sujets

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Niveaux d'expression de KCTD, par approche RNAseq, dans une cohorte de patients atteints de LAL à cellules B et T par rapport à des témoins non affectés
Délai: 1-12 mois
Nous recrutons au cours de ce projet environ 15 à 20 patients B-ALL et 3 à 6 patients T-ALL. , et des lymphocytes B ou T naïfs purifiés à partir de sang de cordon comme contrôle pour B- et T-ALL en conséquence. Des comptages bruts seront utilisés et une approche empirique bayésienne appliquée (DESeq2, package R). Les résultats incluront, pour chaque gène, le changement logarithmique (log2), la moyenne de base, la valeur p et les valeurs p ajustées (Benjamimi-Hochberg). La sortie de DEgenes sera exportée dans un format adapté au logiciel d'analyse de la voie IPA Ingenuity (Qiagen), pour les annotations de gènes, l'analyse fonctionnelle et la prédiction de biomarqueurs. Les protéines KCTD qui seront dérégulées dans B-ALL et T-ALL seront étudiées en détail.
1-12 mois
Validation RT-PCR des KCTD dérégulés et identification d'interacteurs possibles des KCTD dans la leucémie par approche protéomique fonctionnelle
Délai: 13-24 mois
Après l'interprétation des données du transcriptome, nous réaliserons des expériences de validation spécifiques par PCR en temps réel, westernblot, cytométrie en flux et microscopie. En bref, l'ARN total sera purifié à partir d'environ 5e6 MNC totales et utilisé pour des expériences de RT-PCR ; Le frottis de BM sera collecté pour l'analyse par immunofluorescence des KCTD dérégulés ; l'extrait total de protéines sera obtenu à partir d'au moins 1 à 6 MNC totales et conservé à -80 °C jusqu'au Western Blot ; enfin, des cellules mononucléaires vivantes seront traitées pour la perméabilisation et l'immunocoloration cytoplasmique des KCTD d'intérêt. Toutes les expériences seront installées sur des systèmes de modèles humains in vitro B- et T-ALL, puis réalisées sur des patients et des cellules témoins. De plus, afin d'identifier d'éventuels interacteurs des protéines KCTDs, nous utiliserons des lignées cellulaires B-ALL et T-ALL pour l'analyse protéomique fonctionnelle.
13-24 mois
Corrélation des données cliniques des patients B-ALL avec le niveau d'expression des KCTD
Délai: 25-36 mois
Dans un premier temps, nous évaluerons l'utilité des protéines KCTD dérégulées comme nouveaux marqueurs de la leucémie à tester par cytométrie en flux clinique multiparamétrique. Un protocole spécifique a déjà été mis en place par notre équipe de recherche, et il est capable de colorer des antigènes cytoplasmiques (comme les protéines KCTD) avec des antigènes de surface couramment utilisés pour étudier les compartiments hématologiques par cytométrie en flux. Cette approche sera utile en particulier pour surveiller la réponse du patient au traitement ainsi que la détection d'une maladie résiduelle minimale. De plus, étant capable de détecter les KCTD cytoplasmiques en combinaison avec des antigènes de surface, nous avons prévu de décrire les niveaux d'expression des KCTD dans plusieurs populations cellulaires résidant dans la moelle et le sang périphérique. Deuxièmement, les données globales obtenues dans cette étude seront également interprétées en regardant le patient. cliniques avec une référence particulière à la réponse au traitement, au risque de rechute et, si possible, à la résistance au traitement.
25-36 mois

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

IRCCS SYNLAB SDN

Collaborateurs

Santobono-Pausilipon Hospital

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

2 mars 2020

Achèvement primaire (Réel)

1 février 2024

Achèvement de l'étude (Estimé)

31 juillet 2025

Dates d'inscription aux études

Première soumission

27 janvier 2023

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

6 février 2023

Première publication (Réel)

15 février 2023

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

25 mars 2024

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

22 mars 2024

Dernière vérification

1 février 2024

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

  • 5/19

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

NON

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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