小児急性リンパ芽球性白血病の臨床管理における KCTD タンパク質ファミリーの役割の解明
2024年3月22日 更新者：IRCCS SYNLAB SDN
B-ALL 患者の骨髄のトランスクリプトーム解析は、疾患バイオマーカーの推定上の役割を持つ新規タンパク質/因子を特定するために、私たちの研究グループによって行われました。
いくつかの既知の B-ALL バイオマーカーに加えて、私たちの分析では、KCTD (カリウム チャネル四量体化ドメイン含有タンパク質) として示される新たなタンパク質クラスのいくつかのメンバーの規制緩和が強調されました。
私たちの予備的観察から始めて、KCTDがALLで研究されたことがないことを考慮して、私たちは、AORN Santobono-Pausilipon小児腫瘍病院と協力して私たちの研究グループが登録したBおよびT-ALLに罹患した小児患者でこれらのタンパク質を研究することに決めました.Indeed 、現在の研究プログラムは、小児白血病におけるKCTDタンパク質の研究のための新しいシナリオを開くことを目的としています.
このプロジェクトの最終目標は、B-ALL および T-ALL の診断と患者管理に有用な新規バイオマーカーとして、選択された規制緩和された KCTD の翻訳関連性を評価することです。
調査の概要
研究の種類
観察的
入学 (推定)
80
連絡先と場所
このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。
研究連絡先
- 名前：Laura Pierri, MSC
- 電話番号：0812408470
- メール：direzionescientifica.irccssdn@synlab.it
研究場所
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Naples、イタリア、80143
- 募集
- Irccs Synlab Sdn
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コンタクト：
- Laura Pierri, MSC
- 電話番号：0812408470
- メール：direzionescientifica.irccssdn@synlab.it
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参加基準
研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。
適格基準
就学可能な年齢
1年～18年 (子、大人)
健康ボランティアの受け入れ
はい
サンプリング方法
非確率サンプル
調査対象母集団
この研究では、約 60 人の B-ALL 患者と 15 ～ 20 人の T-ALL 患者を募集する可能性が予測されています。
さらに、年齢と性別が患者と同等の対照被験者が募集されます。
最後に、科学的研究のための使用が許可された、治療用凍結保存の基準を満たさない約100ユニットの臍帯血が使用されます。
説明
包含基準:
- B-ALLおよびT-ALLと診断された男女1～18歳の患者。
- -インフォームドコンセントに署名した患者
除外基準:
- -研究への参加を拒否する患者;
- 上記の年齢に該当しない方
研究計画
このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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小児急性リンパ芽球性白血病患者
急性リンパ芽球性白血病に罹患した1〜16歳の小児患者
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被験者の血液から精製された MNC における対象のバイオマーカー (DNA-RNA およびタンパク質) の分析
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健常者
臨床目的に使用できない健康なドナーからの臍帯血
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被験者の血液から精製された MNC における対象のバイオマーカー (DNA-RNA およびタンパク質) の分析
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この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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影響を受けていないコントロールと比較した B および T 細胞 ALL 影響を受けた患者のコホートにおける、RNAseq アプローチによる KCTD 発現レベル
時間枠：1～12ヶ月
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このプロジェクトでは、約 15 ～ 20 人の B-ALL 患者と 3 ～ 6 人の T-ALL 患者が登録されます。 、および対応する B-ALL および T-ALL のコントロールとして臍帯血から精製されたナイーブ B または T 細胞。
raw カウントが使用され、経験的なベイズ アプローチが適用されます (DESeq2、R パッケージ)。
結果には、各遺伝子の対数倍変化 (log2)、基本平均、p 値、調整済み p 値 (Benjamimi-Hochberg) が含まれます。 DEgenes 出力は、IPA Ingenuity パスウェイ AnalysisSoftware (Qiagen)、遺伝子注釈、機能分析、およびバイオマーカー予測に適した形式にエクスポートされます。
B-ALLおよびT-ALLで規制緩和されるKCTDタンパク質が詳細に研究されます。
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1～12ヶ月
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制御解除された KCTD の RT-PCR 検証と、機能的プロテオミクス アプローチによる白血病における KCTD 相互作用因子の同定
時間枠：13～24ヶ月
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トランスクリプトーム データの解釈後、リアルタイム PCR、ウェスタンブロッティング、フローサイトメトリー、顕微鏡検査による特定の検証実験を行います。
簡単に言えば、約 5e6 の全 MNC から全 RNA を精製し、RT-PCR 実験に使用します。 BM塗抹標本は、規制緩和されたKCTDの免疫蛍光分析のために収集されます。タンパク質総抽出物は、少なくとも 1 e 6 総 MNC から得られ、ウェスタンブロッティングまで -80°C で保存されます。最後に、生きた単核細胞を対象の KCTD の透過処理および細胞質免疫染色のために処理します。
すべての実験は、インビトロヒトモデル系でB-およびT-ALLで解決され、その後、患者および対照細胞で実施されます。
さらに、KCTDs タンパク質の可能なインタラクターを特定するために、機能プロテオミクス解析に B-ALL および T-ALL 細胞株を使用します。
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13～24ヶ月
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B-ALL患者の臨床データとKCTD発現レベルとの相関
時間枠：25～36ヶ月
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まず、マルチパラメトリック臨床フローサイトメトリーによってテストされる白血病の新規マーカーとして、規制緩和された KCTD タンパク質の有用性を評価します。
特定のプロトコルは、当社の研究チームによって既に設定されており、フローサイトメトリーによる血液コンパートメントの研究に一般的に使用される表面抗原で細胞質抗原 (KCTD タンパク質など) を染色することができます。
このアプローチは、治療に対する患者の反応のモニタリングや、微小残存病変の検出に特に役立ちます。
さらに、表面抗原と組み合わせて細胞質 KCTD を検出できるため、骨髄および末梢血に存在する複数の細胞集団における KCTD 発現レベルを記述することを計画しました。治療への反応、再発のリスク、および可能であれば治療への抵抗性を特に参照して診療所を訪問します。
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25～36ヶ月
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協力者と研究者
ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。
研究記録日
これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。
主要日程の研究
研究開始 (実際)
2020年3月2日
一次修了 (実際)
2024年2月1日
研究の完了 (推定)
2025年7月31日
試験登録日
最初に提出
2023年1月27日
QC基準を満たした最初の提出物
2023年2月6日
最初の投稿 (実際)
2023年2月15日
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
2024年3月25日
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
2024年3月22日
最終確認日
2024年2月1日
詳しくは
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。
観察研究の臨床試験
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Radicle Science積極的、募集していない
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Digisight Technologies, Inc.わからない
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Fonds de la Recherche en Santé du QuébecUniversité de Montréal完了