Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Het ontrafelen van de rol van de KCTD-eiwitfamilie in de klinische behandeling van acute lymfoblastische leukemieën bij kinderen

22 maart 2024 bijgewerkt door: IRCCS SYNLAB SDN
Een transcriptomische analyse van beenmerg van B-ALL-patiënten werd uitgevoerd door onze onderzoeksgroep voor het identificeren van een nieuw eiwit/factor met een vermoedelijke rol van ziektebiomarker. Samen met enkele reeds bekende B-ALL-biomarkers, benadrukte onze analyse de deregulering van sommige leden van een opkomende eiwitklasse die wordt aangeduid als KCTD (Potassium Channel Tetramerization Domain-containing-eiwitten). Uitgaande van onze voorlopige observaties, en gezien het feit dat KCTD's nog nooit in ALL zijn bestudeerd, hebben we besloten om deze eiwitten te bestuderen bij pediatrische patiënten met B- en T-ALL, ingeschreven door onze onderzoeksgroep in samenwerking met het AORN Santobono-Pausilipon pediatrisch oncologisch ziekenhuis. , heeft het huidige onderzoeksprogramma tot doel een nieuw scenario te openen voor de studie van KCTD-eiwitten bij leukemieën bij kinderen. Het uiteindelijke doel van het project is het evalueren van de translationele relevantie van geselecteerde gedereguleerde KCTD's als nieuwe biomarkers die bruikbaar zijn voor B-ALL- en T-ALL-diagnostiek en patiëntenbeheer.

Studie Overzicht

Toestand

Werving

Conditie

Interventie / Behandeling

Studietype

Observationeel

Inschrijving (Geschat)

80

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studiecontact

Studie Locaties

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

1 jaar tot 18 jaar (Kind, Volwassen)

Accepteert gezonde vrijwilligers

Ja

Bemonsteringsmethode

Niet-waarschijnlijkheidssteekproef

Studie Bevolking

De studie voorziet in de mogelijkheid om ongeveer 60 patiënten met B-ALL en 15-20 patiënten met T-ALL te werven. Bovendien zullen controlepersonen worden gerekruteerd met een leeftijd en geslacht die vergelijkbaar zijn met die van de patiënten. Ten slotte zullen ongeveer 100 eenheden navelstrengbloed worden gebruikt die niet voldoen aan de criteria voor therapeutische cryopreservatie en waarvoor toestemming is gegeven voor gebruik voor wetenschappelijk onderzoek

Beschrijving

Inclusiecriteria:

  • Patiënten van 1-18 jaar van beide geslachten met de diagnose B-ALL en T-ALL;
  • Patiënten die de geïnformeerde toestemming hebben ondertekend

Uitsluitingscriteria:

  • Patiënten die weigeren deel te nemen aan het onderzoek;
  • Patiënten die niet binnen de bovengenoemde leeftijdscategorie vallen

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

Cohorten en interventies

Groep / Cohort
Interventie / Behandeling
Pediatrische patiënten met acute lymfatische leukemie
pediatrische patiënten van 1-16 jaar met acute lymfatische leukemie
Ander: observatie studie
analyse van biomarkers van belang (DNA-RNA en eiwitten) in MNC gezuiverd uit het bloed van de proefpersonen
gezonde onderwerpen
navelstrengbloed van gezonde donoren dat niet voor klinische doeleinden kan worden gebruikt
Ander: observatie studie
analyse van biomarkers van belang (DNA-RNA en eiwitten) in MNC gezuiverd uit het bloed van de proefpersonen

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
KCTD-expressieniveaus, volgens RNAseq-benadering, in een cohort van B- en T-cel-ALL-patiënten in vergelijking met niet-aangetaste controles
Tijdsspanne: 1-12 maanden
We schrijven tijdens dit project ongeveer 15-20 B-ALL- en 3-6 T-ALL-patiënten in. RNAseq-experimenten voor transcriptoomanalyse zullen worden uitgevoerd op een studiecohort van ten minste 8 B-ALL-patiënten, 3-4 T-ALL-patiënten en naïeve B- of T-cellen gezuiverd uit navelstrengbloed als controle voor B- en T-ALL dienovereenkomstig. Er zullen ruwe tellingen worden gebruikt en een empirische Bayes-benadering zal worden toegepast (DESeq2, R-pakket). De resultaten omvatten, voor elk gen, log-fold verandering (log2), basisgemiddelde, p-waarde en aangepaste p-waarden (Benjamimi-Hochberg). De output van DEgenes zal worden geëxporteerd naar een formaat dat geschikt is voor IPA Ingenuity Pathway Analysis Software (Qiagen), voor genannotaties, functionele analyse en voorspelling van biomarkers. De KCTD-eiwitten die gedereguleerd zullen worden in B-ALL en T-ALL zullen in detail bestudeerd worden.
1-12 maanden
RT-PCR-validatie van gedereguleerde KCTD's en identificatie van mogelijke KCTD-interactors bij leukemie door functionele proteomische benadering
Tijdsspanne: 13-24 maanden
Na de interpretatie van transcriptoomgegevens zullen we specifieke validatie-experimenten uitvoeren door middel van reat-time pcr, westernblotting, flowcytometrie en microscopie. Kortom, totaal RNA zal worden gezuiverd uit ongeveer 5e6 totaal MNC en worden gebruikt voor RT-PCR-experimenten; BM-uitstrijkjes zullen worden verzameld voor immunofluorescentieanalyse van gedereguleerde KCTD's; eiwit totaal extract zal worden verkregen uit ten minste 1 e 6 totaal MNC en bewaard bij -80°C tot Western blotting; ten slotte zullen levende mononucleaire cellen worden behandeld voor permeabilisatie en cytoplasmatische immunokleuring van de KCTD's van belang. Alle experimenten zullen worden opgezet op B- en T-ALL in vitro menselijke modelsystemen en vervolgens worden uitgevoerd op patiënten en controlecellen. Bovendien zullen we, om mogelijke interactoren van KCTD-eiwitten te identificeren, B-ALL- en T-ALL-cellijnen gebruiken voor functionele proteomics-analyse.
13-24 maanden
Correlatie van klinische gegevens van B-ALL-patiënten met KCTD-expressieniveau
Tijdsspanne: 25-36 maanden
Ten eerste zullen we het nut evalueren van de gedereguleerde KCTD-eiwitten als nieuwe markers van leukemie die getest zullen worden door middel van multiparametrische klinische flowcytometrie. Ons onderzoeksteam heeft al een specifiek protocol opgesteld en het is in staat om cytoplasma-antigenen (zoals KCTD-eiwitten) te kleuren met oppervlakte-antigenen die gewoonlijk worden gebruikt voor het bestuderen van hematoogische compartimenten door middel van flowcytometrie. Deze benadering zal vooral nuttig zijn bij het bewaken van de reactie van de patiënt op de behandeling en bij het opsporen van minimale restziekte. Omdat we cytoplasmatische KCTD's in combinatie met oppervlakte-antigenen konden detecteren, waren we bovendien van plan om de KCTD-expressieniveaus te beschrijven in meerdere cellulaire populaties die zich in merg en perifeer bloed bevinden. Ten tweede zullen de algemene gegevens die in deze studie zijn verkregen ook worden geïnterpreteerd door naar de patiënt te kijken klinieken met bijzondere aandacht voor de respons op therapie, het risico op terugval en, indien mogelijk, weerstand tegen therapie.
25-36 maanden

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Sponsor

IRCCS SYNLAB SDN

Medewerkers

Santobono-Pausilipon Hospital

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Werkelijk)

2 maart 2020

Primaire voltooiing (Werkelijk)

1 februari 2024

Studie voltooiing (Geschat)

31 juli 2025

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

27 januari 2023

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

6 februari 2023

Eerst geplaatst (Werkelijk)

15 februari 2023

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Werkelijk)

25 maart 2024

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

22 maart 2024

Laatst geverifieerd

1 februari 2024

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden

Andere studie-ID-nummers

  • 5/19

Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)

Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?

NEE

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Abonneren