Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Odhalení role proteinové rodiny KCTD v klinické léčbě akutních lymfoblastických leukémií v dětství

22. března 2024 aktualizováno: IRCCS SYNLAB SDN
Naše výzkumná skupina provedla transkriptomickou analýzu kostní dřeně pacientů s B-ALL za účelem identifikace nového proteinu/faktoru s domnělou rolí biomarkeru onemocnění. Spolu s některými již známými biomarkery B-ALL naše analýza zdůraznila deregulaci některých členů vznikající třídy proteinů označovaných jako KCTD (proteiny obsahující tetramerizační doménu draslíkového kanálu). Počínaje našimi předběžnými pozorováními as ohledem na to, že KCTD nebyly nikdy studovány u ALL, jsme se rozhodli studovat tyto proteiny u pediatrických pacientů postižených B- a T-ALL, do kterých se zapsala naše výzkumná skupina ve spolupráci s dětskou onkologickou nemocnicí AORN Santobono-Pausilipon. Cílem tohoto výzkumného programu je otevřít nový scénář pro studium KCTD proteinů u dětských leukémií. Konečným cílem projektu bude vyhodnotit translační relevanci vybraných deregulovaných KCTD jako nových biomarkerů užitečných pro diagnostiku B-ALL a T-ALL a management pacientů.

Přehled studie

Postavení

Nábor

Podmínky

Intervence / Léčba

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Odhadovaný)

80

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní kontakt

Studijní místa

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

1 rok až 18 let (Dítě, Dospělý)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ano

Metoda odběru vzorků

Vzorek nepravděpodobnosti

Studijní populace

Studie předpokládá možnost náboru přibližně 60 pacientů s B-ALL a 15-20 pacientů s T-ALL. Dále budou vybráni kontrolní subjekty s věkem a pohlavím srovnatelným s pacienty. Nakonec bude použito asi 100 jednotek pupečníkové krve, které nesplňují kritéria pro terapeutickou kryokonzervaci a pro které byl udělen souhlas s jejich použitím pro vědecký výzkum.

Popis

Kritéria pro zařazení:

  • Pacienti ve věku 1-18 let obou pohlaví s diagnózou B-ALL a T-ALL;
  • Pacienti, kteří podepíší informovaný souhlas

Kritéria vyloučení:

  • Pacienti, kteří se odmítnou zúčastnit studie;
  • Pacienti, kteří nespadají do výše uvedeného věkového rozmezí

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

Kohorty a intervence

Skupina / kohorta
Intervence / Léčba
Pediatričtí pacienti s akutní lymfoblastickou leukémií
pediatričtí pacienti ve věku 1-16 let postižení akutní lymfoblastickou leukémií
Jiný: observační studie
analýza biomarkerů zájmu (DNA-RNA a proteiny) v MNC purifikovaných z krve subjektů
zdravé subjekty
pupečníkovou krev od zdravých dárců, kterou nelze použít pro klinické účely
Jiný: observační studie
analýza biomarkerů zájmu (DNA-RNA a proteiny) v MNC purifikovaných z krve subjektů

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Hladiny exprese KCTD, přístupem RNAseq, u kohorty pacientů postižených ALL B a T buněk ve srovnání s nepostiženými kontrolami
Časové okno: 1-12 měsíců
Během tohoto projektu zařazujeme přibližně 15-20 pacientů s B-ALL a 3-6 pacientů s T-ALL. Experimenty RNAseq pro analýzu transkriptomu budou provedeny na studijní kohortě alespoň 8 pacientů s B-ALL, 3-4 pacientů s T-ALL a naivní B nebo T buňky purifikované z pupečníkové krve jako kontrola pro B- a T-ALL odpovídajícím způsobem. Budou použity hrubé počty a aplikován empirický Bayesův přístup (DESeq2, R balíček). Výsledky budou pro každý gen zahrnovat log-násobek změny (log2), základní průměr, p-hodnotu a upravené p-hodnoty (Benjamimi-Hochberg). Výstup DEgenes bude exportován do formátu vhodného pro IPA Ingenuity pathway AnalysisSoftware (Qiagen), pro genové anotace, funkční analýzu a predikci biomarkerů. Podrobně budou studovány KCTD proteiny, které budou deregulovány u B-ALL a T-ALL.
1-12 měsíců
RT-PCR validace deregulovaných KCTD a identifikace možných interaktorů KCTD u leukémie funkčním proteomickým přístupem
Časové okno: 13-24 měsíců
Po interpretaci transkriptomových dat provedeme specifické validační experimenty pomocí reat-time pcr, westernblottingu, průtokové cytometrie a mikroskopie. Stručně, celková RNA bude purifikována z přibližně 5e6 celkových MNC a použita pro experimenty RT-PCR; BM nátěr bude odebrán pro imunofluorescenční analýzu deregulovaných KCTD; celkový proteinový extrakt bude získán z alespoň 1 e 6 celkových MNC a skladován při -80 °C až do Western blotting; nakonec budou živé mononukleární buňky ošetřeny pro permeabilizaci a cytoplazmatické imunobarvení zájmových KCTD. Všechny experimenty budou založeny na B- a T-ALL in vitro lidských modelových systémech a poté provedeny na pacientech a kontrolních buňkách. Navíc, abychom identifikovali možné interaktory KCTD proteinů, použijeme buněčné linie B-ALL a T-ALL pro funkční proteomickou analýzu.
13-24 měsíců
Korelace klinických dat pacientů s B-ALL s úrovní exprese KCTD
Časové okno: 25-36 měsíců
Nejprve vyhodnotíme užitečnost deregulovaných KCTD proteinů jako nových markerů leukémie, které budou testovány multiparametrickou klinickou průtokovou cytometrií. Náš výzkumný tým již vytvořil specifický protokol, který je schopen barvit cytoplazmatické antigeny (jako jsou proteiny KCTD) povrchovými antigeny běžně používanými pro studium hematoologických kompartmentů pomocí průtokové cytometrie. Tento přístup bude užitečný zejména při monitorování odpovědi pacienta na léčbu a také při detekci minimální reziduální choroby. Kromě toho, protože jsme schopni detekovat cytoplazmatické KCTD v kombinaci s povrchovými antigeny, plánovali jsme popsat hladiny exprese KCTD ve vícenásobné buněčné populaci sídlící v kostní dřeni a periferní krvi. Za druhé, celková data získaná v této studii budou také interpretována s ohledem na pacienta kliniky se zvláštním ohledem na odpověď na léčbu, riziko relapsu a, je-li to možné, rezistenci na léčbu.
25-36 měsíců

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Sponzor

IRCCS SYNLAB SDN

Spolupracovníci

Santobono-Pausilipon Hospital

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

2. března 2020

Primární dokončení (Aktuální)

1. února 2024

Dokončení studie (Odhadovaný)

31. července 2025

Termíny zápisu do studia

První předloženo

27. ledna 2023

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

6. února 2023

První zveřejněno (Aktuální)

15. února 2023

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

25. března 2024

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

22. března 2024

Naposledy ověřeno

1. února 2024

Více informací

Termíny související s touto studií

Další relevantní podmínky MeSH

Další identifikační čísla studie

  • 5/19

Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)

Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?

NE

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na observační studie

Prohledejte podobné pokusy

Sponzoři a spolupracovníci

Zdravotní podmínky

Drogové intervence

CROs by country

CROs in Slovenia

Podmínky

Vzácné nemoci

Drogové intervence

Doplňky stravy

Sponzor / Spolupracovníci

Místa

Předplatit