Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Att reda ut rollen för KCTD-proteinfamiljen i den kliniska hanteringen av akut lymfoblastisk leukemi i barndomen

22 mars 2024 uppdaterad av: IRCCS SYNLAB SDN
En transkriptomisk analys av benmärg från B-ALL-patienter utfördes av vår forskargrupp för att identifiera nytt protein/faktor med en förmodad roll som sjukdomsbiomarkör. Tillsammans med några redan kända B-ALL-biomarkörer framhävde vår analys avreglering av vissa medlemmar av en framväxande proteinklass betecknad som KCTD (Potassium ChannelTetramerization Domain-containing proteins). Med utgångspunkt från våra preliminära observationer och med tanke på att KCTD aldrig har studerats i ALL, bestämde vi oss för att studera dessa proteiner i B- och T-ALL-påverkade pediatriska patienter, inskrivna av vår forskargrupp i samarbete med AORN Santobono-Pausilipon pediatriskt onkologiskt sjukhus. , det nuvarande forskningsprogrammet syftar till att öppna ett nytt scenario för studien av KCTD-proteiner i barnleukemier. Det slutliga målet med projektet kommer att vara att utvärdera den translationella relevansen av utvalda avreglerade KCTDs som nya biomarkörer användbara för B-ALL- och T-ALL-diagnostik och patienthantering.

Studieöversikt

Status

Rekrytering

Betingelser

Intervention / Behandling

Studietyp

Observationell

Inskrivning (Beräknad)

80

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studiekontakt

Studieorter

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

1 år till 18 år (Barn, Vuxen)

Tar emot friska volontärer

Ja

Testmetod

Icke-sannolikhetsprov

Studera befolkning

Studien förutser möjligheten att rekrytera cirka 60 patienter med B-ALL och 15-20 patienter med T-ALL. Vidare kommer kontrollpersoner med ålder och kön jämförbara med patienterna att rekryteras. Slutligen kommer cirka 100 enheter navelsträngsblod som inte uppfyller kriterierna för terapeutisk kryokonservering och för vilka samtycke lämnats för användning för vetenskaplig forskning att användas.

Beskrivning

Inklusionskriterier:

  • Patienter i åldern 1-18 år av båda könen diagnostiserade med B-ALL och T-ALL;
  • Patienter som kommer att ha undertecknat det informerade samtycket

Exklusions kriterier:

  • Patienter som vägrar att delta i studien;
  • Patienter som inte faller inom ovan nämnda åldersintervall

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

Kohorter och interventioner

Grupp / Kohort
Intervention / Behandling
Pediatriska patienter med akut lymfatisk leukemi
pediatriska patienter i åldern 1-16 år drabbade av akut lymfatisk leukemi
Övrig: observationsstudie
analys av biomarkörer av intresse (DNA-RNA och proteiner) i MNC renat från försökspersonernas blod
friska försökspersoner
navelsträngsblod från friska donatorer som inte kan användas för kliniska ändamål
Övrig: observationsstudie
analys av biomarkörer av intresse (DNA-RNA och proteiner) i MNC renat från försökspersonernas blod

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
KCTD-expressionsnivåer, genom RNAseq-metoden, i en kohort av B- och T-celler påverkade ALLA patienter jämfört med opåverkade kontroller
Tidsram: 1-12 månader
Vi registrerar under detta projekt cirka 15-20 B-ALL- och 3-6 T-ALL-patienter. RNAseq-experiment för transkriptomanalys kommer att utföras på en studiekohort av minst 8 B-ALL-patienter, 3-4 T-ALL-patienter och naiva B- eller T-celler renade från navelsträngsblod som kontroll för B- och T-ALL på motsvarande sätt. Råvärden kommer att användas och en empirisk Bayes-metod tillämpas (DESeq2, R-paket). Resultaten kommer för varje gen att inkludera log-faldig förändring (log2), basmedelvärde, p-värde och justerade p-värden (Benjamimi-Hochberg). DEgenes output kommer att exporteras till ett format som är lämpligt för IPA Ingenuity pathway AnalysisSoftware (Qiagen), för genkommentarer, funktionsanalys och biomarkörsprediktion. KCTD-proteinerna som kommer att avregleras i B-ALL och T-ALL kommer att studeras i detalj.
1-12 månader
RT-PCR-validering av avreglerade KCTDs och identifiering av möjliga KCTD-interaktörer i leukemi genom funktionell proteomisk metod
Tidsram: 13-24 månader
Efter tolkningen av transkriptomdata kommer vi att utföra specifika valideringsexperiment genom reat-time pcr, westernblotting, flödescytometri och mikroskopi. Kortfattat kommer totalt RNA att renas från cirka 5e6 totalt MNC och användas för RT-PCR-experiment; BM-utstryk kommer att samlas in för immunfluorescensanalys av avreglerade KCTDs; protein totalt extrakt kommer att erhållas från minst 1 e 6 total MNC och lagras vid -80°C tills Western Blotting; slutligen kommer levande mononukleära celler att behandlas för permeabilisering och cytoplasmatisk immunfärgning av KCTDs av intresse. Alla experiment kommer att avgöras på B- och T-ALL in vitro humana modellsystem och sedan utföras på patienter och kontrollceller. Dessutom, för att identifiera möjliga interaktörer av KCTDs proteiner kommer vi att använda B-ALL och T-ALL cellinjer för funktionell proteomikanalys.
13-24 månader
Korrelation av B-ALL-patienter kliniska data med KCTDs uttrycksnivå
Tidsram: 25-36 månader
För det första kommer vi att utvärdera användbarheten av de avreglerade KCTD-proteinerna som nya markörer för leukemi som ska testas med multiparametrisk klinisk flödescytometri. Ett specifikt protokoll har redan satts upp av vårt forskarteam, och det kan färga cytoplasmiska antigener (som KCTD-proteiner) med ytantigener som vanligtvis används för att studera hematoogiska fack med flödescytometri. Detta tillvägagångssätt kommer att vara användbart särskilt för att övervaka patientens svar på behandling såväl som detektion av minimal kvarvarande sjukdom. Dessutom, eftersom vi kunde detektera cytoplasmatiska KCTDs i kombination med ytantigener, planerade vi att beskriva KCTDs uttrycksnivåer i multipla cellulära populationer som bor i märg och perifert blod. För det andra kommer de övergripande data som erhålls i denna studie också att tolkas när vi tittar på patienten kliniker med särskild hänvisning till svaret på terapin, risken för återfall och, när det är möjligt, resistens mot terapi.
25-36 månader

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Sponsor

IRCCS SYNLAB SDN

Samarbetspartners

Santobono-Pausilipon Hospital

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Faktisk)

2 mars 2020

Primärt slutförande (Faktisk)

1 februari 2024

Avslutad studie (Beräknad)

31 juli 2025

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

27 januari 2023

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

6 februari 2023

Första postat (Faktisk)

15 februari 2023

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)

25 mars 2024

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

22 mars 2024

Senast verifierad

1 februari 2024

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Ytterligare relevanta MeSH-villkor

Andra studie-ID-nummer

  • 5/19

Plan för individuella deltagardata (IPD)

Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?

NEJ

Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument

Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt

Nej

Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt

Nej

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Prenumerera