Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Раскрытие роли семейства белков KCTD в клиническом ведении острых лимфобластных лейкозов у ​​детей

22 марта 2024 г. обновлено: IRCCS SYNLAB SDN
Наша исследовательская группа провела транскриптомный анализ костного мозга пациентов с B-ALL для выявления нового белка/фактора с предполагаемой ролью биомаркера заболевания. Наряду с некоторыми уже известными биомаркерами B-ALL, наш анализ выявил нарушение регуляции некоторых членов нового класса белков, обозначенных как KCTD (белки, содержащие домен тетрамеризации калиевых каналов). Исходя из наших предварительных наблюдений и учитывая, что KCTD никогда не изучались при ОЛЛ, мы решили изучить эти белки у педиатрических пациентов с B- и T-ОЛЛ, включенных нашей исследовательской группой в сотрудничестве с детской онкологической больницей AORN Santobono-Pausilipon. Действительно. Настоящая исследовательская программа направлена ​​на открытие нового сценария изучения белков KCTD при лейкозах у детей. Конечной целью проекта будет оценка трансляционной значимости выбранных дерегулируемых KCTD в качестве новых биомаркеров, полезных для диагностики B-ALL и T-ALL и ведения пациентов.

Обзор исследования

Статус

Рекрутинг

Условия

Вмешательство/лечение

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Оцененный)

80

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Контакты исследования

Места учебы

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

От 1 год до 18 лет (Ребенок, Взрослый)

Принимает здоровых добровольцев

Да

Метод выборки

Невероятностная выборка

Исследуемая популяция

Исследование предусматривает возможность набора примерно 60 пациентов с В-ОЛЛ и 15-20 пациентов с Т-ОЛЛ. Кроме того, будут набраны контрольные субъекты с возрастом и полом, сравнимыми с пациентами. Наконец, будет использовано около 100 единиц пуповинной крови, не соответствующих критериям терапевтической криоконсервации и в отношении которых дано согласие на их использование для научных исследований.

Описание

Критерии включения:

  • Пациенты в возрасте 1-18 лет обоего пола с диагнозами В-ОЛЛ и Т-ОЛЛ;
  • Пациенты, которые подпишут информированное согласие

Критерий исключения:

  • Пациенты, отказывающиеся от участия в исследовании;
  • Пациенты, которые не попадают в возрастной диапазон, указанный выше

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

Когорты и вмешательства

Группа / когорта
Вмешательство/лечение
Больные острым лимфобластным лейкозом у детей
педиатрические пациенты в возрасте 1-16 лет, страдающие острым лимфобластным лейкозом
Другой: обсервационное исследование
анализ представляющих интерес биомаркеров (ДНК-РНК и белков) в МНК, выделенных из крови субъектов
здоровые субъекты
пуповинная кровь здоровых доноров, которая не может быть использована в клинических целях
Другой: обсервационное исследование
анализ представляющих интерес биомаркеров (ДНК-РНК и белков) в МНК, выделенных из крови субъектов

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Уровни экспрессии KCTD, согласно подходу RNAseq, в когорте пациентов с В- и Т-клетками, пораженными ALL, по сравнению с незатронутыми контролями
Временное ограничение: 1-12 месяцев
В рамках этого проекта мы набираем около 15-20 пациентов с В-ОЛЛ и 3-6 пациентов с Т-ОЛЛ. Эксперименты с РНК-секвенциями для анализа транскриптома будут проводиться на группе, состоящей не менее чем из 8 пациентов с В-ОЛЛ, 3-4 пациентов с Т-ОЛЛ. и наивные В- или Т-клетки, выделенные из пуповинной крови, в качестве контроля для В- и Т-ОЛЛ соответственно. Будут использоваться необработанные подсчеты и применяться эмпирический байесовский подход (DESeq2, пакет R). Результаты будут включать для каждого гена логарифмическое изменение (log2), базовое среднее, p-значение и скорректированные p-значения (Бенджамими-Хохберг). Выходные данные DEgenes будут экспортированы в формат, подходящий для IPA Ingenuity path AnalysisSoftware (Qiagen), для аннотаций генов, функционального анализа и прогнозирования биомаркеров. Белки KCTD, которые будут нарушены при B-ALL и T-ALL, будут подробно изучены.
1-12 месяцев
Проверка RT-PCR дерегулированных KCTD и идентификация возможных взаимодействующих KCTD при лейкемии с помощью функционального протеомного подхода
Временное ограничение: 13-24 месяца
После интерпретации данных транскриптома мы проведем специальные проверочные эксперименты с помощью ПЦР в реальном времени, вестерн-блоттинга, проточной цитометрии и микроскопии. Вкратце, общая РНК будет очищена примерно от 5e6 общих MNC и использована для экспериментов RT-PCR; Мазок костного мозга будет собран для иммунофлуоресцентного анализа дерегулированных KCTD; Экстракт общего белка получают, по крайней мере, из 1 e 6 общих MNC и хранят при -80°C до вестерн-блоттинга; наконец, живые мононуклеарные клетки будут обработаны для пермеабилизации и цитоплазматического иммунного окрашивания интересующих KCTD. Все эксперименты будут проведены на модельных системах B- и T-ALL человека in vitro, а затем проведены на клетках пациентов и контролей. Кроме того, для выявления возможных взаимодействующих белков KCTDs мы будем использовать клеточные линии B-ALL и T-ALL для анализа функциональной протеомики.
13-24 месяца
Корреляция клинических данных пациентов с B-ALL с уровнем экспрессии KCTD
Временное ограничение: 25-36 месяцев
Во-первых, мы оценим полезность дерегулированных белков KCTD в качестве новых маркеров лейкемии, которые будут проверены с помощью многопараметрической клинической проточной цитометрии. Наша исследовательская группа уже разработала специальный протокол, который позволяет окрашивать цитоплазматические антигены (такие как белки KCTD) поверхностными антигенами, обычно используемыми для изучения гематологических компартментов с помощью проточной цитометрии. Этот подход будет особенно полезен при мониторинге реакции пациента на лечение, а также при выявлении минимальной остаточной болезни. Более того, имея возможность выявлять цитоплазматические KCTD в сочетании с поверхностными антигенами, мы планировали описать уровни экспрессии KCTDs в множественной клеточной популяции, находящейся в костном мозге и периферической крови. Во-вторых, общие данные, полученные в этом исследовании, также будут интерпретироваться с точки зрения пациента клиниках с особым вниманием к ответу на терапию, риску рецидива и, по возможности, резистентности к терапии.
25-36 месяцев

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Спонсор

IRCCS SYNLAB SDN

Соавторы

Santobono-Pausilipon Hospital

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (Действительный)

2 марта 2020 г.

Первичное завершение (Действительный)

1 февраля 2024 г.

Завершение исследования (Оцененный)

31 июля 2025 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

27 января 2023 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

6 февраля 2023 г.

Первый опубликованный (Действительный)

15 февраля 2023 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (Действительный)

25 марта 2024 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

22 марта 2024 г.

Последняя проверка

1 февраля 2024 г.

Дополнительная информация

Термины, связанные с этим исследованием

Дополнительные соответствующие термины MeSH

Другие идентификационные номера исследования

  • 5/19

Планирование данных отдельных участников (IPD)

Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?

НЕТ

Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы

Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.

Нет

Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.

Нет

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Подписаться