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三阴性乳腺癌检查点抑制剂反应的预测生物标志物：多组学平台 (PORTRAIT)

2023年6月20日 更新者：Vall d'Hebron Institute of Oncology

早期三阴性乳腺癌化疗和免疫检查点抑制剂反应的预测生物标志物的鉴定：综合多组学平台

接受新辅助化疗 (NACT) +/- 免疫检查点抑制剂 (ICI) 的 II-III 期三阴性乳腺癌 (TNBC) 候选患者将包括在内。 来自不同组织的几个样本将通过不同的组学进行分析，以建立治疗反应的预测生物标志物。 然后将使用多种算法来寻找包含多参数输入的综合预测算法，以开发临床工具来协助临床医生制定 TNBC 的治疗决策。

研究概览

地位

招聘中

条件

干预/治疗

详细说明

免疫检查点抑制剂 (ICI) 派姆单抗 (pembrolizumab) 与新辅助化疗 (NACT) 的组合可提高早期三阴性乳腺癌 (eTNBC) 患者的病理完全缓解 (pCR) 和无事件生存期 (EFS)。 然而，并非所有患者都能同样受益于可能产生相关不良事件 (AE) 的治疗。

目标：(1) 通过将不同组织中进行的不同组学层的数据与影像学、pCR、EFS 和总生存期 (OS) 相关联，建立 eTNBC 中 NACT + ICI 反应的预测生物标志物。 (2) 整合 (1) 生成的数据和临床数据，并探索 NACT + ICI 反应的多变量预测模型。

方法：将纳入接受 NACT +/- ICI 的 II-III 期 TNBC 候选患者。 收集的样本和分析类型：（1）肿瘤组织（基线和NACT后残留疾病）：将进行全基因组测序（WGS）和RNA-Seq（Hartwig测序平台和分析管道），组织免疫表型分析（PD- L1、T 和 B 浸润淋巴细胞等）和微生物组分析（16S rRNA）； (2) 血液（NACT 之前和期间）：循环肿瘤 DNA (ctDNA) 分析（靶向基因组和浅层 WGS）、T 细胞受体 β (TCR-β) 全谱测序和分析（ImmunoSeq hsTCRβ 试剂盒和immunoSEQ），以及外周血单核细胞 (PBMC) 表型分析； (3) 粪便和唾液（NACT之前和期间）：微生物组分析（16S rRNA）； (4)乳腺MRI成像(NACT之前和之后)：放射组学分析。 然后，将使用多种算法，包括多核学习、多组学因子分析 (MOFA) 和时空组学数据功能集成方法 (MEFISTO)，来寻找包含多参数输入的综合预测算法。 目的是提供更加个性化的治疗效果和复发风险估计。

预期成果：开发一种临床工具，协助临床医生制定 eTNBC 的治疗决策，最大限度地提高患者的利益和生活质量，同时最大限度地减少不良事件和卫生系统的经济负担。

研究类型

观察性的

注册 (估计的)

100

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息，以及有关进行该研究的地点的信息。

学习地点

  • 西班牙
      • Barcelona、西班牙、08035
        • 招聘中
        • Vall d'Hebron Institute of Oncology
        • 接触：

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人，称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

  • 成人
  • 年长者

接受健康志愿者

不

取样方法

非概率样本

研究人群

将包括接受 NACT +/- ICI 的 II-III 期 TNBC 候选患者

描述

纳入标准：

  • 组织学记录的 TNBC（人表皮生长因子受体 2 [HER2]、雌激素受体 [ER] 和孕激素受体 [PgR] 状态阴性）
  • 美国癌症联合委员会 (AJCC) 乳腺癌分期标准第 8 版定义的 2 - 3 期，由研究者根据放射学和/或临床评估进行评估
  • 经研究者评估，患者是接受 NACT（有或没有 ICI）的候选者
  • 患者同意参加本试验时年龄≥ 18 岁

排除标准：

  • 影像学显示转移性疾病（第 4 期）

学习计划

本节提供研究计划的详细信息，包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的？

设计细节

队列和干预

团体/队列
干预/治疗
A组
帕博利珠单抗+新辅助化疗
诊断测试：全基因组测序
将从基线和新辅助化疗（NACT）后残留疾病（如果存在）的肿瘤组织中进行全基因组测序（WGS）。
其他名称：
  • 工作组
诊断测试：RNA测序
将从基线和 NACT 后残留疾病（如果存在）开始对肿瘤组织进行 RNA 测序。
诊断测试：微生物组分析
如果临床需要辅助全身治疗，将在辅助全身治疗之前、NACT 期间和结束时对粪便和唾液进行微生物组分析。
诊断测试：ctDNA分析
NACT 之前和期间将在血浆中进行 ctDNA 分析。
诊断测试：TCR-β 库测序
TCR-β 谱库测序将在 NACT 之前和期间在血浆中进行。
诊断测试：PBMC表型分析
PBMC 表型分析将在 NACT 之前和期间在血浆中进行。
药品：派姆单抗
Pembrolizumab 将与标准 NACT 联合给药。
药品：化疗
将给出标准 NACT。
其他名称：
  • 卡铂、紫杉烷、蒽环类、环磷酰胺
B组
新辅助化疗
诊断测试：全基因组测序
将从基线和新辅助化疗（NACT）后残留疾病（如果存在）的肿瘤组织中进行全基因组测序（WGS）。
其他名称：
  • 工作组
诊断测试：RNA测序
将从基线和 NACT 后残留疾病（如果存在）开始对肿瘤组织进行 RNA 测序。
诊断测试：微生物组分析
如果临床需要辅助全身治疗，将在辅助全身治疗之前、NACT 期间和结束时对粪便和唾液进行微生物组分析。
诊断测试：ctDNA分析
NACT 之前和期间将在血浆中进行 ctDNA 分析。
诊断测试：TCR-β 库测序
TCR-β 谱库测序将在 NACT 之前和期间在血浆中进行。
诊断测试：PBMC表型分析
PBMC 表型分析将在 NACT 之前和期间在血浆中进行。
药品：化疗
将给出标准 NACT。
其他名称：
  • 卡铂、紫杉烷、蒽环类、环磷酰胺

研究衡量的是什么？

主要结果指标

结果测量
措施说明
大体时间
根治性手术的病理完全缓解 (pCR) 率
大体时间：新辅助治疗和手术后，最长约 27-30 周
使用美国癌症联合委员会 (AJCC) 的 ypT0/Tis ypN0 定义（即乳房或淋巴结无侵入性残留；允许非侵入性乳房残留）进行根治性手术时达到 pCR 的患者比率（以百分比形式给出）分期标准
新辅助治疗和手术后，最长约 27-30 周
无事件生存（EFS）
大体时间：最长约 60 个月
EFS 定义为从新辅助治疗开始到发生以下任何事件的时间：无法进行手术的疾病进展、局部或远处复发、第二原发恶性肿瘤（乳腺癌或其他癌症）或因任何原因导致的死亡
最长约 60 个月
总生存期（OS）
大体时间：最长约 60 个月
OS 定义为从开始新辅助治疗到因任何原因死亡的时间
最长约 60 个月
识别生物标志物以预测临床结果（根治性手术的 pCR、EFS、OS）。
大体时间：分析所有数据后，长达约 60 个月

临床数据（根治性手术的 pCR、EFS、OS）将与多组学平台的结果相整合，并探索新辅助化疗 (NACT) + 免疫检查点抑制剂 (ICI) 反应的多变量预测模型。 准确地说，多组学平台将分析：

  1. 初始肿瘤和残留疾病（如果存在）的 RNA 测序
  2. 唾液和粪便的微生物组分析，
  3. 循环肿瘤 DNA (ctDNA) 分析（靶向基因组和浅层 WGS），
  4. 组织免疫表型分析，
  5. 使用ImmunoSeq hsTCRβ试剂盒和immunoSEQ对T细胞受体β（TCR-β）库进行测序和分析，
  6. 乳房 MRI 成像（NACT 之前和之后），

然后，将使用多种算法，包括多核学习、多组学因子分析 (MOFA) 和时空组学数据功能集成方法 (MEFISTO)，来寻找包含多参数输入的综合预测算法。
分析所有数据后，长达约 60 个月

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

赞助

Vall d'Hebron Institute of Oncology

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查，以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始 (实际的)

2023年1月13日

初级完成 (估计的)

2026年12月1日

研究完成 (估计的)

2029年12月1日

研究注册日期

首次提交

2023年5月8日

首先提交符合 QC 标准的

2023年6月20日

首次发布 (实际的)

2023年6月23日

研究记录更新

最后更新发布 (实际的)

2023年6月23日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2023年6月20日

最后验证

2023年6月1日

更多信息

与本研究相关的术语

关键字

其他相关的 MeSH 术语

其他研究编号

  • PR(AG)165-2021

计划个人参与者数据 (IPD)

计划共享个人参与者数据 (IPD)？

未定

药物和器械信息、研究文件

研究美国 FDA 监管的药品

是的

研究美国 FDA 监管的设备产品

不

在美国制造并从美国出口的产品

不

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