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Prädiktive Biomarker für die Reaktion auf Checkpoint-Inhibitoren bei dreifach negativem Brustkrebs: eine Multiomics-Plattform (PORTRAIT)

20. Juni 2023 aktualisiert von: Vall d'Hebron Institute of Oncology

Identifizierung prädiktiver Biomarker für das Ansprechen auf Chemotherapie und Immun-Checkpoint-Inhibitoren bei frühem dreifach negativem Brustkrebs: eine integrative Multiomics-Plattform

Patienten mit dreifach negativem Brustkrebs im Stadium II-III (TNBC), die Kandidaten für eine neoadjuvante Chemotherapie (NACT) +/- Immun-Checkpoint-Inhibitor (ICI) sind, werden eingeschlossen. Mehrere Proben aus verschiedenen Geweben werden durch unterschiedliche Omics analysiert, um prädiktive Biomarker für das Ansprechen auf die Behandlung zu ermitteln. Anschließend werden mehrere Algorithmen verwendet, um nach einem integrativen Vorhersagealgorithmus zu suchen, der Multiparameter-Eingaben berücksichtigt, um ein klinisches Tool zu entwickeln, das Kliniker bei der Behandlungsentscheidung bei TNBC unterstützt.

Studienübersicht

Detaillierte Beschreibung

Die Kombination von Pembrolizumab, einem Immun-Checkpoint-Inhibitor (ICI), mit neoadjuvanter Chemotherapie (NACT) erhöht das pathologische Komplettansprechen (pCR) und das ereignisfreie Überleben (EFS) bei Patienten mit frühem dreifach negativem Brustkrebs (eTNBC). Allerdings profitieren nicht alle Patienten gleichermaßen von einer Behandlung, die möglicherweise relevante unerwünschte Ereignisse (UE) mit sich bringt.

Ziele: (1) Etablierung prädiktiver Biomarker für die Reaktion auf NACT + ICI bei eTNBC durch Korrelation von Daten aus verschiedenen Schichten von Omics, die in verschiedenen Geweben durchgeführt wurden, zusammen mit Bildgebung, mit pCR, EFS und Gesamtüberleben (OS). (2) Integration der aus (1) generierten Daten und klinischen Daten und Erforschung multivariater Vorhersagemodelle für die Reaktion auf NACT + ICI.

Methoden: Patienten mit TNBC-Kandidaten im Stadium II-III, die NACT +/- ICI erhalten möchten, werden eingeschlossen. Gesammelte Proben und Art der Analyse: (1) Tumorgewebe (Basislinie und aus der Resterkrankung nach NACT): Es werden Gesamtgenomsequenzierung (WGS) und RNA-Seq durchgeführt (Hartwig-Sequenzierungsplattform und analytische Pipeline), Gewebeimmunphänotypisierung (PD- L1-, T- und B-infiltrierende Lymphozyten (unter anderem) und Mikrobiomanalyse (16S-rRNA); (2) Blut (vor und während NACT): Analyse der zirkulierenden Tumor-DNA (ctDNA) (gezieltes Genpanel und flaches WGS), Sequenzierung und Analyse des Repertoires des T-Zell-Rezeptors Beta (TCR-β) (ImmunoSeq hsTCRβ-Kit und immunoSEQ) und Phänotypisierung peripherer mononukleärer Blutzellen (PBMCs); (3) Stuhl und Speichel (vor und während NACT): Mikrobiomanalyse (16S rRNA); (4) Brust-MRT-Bildgebung (vor und nach NACT): Radiomics-Analyse. Mehrere Algorithmen, darunter Multiple Kernel Learning, Multi-Omics Factor Analysis (MOFA) und Method for the Functional Integration of Spatial and Temporal Omics data (MEFISTO), werden dann verwendet, um nach einem integrativen Vorhersagealgorithmus zu suchen, der Multiparameter-Eingaben berücksichtigt. Ziel ist es, eine stärker personalisierte Behandlungswirksamkeit und Risikoschätzung für Rückfälle zu ermöglichen.

Erwartetes Ergebnis: Entwicklung eines klinischen Tools zur Unterstützung von Ärzten im Prozess der Behandlungsentscheidung bei eTNBC, um den Nutzen und die Lebensqualität des Patienten zu maximieren und gleichzeitig Nebenwirkungen und finanzielle Belastungen für das Gesundheitssystem zu minimieren.

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Geschätzt)

100

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienorte

      • Barcelona, Spanien, 08035
        • Rekrutierung
        • Vall d'Hebron Institute of Oncology
        • Kontakt:

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

  • Erwachsene
  • Älterer Erwachsener

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Probenahmeverfahren

Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

Studienpopulation

Patienten mit TNBC-Kandidaten im Stadium II-III, die NACT +/- ICI erhalten möchten, werden eingeschlossen

Beschreibung

Einschlusskriterien:

  • Histologisch dokumentierter TNBC (negativer Status des humanen epidermalen Wachstumsfaktorrezeptors 2 [HER2], des Östrogenrezeptors [ER] und des Progesteronrezeptors [PgR])
  • Stadium 2–3, definiert durch die Einstufungskriterien des American Joint Committee of Cancer (AJCC), 8. Ausgabe, für Brustkrebs, wie vom Prüfer auf der Grundlage einer radiologischen und/oder klinischen Beurteilung beurteilt
  • Der Patient ist ein Kandidat für eine NACT mit oder ohne ICI, wie vom Prüfer beurteilt
  • Der Patient ist zum Zeitpunkt der Einwilligung zur Teilnahme an dieser Studie ≥ 18 Jahre alt

Ausschlusskriterien:

  • Metastasierende Erkrankung in der Bildgebung (Stadium 4)

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

Kohorten und Interventionen

Gruppe / Kohorte
Intervention / Behandlung
Kohorte A
Pembrolizumab + neoadjuvante Chemotherapie
Die Sequenzierung des gesamten Genoms (WGS) wird im Tumorgewebe vom Ausgangswert und von der Resterkrankung nach neoadjuvanter Chemotherapie (NACT), sofern vorhanden, durchgeführt.
Andere Namen:
  • WGS
Die RNA-Sequenzierung wird im Tumorgewebe vom Ausgangswert und von der Resterkrankung nach NACT (falls vorhanden) durchgeführt.
Eine Mikrobiomanalyse wird in Stuhl und Speichel vor, während der NACT und am Ende der adjuvanten systemischen Therapie durchgeführt, wenn eine adjuvante systemische Therapie klinisch indiziert ist.
Die ctDNA-Analyse wird vor und während der NACT im Plasma durchgeführt.
Die Sequenzierung des TCR-β-Repertoires wird vor und während der NACT im Plasma durchgeführt.
Die PBMC-Phänotypisierung wird vor und während der NACT im Plasma durchgeführt.
Pembrolizumab wird in Kombination mit Standard-NACT verabreicht.
Es wird Standard-NACT angegeben.
Andere Namen:
  • Carboplatin, Taxan, Anthracyclin, Cyclophosphamid
Kohorte B
Neoadjuvante Chemotherapie
Die Sequenzierung des gesamten Genoms (WGS) wird im Tumorgewebe vom Ausgangswert und von der Resterkrankung nach neoadjuvanter Chemotherapie (NACT), sofern vorhanden, durchgeführt.
Andere Namen:
  • WGS
Die RNA-Sequenzierung wird im Tumorgewebe vom Ausgangswert und von der Resterkrankung nach NACT (falls vorhanden) durchgeführt.
Eine Mikrobiomanalyse wird in Stuhl und Speichel vor, während der NACT und am Ende der adjuvanten systemischen Therapie durchgeführt, wenn eine adjuvante systemische Therapie klinisch indiziert ist.
Die ctDNA-Analyse wird vor und während der NACT im Plasma durchgeführt.
Die Sequenzierung des TCR-β-Repertoires wird vor und während der NACT im Plasma durchgeführt.
Die PBMC-Phänotypisierung wird vor und während der NACT im Plasma durchgeführt.
Es wird Standard-NACT angegeben.
Andere Namen:
  • Carboplatin, Taxan, Anthracyclin, Cyclophosphamid

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Rate des pathologischen Komplettansprechens (pCR) bei der endgültigen Operation
Zeitfenster: nach neoadjuvanter Behandlung und Operation bis zu etwa 27–30 Wochen
Die Rate (angegeben als Prozentsatz) von Patienten mit einem pCR bei der endgültigen Operation unter Verwendung der Definition von ypT0/Tis ypN0 (d. h. keine invasiven Reste in Brust oder Knoten; nichtinvasive Brustreste zulässig) des American Joint Committee on Cancer (AJCC) Inszenierungskriterien
nach neoadjuvanter Behandlung und Operation bis zu etwa 27–30 Wochen
Ereignisfreies Überleben (EFS)
Zeitfenster: Bis ca. 60 Monate
EFS ist definiert als die Zeit vom Beginn der neoadjuvanten Behandlung bis zu einem der folgenden Ereignisse: Fortschreiten der Krankheit, das eine Operation ausschließt, lokales oder Fernrezidiv, zweites primäres Malignom (Brustkrebs oder andere Krebsarten) oder Tod aus jeglicher Ursache
Bis ca. 60 Monate
Gesamtüberleben (OS)
Zeitfenster: Bis ca. 60 Monate
OS ist definiert als die Zeit vom Beginn der neoadjuvanten Behandlung bis zum Tod aus irgendeinem Grund
Bis ca. 60 Monate
Identifizierung von Biomarkern zur Vorhersage klinischer Ergebnisse (pCR bei endgültiger Operation, EFS, OS).
Zeitfenster: Nachdem alle Daten analysiert wurden, dauert es bis zu etwa 60 Monate

Die klinischen Daten (pCR bei definitiver Operation, EFS, OS) werden mit den Ergebnissen der Multiomics-Plattform integriert und multivariate prädiktive Modelle der Reaktion auf neoadjuvante Chemotherapie (NACT) + Immun-Checkpoint-Inhibitor (ICI) werden untersucht. Genauer gesagt wird die Multiomics-Plattform Folgendes analysieren:

  1. RNA-Sequenzierung des ursprünglichen Tumors und der Resterkrankung (falls vorhanden)
  2. Mikrobiomanalyse von Speichel und Kot,
  3. Analyse der zirkulierenden Tumor-DNA (ctDNA) (gezieltes Gen-Panel und flache WGS),
  4. Gewebeimmunphänotypisierung,
  5. Sequenzierung und Analyse des T-Zellrezeptor-Beta-Repertoires (TCR-β) mit dem ImmunoSeq hsTCRβ-Kit und immunoSEQ,
  6. Brust-MRT-Bildgebung (vor und nach NACT),

Mehrere Algorithmen, darunter Multiple Kernel Learning, Multi-Omics Factor Analysis (MOFA) und Method for the Functional Integration of Spatial and Temporal Omics data (MEFISTO), werden dann verwendet, um nach einem integrativen Vorhersagealgorithmus zu suchen, der Multiparameter-Eingaben berücksichtigt.

Nachdem alle Daten analysiert wurden, dauert es bis zu etwa 60 Monate

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

13. Januar 2023

Primärer Abschluss (Geschätzt)

1. Dezember 2026

Studienabschluss (Geschätzt)

1. Dezember 2029

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

8. Mai 2023

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

20. Juni 2023

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

23. Juni 2023

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

23. Juni 2023

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

20. Juni 2023

Zuletzt verifiziert

1. Juni 2023

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

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UNENTSCHIEDEN

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Ja

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

Produkt, das in den USA hergestellt und aus den USA exportiert wird

Nein

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

Klinische Studien zur Sequenzierung des gesamten Genoms

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