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Biomarcatori predittivi di risposta agli inibitori del checkpoint nel carcinoma mammario triplo negativo: una piattaforma multiomica (PORTRAIT)

20 giugno 2023 aggiornato da: Vall d'Hebron Institute of Oncology

Identificazione di biomarcatori predittivi di risposta alla chemioterapia e inibitori del checkpoint immunitario nel carcinoma mammario triplo negativo in fase iniziale: una piattaforma multiomica integrativa

Saranno incluse le pazienti con carcinoma mammario triplo negativo (TNBC) in stadio II-III candidate a ricevere chemioterapia neoadiuvante (NACT) +/- inibitore del checkpoint immunitario (ICI). Diversi campioni provenienti da diversi tessuti saranno analizzati attraverso diverse omiche per stabilire biomarcatori predittivi di risposta al trattamento. Verranno quindi utilizzati più algoritmi per cercare un algoritmo predittivo integrativo che incorpori input multiparametrici al fine di sviluppare uno strumento clinico per assistere i medici nel processo decisionale del trattamento nel TNBC.

Panoramica dello studio

Descrizione dettagliata

La combinazione di pembrolizumab, un inibitore del checkpoint immunitario (ICI), con la chemioterapia neoadiuvante (NACT) aumenta la risposta patologica completa (pCR) e la sopravvivenza libera da eventi (EFS) nelle pazienti con carcinoma mammario triplo negativo in fase iniziale (eTNBC). Tuttavia, non tutti i pazienti beneficiano ugualmente di un trattamento che può avere eventi avversi rilevanti (AE).

Obiettivi: (1) Stabilire biomarcatori predittivi di risposta a NACT + ICI in eTNBC correlando i dati provenienti da diversi strati di omiche eseguite in diversi tessuti, insieme all'imaging, con pCR, EFS e sopravvivenza globale (OS). (2) Integrare i dati generati da (1) ei dati clinici ed esplorare modelli predittivi multivariati di risposta a NACT + ICI.

Metodi: Saranno inclusi i pazienti con TNBC in stadio II-III candidati a ricevere NACT +/- ICI. Campioni raccolti e tipo di analisi: (1) Tessuto tumorale (basale e dalla malattia residua dopo NACT): verrà eseguito il sequenziamento dell'intero genoma (WGS) e RNA-Seq (piattaforma di sequenziamento Hartwig e pipeline analitica), fenotipizzazione immunitaria del tessuto (PD- linfociti infiltranti L1, T e B, tra gli altri) e analisi del microbioma (16S rRNA); (2) Sangue (prima e durante la NACT): analisi del DNA tumorale circolante (ctDNA) (pannello genico mirato e WGS superficiale), sequenziamento e analisi del repertorio del recettore delle cellule T beta (TCR-β) (kit ImmunoSeq hsTCRβ e immunoSEQ) e fenotipizzazione delle cellule mononucleate del sangue periferico (PBMC); (3) Feci e saliva (prima e durante la NACT): analisi del microbioma (16S rRNA); (4) Imaging RM mammario (prima e dopo NACT): analisi radiomica. Algoritmi multipli tra cui Multiple Kernel Learning, Multi-Omics Factor Analysis (MOFA) e Method for the Functional Integration of Spatial and Temporal Omics data (MEFISTO) verranno quindi utilizzati per cercare un algoritmo predittivo integrativo che incorpori input multiparametrici. L'obiettivo è quello di fornire un'efficacia del trattamento più personalizzata e il rischio di stime di ricaduta.

Risultato atteso: sviluppare uno strumento clinico per assistere i medici nel processo decisionale del trattamento in eTNBC, al fine di massimizzare i benefici e la qualità della vita del paziente, riducendo al minimo gli eventi avversi e l'onere finanziario per il sistema sanitario.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Stimato)

100

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Luoghi di studio

      • Barcelona, Spagna, 08035
        • Reclutamento
        • Vall d'Hebron Institute of Oncology
        • Contatto:

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

  • Adulto
  • Adulto più anziano

Accetta volontari sani

No

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

Saranno inclusi i pazienti con TNBC in stadio II-III candidati a ricevere NACT +/- ICI

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • TNBC documentato istologicamente (recettore del fattore di crescita epidermico umano negativo 2 [HER2], recettore degli estrogeni [ER] e recettore del progesterone [PgR])
  • Stadio 2 - 3 definito dall'8a edizione dei criteri di stadiazione dell'American Joint Committee of Cancer (AJCC) per il carcinoma mammario come valutato dallo sperimentatore sulla base di una valutazione radiologica e/o clinica
  • Il paziente è un candidato a ricevere NACT con o senza ICI come valutato dallo sperimentatore
  • Il paziente ha ≥ 18 anni al momento del consenso a partecipare a questo studio

Criteri di esclusione:

  • Malattia metastatica all'imaging (fase 4)

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
Coorte A
Pembrolizumab + chemioterapia neoadiuvante
Il sequenziamento dell'intero genoma (WGS) verrà eseguito nel tessuto tumorale dal basale e dalla malattia residua dopo chemioterapia neoadiuvante (NACT), se presente.
Altri nomi:
  • WGS
Il sequenziamento dell'RNA verrà eseguito nel tessuto tumorale dal basale e dalla malattia residua dopo NACT (se presente).
L'analisi del microbioma verrà eseguita nelle feci e nella saliva prima, durante NACT e alla fine della terapia sistemica adiuvante se la terapia sistemica adiuvante è clinicamente indicata.
L'analisi del ctDNA sarà eseguita nel plasma prima e durante la NACT.
Il sequenziamento del repertorio TCR-β sarà eseguito nel plasma prima e durante la NACT.
La fenotipizzazione delle PBMC sarà eseguita nel plasma prima e durante la NACT.
Pembrolizumab verrà somministrato in combinazione con NACT standard.
Verrà fornito il NACT standard.
Altri nomi:
  • Carboplatino, taxano, antraciclina, ciclofosfamide
Coorte B
Chemioterapia neoadiuvante
Il sequenziamento dell'intero genoma (WGS) verrà eseguito nel tessuto tumorale dal basale e dalla malattia residua dopo chemioterapia neoadiuvante (NACT), se presente.
Altri nomi:
  • WGS
Il sequenziamento dell'RNA verrà eseguito nel tessuto tumorale dal basale e dalla malattia residua dopo NACT (se presente).
L'analisi del microbioma verrà eseguita nelle feci e nella saliva prima, durante NACT e alla fine della terapia sistemica adiuvante se la terapia sistemica adiuvante è clinicamente indicata.
L'analisi del ctDNA sarà eseguita nel plasma prima e durante la NACT.
Il sequenziamento del repertorio TCR-β sarà eseguito nel plasma prima e durante la NACT.
La fenotipizzazione delle PBMC sarà eseguita nel plasma prima e durante la NACT.
Verrà fornito il NACT standard.
Altri nomi:
  • Carboplatino, taxano, antraciclina, ciclofosfamide

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Tasso di risposta patologica completa (pCR) alla chirurgia definitiva
Lasso di tempo: dopo trattamento neoadiuvante e intervento chirurgico, fino a circa 27-30 settimane
La percentuale (espressa in percentuale) di pazienti con una pCR durante l'intervento chirurgico definitivo utilizzando la definizione di ypT0/Tis ypN0 (ovvero, nessun residuo invasivo nella mammella o nei linfonodi; residui mammari non invasivi consentiti) dall'American Joint Committee on Cancer (AJCC) criteri di stadiazione
dopo trattamento neoadiuvante e intervento chirurgico, fino a circa 27-30 settimane
Sopravvivenza libera da eventi (EFS)
Lasso di tempo: Fino a circa 60 mesi
L'EFS è definita come il tempo dall'inizio del trattamento neoadiuvante a uno qualsiasi dei seguenti eventi: progressione della malattia che preclude l'intervento chirurgico, recidiva locale o a distanza, secondo tumore maligno primario (mammella o altri tumori) o morte per qualsiasi causa
Fino a circa 60 mesi
Sopravvivenza globale (OS)
Lasso di tempo: Fino a circa 60 mesi
La OS è definita come il tempo che intercorre tra l'inizio del trattamento neoadiuvante e il decesso per qualsiasi causa
Fino a circa 60 mesi
Identificazione di biomarcatori per predire gli esiti clinici (pCR alla chirurgia definitiva, EFS, OS).
Lasso di tempo: Dopo che tutti i dati sono stati analizzati, fino a circa 60 mesi

I dati clinici (pCR alla chirurgia definitiva, EFS, OS) saranno integrati con i risultati della piattaforma multiomics e verranno esplorati modelli predittivi multivariati di risposta alla chemioterapia neoadiuvante (NACT) + inibitore del checkpoint immunitario (ICI). Precisamente, la piattaforma multiomics analizzerà:

  1. Sequenziamento dell'RNA del tumore iniziale e della malattia residua (se presente)
  2. analisi del microbioma della saliva e delle feci,
  3. analisi del DNA tumorale circolante (ctDNA) (pannello genico mirato e WGS poco profondo),
  4. Fenotipizzazione immunitaria tissutale,
  5. Sequenziamento e analisi del repertorio del recettore delle cellule T beta (TCR-β) utilizzando il kit ImmunoSeq hsTCRβ e immunoSEQ,
  6. Imaging RM mammario (prima e dopo NACT),

Algoritmi multipli tra cui Multiple Kernel Learning, Multi-Omics Factor Analysis (MOFA) e Method for the Functional Integration of Spatial and Temporal Omics data (MEFISTO) verranno quindi utilizzati per cercare un algoritmo predittivo integrativo che incorpori input multiparametrici.

Dopo che tutti i dati sono stati analizzati, fino a circa 60 mesi

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

13 gennaio 2023

Completamento primario (Stimato)

1 dicembre 2026

Completamento dello studio (Stimato)

1 dicembre 2029

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

8 maggio 2023

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

20 giugno 2023

Primo Inserito (Effettivo)

23 giugno 2023

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

23 giugno 2023

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

20 giugno 2023

Ultimo verificato

1 giugno 2023

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

INDECISO

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

prodotto fabbricato ed esportato dagli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

Prove cliniche su Cancro al seno triplo negativo

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