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Biomarcadores predictivos de respuesta a inhibidores de puntos de control en cáncer de mama triple negativo: una plataforma multiómica (PORTRAIT)

20 de junio de 2023 actualizado por: Vall d'Hebron Institute of Oncology

Identificación de biomarcadores predictivos de respuesta a quimioterapia e inhibidores de puntos de control inmunitarios en cáncer de mama triple negativo temprano: una plataforma multiómica integradora

Se incluirán pacientes con cáncer de mama triple negativo (TNBC) en estadio II-III candidatos a recibir quimioterapia neoadyuvante (NACT) +/- inhibidor del punto de control inmunitario (ICI). Se analizarán varias muestras de diferentes tejidos mediante diferentes ómicas para establecer biomarcadores predictivos de respuesta al tratamiento. Luego se utilizarán múltiples algoritmos para buscar un algoritmo predictivo integrador que incorpore entradas de parámetros múltiples para desarrollar una herramienta clínica que ayude a los médicos en el proceso de toma de decisiones de tratamiento en TNBC.

Descripción general del estudio

Descripción detallada

La combinación de pembrolizumab, un inhibidor del punto de control inmunitario (ICI), con quimioterapia neoadyuvante (NACT) aumenta la respuesta patológica completa (pCR) y la supervivencia libre de eventos (SSC) en pacientes con cáncer de mama temprano triple negativo (eTNBC). Sin embargo, no todos los pacientes se benefician por igual de un tratamiento que puede tener eventos adversos (EA) relevantes.

Objetivos: (1) Establecer biomarcadores predictivos de respuesta a NACT + ICI en eTNBC mediante la correlación de datos provenientes de diferentes capas de ómicas realizadas en diferentes tejidos, junto con imágenes, con pCR, EFS y supervivencia general (OS). (2) Integrar datos generados a partir de (1) y datos clínicos, y explorar modelos predictivos multivariados de respuesta a NACT + ICI.

Métodos: Se incluirán pacientes con TNBC estadio II-III candidatos a recibir NACT +/- ICI. Muestras recolectadas y tipo de análisis: (1) Tejido tumoral (línea de base y de enfermedad residual después de NACT): se realizará la secuenciación del genoma completo (WGS) y RNA-Seq (plataforma de secuenciación Hartwig y tubería analítica), fenotipado inmune del tejido (PD- linfocitos infiltrantes L1, T y B, entre otros), y análisis de microbioma (16S rRNA); (2) Sangre (antes y durante NACT): análisis de ADN tumoral circulante (ctDNA) (panel de genes dirigidos y WGS superficial), secuenciación y análisis del repertorio del receptor de células T beta (TCR-β) (kit ImmunoSeq hsTCRβ e inmunoSEQ), y fenotipado de células mononucleares de sangre periférica (PBMC); (3) Heces y saliva (antes y durante NACT): análisis de microbioma (16S rRNA); (4) Imágenes de resonancia magnética de mama (antes y después de NACT): análisis de radiómica. A continuación, se utilizarán varios algoritmos, incluidos el aprendizaje de múltiples núcleos, el análisis factorial multiómico (MOFA) y el método para la integración funcional de datos ómicos espaciales y temporales (MEFISTO), para buscar un algoritmo predictivo integrador que incorpore entradas de parámetros múltiples. El objetivo es proporcionar estimaciones más personalizadas de la eficacia del tratamiento y del riesgo de recaída.

Resultado esperado: Desarrollar una herramienta clínica para ayudar a los médicos en el proceso de toma de decisiones de tratamiento en eTNBC, para maximizar el beneficio y la calidad de vida del paciente, mientras se minimizan los EA y la carga financiera para el sistema de salud.

Tipo de estudio

De observación

Inscripción (Estimado)

100

Contactos y Ubicaciones

Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.

Ubicaciones de estudio

      • Barcelona, España, 08035
        • Reclutamiento
        • Vall d'Hebron Institute of Oncology
        • Contacto:
          • Mafalda Oliveira, MD PhD
          • Número de teléfono: +34932543450
          • Correo electrónico: moliveira@vhio.net

Criterios de participación

Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.

Criterio de elegibilidad

Edades elegibles para estudiar

  • Adulto
  • Adulto Mayor

Acepta Voluntarios Saludables

No

Método de muestreo

Muestra no probabilística

Población de estudio

Se incluirán pacientes con TNBC en estadio II-III candidatos a recibir NACT +/- ICI

Descripción

Criterios de inclusión:

  • TNBC documentado histológicamente (estado negativo del receptor 2 del factor de crecimiento epidérmico humano [HER2], receptor de estrógeno [ER] y receptor de progesterona [PgR])
  • Etapa 2 - 3 definida por los criterios de estadificación de la octava edición del Comité Conjunto Estadounidense del Cáncer (AJCC) para el cáncer de mama según lo evaluado por el investigador en función de la evaluación radiológica y/o clínica
  • El paciente es candidato para recibir NACT con o sin ICI según la evaluación del investigador
  • El paciente tiene ≥ 18 años en el momento del consentimiento para participar en este ensayo.

Criterio de exclusión:

  • Enfermedad metastásica en imágenes (etapa 4)

Plan de estudios

Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.

¿Cómo está diseñado el estudio?

Detalles de diseño

Cohortes e Intervenciones

Grupo / Cohorte
Intervención / Tratamiento
Cohorte A
Pembrolizumab + quimioterapia neoadyuvante
La secuenciación del genoma completo (WGS) se realizará en el tejido tumoral desde el inicio y desde la enfermedad residual después de la quimioterapia neoadyuvante (NACT), si está presente.
Otros nombres:
  • WGS
La secuenciación de ARN se realizará en tejido tumoral desde el inicio y desde la enfermedad residual después de NACT (si está presente).
El análisis del microbioma se realizará en heces y saliva antes, durante la NACT y al final de la terapia sistémica adyuvante si la terapia sistémica adyuvante está clínicamente indicada.
El análisis de ctDNA se realizará en plasma antes y durante la NACT.
La secuenciación del repertorio de TCR-β se realizará en plasma antes y durante la NACT.
El fenotipado de PBMC se realizará en plasma antes y durante la NACT.
Pembrolizumab se administrará en combinación con NACT estándar.
Se dará NACT estándar.
Otros nombres:
  • Carboplatino, taxano, antraciclina, ciclofosfamida
Cohorte B
Quimioterapia neoadyuvante
La secuenciación del genoma completo (WGS) se realizará en el tejido tumoral desde el inicio y desde la enfermedad residual después de la quimioterapia neoadyuvante (NACT), si está presente.
Otros nombres:
  • WGS
La secuenciación de ARN se realizará en tejido tumoral desde el inicio y desde la enfermedad residual después de NACT (si está presente).
El análisis del microbioma se realizará en heces y saliva antes, durante la NACT y al final de la terapia sistémica adyuvante si la terapia sistémica adyuvante está clínicamente indicada.
El análisis de ctDNA se realizará en plasma antes y durante la NACT.
La secuenciación del repertorio de TCR-β se realizará en plasma antes y durante la NACT.
El fenotipado de PBMC se realizará en plasma antes y durante la NACT.
Se dará NACT estándar.
Otros nombres:
  • Carboplatino, taxano, antraciclina, ciclofosfamida

¿Qué mide el estudio?

Medidas de resultado primarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Tasa de respuesta patológica completa (pCR) en la cirugía definitiva
Periodo de tiempo: después del tratamiento neoadyuvante y la cirugía, hasta aproximadamente 27-30 semanas
La tasa (expresada como porcentaje) de pacientes con PCR en la cirugía definitiva utilizando la definición de ypT0/Tis ypN0 (es decir, sin residuos invasivos en la mama o los ganglios; se permiten residuos no invasivos en la mama) del American Joint Committee on Cancer (AJCC) criterios de estadificación
después del tratamiento neoadyuvante y la cirugía, hasta aproximadamente 27-30 semanas
Supervivencia libre de eventos (EFS)
Periodo de tiempo: Hasta aproximadamente 60 meses
La SSC se define como el tiempo desde el inicio del tratamiento neoadyuvante hasta cualquiera de los siguientes eventos: progresión de la enfermedad que impide la cirugía, recurrencia local o a distancia, segunda neoplasia maligna primaria (cáncer de mama u otros) o muerte por cualquier causa
Hasta aproximadamente 60 meses
Supervivencia global (SG)
Periodo de tiempo: Hasta aproximadamente 60 meses
La SG se define como el tiempo desde el inicio del tratamiento neoadyuvante hasta el fallecimiento por cualquier causa
Hasta aproximadamente 60 meses
Identificación de biomarcadores para predecir resultados clínicos (pCR en cirugía definitiva, EFS, OS).
Periodo de tiempo: Después de analizar todos los datos, hasta aproximadamente 60 meses

Los datos clínicos (pCR en la cirugía definitiva, EFS, OS) se integrarán con los resultados de la plataforma multiómica y se explorarán modelos predictivos multivariados de respuesta a la quimioterapia neoadyuvante (NACT) + inhibidor del punto de control inmunitario (ICI). Precisamente, la plataforma multiómica analizará:

  1. Secuenciación de ARN del tumor inicial y enfermedad residual (si está presente)
  2. análisis del microbioma de la saliva y las heces,
  3. análisis de ADN tumoral circulante (ctDNA) (panel de genes dirigidos y WGS superficial),
  4. fenotipado inmune tisular,
  5. Secuenciación y análisis del repertorio del receptor de células T beta (TCR-β) con el kit ImmunoSeq hsTCRβ e immunoSEQ,
  6. Imágenes de resonancia magnética de mama (antes y después de NACT),

A continuación, se utilizarán varios algoritmos, incluidos el aprendizaje de múltiples núcleos, el análisis factorial multiómico (MOFA) y el método para la integración funcional de datos ómicos espaciales y temporales (MEFISTO), para buscar un algoritmo predictivo integrador que incorpore entradas de parámetros múltiples.

Después de analizar todos los datos, hasta aproximadamente 60 meses

Colaboradores e Investigadores

Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.

Fechas de registro del estudio

Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados ​​por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.

Fechas importantes del estudio

Inicio del estudio (Actual)

13 de enero de 2023

Finalización primaria (Estimado)

1 de diciembre de 2026

Finalización del estudio (Estimado)

1 de diciembre de 2029

Fechas de registro del estudio

Enviado por primera vez

8 de mayo de 2023

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

20 de junio de 2023

Publicado por primera vez (Actual)

23 de junio de 2023

Actualizaciones de registros de estudio

Última actualización publicada (Actual)

23 de junio de 2023

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

20 de junio de 2023

Última verificación

1 de junio de 2023

Más información

Términos relacionados con este estudio

Plan de datos de participantes individuales (IPD)

¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?

INDECISO

Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio

Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.

Sí

Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.

No

producto fabricado y exportado desde los EE. UU.

No

Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .

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